More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1246 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3684  nucleotidyl transferase  87.09 
 
 
457 aa  790    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000826363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1246  nucleotidyl transferase  100 
 
 
457 aa  912    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.300235  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  26.32 
 
 
400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  27.63 
 
 
402 aa  114  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  25.78 
 
 
400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  22.27 
 
 
411 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  24 
 
 
400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  26.19 
 
 
400 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  24.07 
 
 
397 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  21.62 
 
 
411 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  21.19 
 
 
414 aa  109  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  21.8 
 
 
411 aa  108  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  20.27 
 
 
411 aa  105  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  25.53 
 
 
399 aa  104  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  25.11 
 
 
400 aa  103  6e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  24.6 
 
 
399 aa  103  9e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  23.46 
 
 
403 aa  102  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  26.53 
 
 
402 aa  101  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  28.86 
 
 
397 aa  101  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  26.27 
 
 
393 aa  99.8  9e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  23.79 
 
 
396 aa  95.9  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  23.89 
 
 
401 aa  94.4  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  26.73 
 
 
393 aa  94  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.79 
 
 
349 aa  93.2  9e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  27.47 
 
 
391 aa  92.4  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  24.46 
 
 
403 aa  91.7  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  26.33 
 
 
393 aa  91.3  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25.07 
 
 
405 aa  90.9  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  27.15 
 
 
439 aa  90.5  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  26.91 
 
 
374 aa  87.8  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0068  nucleotidyl transferase  21.82 
 
 
404 aa  87  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0170821  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  24.53 
 
 
383 aa  85.5  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  28.52 
 
 
355 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  24.4 
 
 
384 aa  80.1  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  25.36 
 
 
384 aa  80.1  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.9 
 
 
355 aa  79.7  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  25.98 
 
 
393 aa  78.2  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  25.06 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  26.11 
 
 
392 aa  77  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.08 
 
 
355 aa  76.6  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  21.83 
 
 
393 aa  76.6  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  27.22 
 
 
397 aa  73.9  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2166  Nucleotidyl transferase  26.44 
 
 
387 aa  73.2  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.85 
 
 
355 aa  72.4  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  23.47 
 
 
388 aa  73.2  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  25.67 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  21.35 
 
 
393 aa  72  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  20 
 
 
393 aa  71.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.77 
 
 
357 aa  70.5  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1967  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  26.26 
 
 
481 aa  70.1  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  27.08 
 
 
355 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0827  nucleotidyl transferase  24.43 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.14 
 
 
355 aa  67.8  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.15 
 
 
357 aa  67.8  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  23.93 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0026  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  22.83 
 
 
461 aa  67  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2108  putative UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase  24.89 
 
 
230 aa  67  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.823728 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  21.88 
 
 
357 aa  66.6  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  23.48 
 
 
385 aa  65.9  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.84 
 
 
354 aa  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  27.1 
 
 
365 aa  66.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  24.49 
 
 
370 aa  66.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  25.5 
 
 
387 aa  65.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0047  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  21.43 
 
 
446 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.261602  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.08 
 
 
359 aa  64.7  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.73 
 
 
357 aa  64.3  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  23.05 
 
 
349 aa  64.7  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0814  transferase hexapeptide repeat containing protein  29.95 
 
 
269 aa  63.9  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.190345 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  24.93 
 
 
370 aa  63.9  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  24.09 
 
 
392 aa  63.5  0.000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.71 
 
 
355 aa  63.5  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  21.28 
 
 
776 aa  63.5  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1776  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  23 
 
 
451 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  26.07 
 
 
854 aa  63.2  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.44 
 
 
356 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.83 
 
 
353 aa  62.4  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  23.84 
 
 
840 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0639  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  20.85 
 
 
447 aa  61.6  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0152266  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.53 
 
 
349 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  25.71 
 
 
370 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  24.08 
 
 
347 aa  60.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  22.7 
 
 
376 aa  60.8  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  24.38 
 
 
843 aa  60.5  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.73 
 
 
355 aa  60.5  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0137  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  22.92 
 
 
451 aa  60.5  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00181473  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  22.7 
 
 
358 aa  60.1  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.99 
 
 
355 aa  60.1  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8608  Glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  26.96 
 
 
483 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.879169  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.24 
 
 
355 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.23 
 
 
355 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.47 
 
 
358 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.47 
 
 
358 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  23.4 
 
 
347 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74665  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (ATP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase) (GDP-mannose pyrophosphorylase) (CASRB1)  21.28 
 
 
362 aa  58.2  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0044  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  24.86 
 
 
459 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000298582  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  20.63 
 
 
405 aa  58.2  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2619  nucleotidyl transferase  22.44 
 
 
387 aa  57.8  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.45 
 
 
356 aa  57.8  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.85 
 
 
355 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0044  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  24.19 
 
 
459 aa  57  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.538697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>