More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3684 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1246  nucleotidyl transferase  87.09 
 
 		 457 aa  786    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.300235  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3684  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 457 aa  904    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000826363 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  23.15 
 
 		 411 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  23.18 
 
 		 411 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  22.96 
 
 		 411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  24.94 
 
 		 400 aa  116  7.999999999999999e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25.69 
 
 		 400 aa  116  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  25.11 
 
 		 400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  22.66 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  26.71 
 
 		 402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  24.94 
 
 		 400 aa  107  4e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  24.82 
 
 		 400 aa  106  9e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.09 
 
 		 397 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  26.26 
 
 		 402 aa  103  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  24.38 
 
 		 399 aa  103  6e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  20.81 
 
 		 411 aa  102  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  24.48 
 
 		 403 aa  100  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  23.09 
 
 		 403 aa  100  8e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  25.76 
 
 		 399 aa  99.4  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  23.79 
 
 		 396 aa  97.8  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  27.79 
 
 		 397 aa  97.8  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  22.53 
 
 		 401 aa  92.4  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.16 
 
 		 349 aa  92  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  25.69 
 
 		 393 aa  92  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25.15 
 
 		 405 aa  89.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0068  nucleotidyl transferase  23.29 
 
 		 404 aa  89.7  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0170821  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  24.73 
 
 		 383 aa  87.4  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  25.81 
 
 		 439 aa  85.9  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  25.52 
 
 		 393 aa  86.3  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  27.21 
 
 		 355 aa  83.2  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  26.09 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  25.07 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  27.8 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  25.45 
 
 		 392 aa  79  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  26.55 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  21.76 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  25.34 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  24.1 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  20.9 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  21.35 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  20.45 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  24.23 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  24.11 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.58 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0827  nucleotidyl transferase  27.2 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  22.82 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.02 
 
 		 357 aa  69.3  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  23.13 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2166  Nucleotidyl transferase  25.83 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.57 
 
 		 357 aa  68.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  20.83 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2108  putative UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase  24.46 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.823728 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  24.06 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  28.24 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  21.51 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.58 
 
 		 353 aa  66.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1776  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  22.46 
 
 		 451 aa  64.3  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  24.67 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  22.88 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.32 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.9 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0026  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  22.84 
 
 		 461 aa  63.5  0.000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  24.77 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.8 
 
 		 355 aa  63.2  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  23.16 
 
 		 392 aa  63.2  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  22.49 
 
 		 357 aa  62.8  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  33.58 
 
 		 248 aa  62.4  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  32.12 
 
 		 245 aa  62  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  23.36 
 
 		 349 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  22.96 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  24.07 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  22.98 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.16 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.76 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.17 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0814  transferase hexapeptide repeat containing protein  28.78 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.190345 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  24.38 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  24.02 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  26.39 
 
 		 854 aa  60.5  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1604  nucleotidyl transferase  23.42 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0798438  normal  0.128956 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  21.55 
 
 		 361 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0137  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  21.33 
 
 		 451 aa  59.7  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00181473  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  22.43 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  24.46 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  25 
 
 		 833 aa  58.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  23.69 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1679  nucleotidyl transferase  24.93 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  22.59 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  20.83 
 
 		 836 aa  57  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.47 
 
 		 356 aa  57  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.99 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  24.01 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  20.81 
 
 		 361 aa  56.6  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  24.58 
 
 		 366 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  22.62 
 
 		 357 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  21.33 
 
 		 776 aa  56.2  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.15 
 
 		 355 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74665  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (ATP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase) (GDP-mannose pyrophosphorylase) (CASRB1)  21.63 
 
 		 362 aa  56.2  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0047  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  24.85 
 
 		 459 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  22.82 
 
 		 370 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>