92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4379 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4379  acyl-carrier-protein  100 
 
 		 85 aa  168  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00582273  normal  0.0972461 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3922  acyl carrier protein  54.12 
 
 		 85 aa  92.8  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00792  acyl carrier protein  49.37 
 
 		 81 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3062  acyl carrier protein  46.84 
 
 		 83 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73924  normal  0.979198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0929  acyl carrier protein  46.84 
 
 		 83 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4763  acyl carrier protein  48.1 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3686  acyl carrier protein  48.1 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.630716 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2102  acyl carrier protein  48.1 
 
 		 83 aa  81.6  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.493775  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0692  acyl carrier protein  45.57 
 
 		 85 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0950683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0438  acyl carrier protein  48.19 
 
 		 84 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0351  acyl carrier protein  47.5 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5094  acyl carrier protein, putative  46.91 
 
 		 86 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4075  acyl carrier protein  43.04 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0436  acyl carrier protein  45.68 
 
 		 84 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3600  acyl carrier protein  43.04 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3380  acyl carrier protein  46.15 
 
 		 82 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3876  phosphopantetheine-binding  48.68 
 
 		 82 aa  74.7  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3887  acyl carrier protein  46.25 
 
 		 93 aa  73.9  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004065  acyl carrier protein  44.3 
 
 		 85 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4570  acyl carrier protein  44.3 
 
 		 82 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3889  acyl carrier protein  42.31 
 
 		 82 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4369  acyl carrier protein  44.87 
 
 		 82 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4801  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 83 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0343  acyl carrier protein  43.59 
 
 		 82 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.317237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0445  acyl carrier protein  40 
 
 		 82 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.377393  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3677  acyl carrier protein  43.59 
 
 		 82 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0913406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0349  acyl carrier protein  43.59 
 
 		 82 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0349  acyl carrier protein  42.31 
 
 		 82 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0346  acyl carrier protein  42.31 
 
 		 82 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0341  acyl carrier protein  42.31 
 
 		 82 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.667101  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0339  acyl carrier protein  41.03 
 
 		 82 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0324  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 82 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657258 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4597  acyl carrier protein  42.31 
 
 		 80 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178054 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0891  acyl carrier protein  41.98 
 
 		 83 aa  67.8  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.515732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3512  acyl carrier protein  42.31 
 
 		 82 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.126809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2174  putative diguanylate cyclase  40.26 
 
 		 81 aa  60.1  0.000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.377661  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0969  acyl carrier protein  40.26 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000264763  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0112  acyl carrier protein  43.06 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1489  phosphopantetheine-binding  49.4 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2212  acyl carrier protein  40.51 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.266286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0908  phosphopantetheine-binding protein  36.71 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1160  acyl carrier protein  35.62 
 
 		 84 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000195346  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1011  acyl carrier protein  35.06 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303772  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  36 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  36.99 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  33.77 
 
 		 85 aa  51.2  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  35.71 
 
 		 80 aa  50.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  33.77 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  35.06 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  33.77 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3483  acyl carrier protein  34.67 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.520778  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0944  acyl carrier protein  32 
 
 		 79 aa  48.9  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000174331  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  33.77 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  33.77 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  30.99 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  30.99 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  33.77 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  29.87 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3380  acyl carrier protein  34.72 
 
 		 79 aa  47  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0442067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0725  acyl carrier protein  32.88 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1345  acyl carrier protein  34.78 
 
 		 79 aa  47  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.095592  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4810  acyl carrier protein  33.78 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0303207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1325  acyl carrier protein  32.47 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1208  hypothetical protein  35.21 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000845225 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3622  acyl carrier protein  34.72 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000545579 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0466  acyl carrier protein  35.8 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0816145  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0990  acyl carrier protein  29.27 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.567267  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  26.03 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2207  acyl carrier protein  31.58 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000161202 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  31.08 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  31.08 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  29.33 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1082  acyl carrier protein  30.14 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.325179  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  30.14 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  31.08 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1996  hypothetical protein  32.88 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6811  phosphopantetheine-binding  31.94 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  29.49 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1361  acyl carrier protein  30.43 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000207547  normal  0.0506091 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17331  acyl carrier protein (ACP)  25.33 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2039  acyl carrier protein  29.17 
 
 		 80 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0051261  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1988  phosphopantetheine-binding  33.8 
 
 		 81 aa  41.6  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44915  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  31.94 
 
 		 80 aa  41.2  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7056  acyl carrier protein  28.57 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12010  acyl carrier protein  32.88 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114572  normal  0.0939277 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1633  acyl carrier protein  30.12 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  27.54 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1592  Acyl carrier protein  28.77 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0820426  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10270  acyl carrier protein  30.67 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.167244 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  27.27 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2468  acyl carrier protein  30.26 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000407512  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1634  phosphopantetheine-binding  30.56 
 
 		 90 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>