More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3380 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3380  acyl carrier protein  100 
 
 		 79 aa  154  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0442067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3622  acyl carrier protein  98.73 
 
 		 79 aa  152  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000545579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4810  acyl carrier protein  78.67 
 
 		 82 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0303207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0876  acyl carrier protein  76 
 
 		 84 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  75 
 
 		 82 aa  111  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3483  acyl carrier protein  75 
 
 		 82 aa  111  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.520778  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2039  acyl carrier protein  67.95 
 
 		 80 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0051261  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10270  acyl carrier protein  71.23 
 
 		 81 aa  105  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.167244 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3512  acyl carrier protein  69.86 
 
 		 79 aa  104  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410127  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1325  acyl carrier protein  63.29 
 
 		 79 aa  103  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1988  phosphopantetheine-binding  72 
 
 		 81 aa  103  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44915  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6811  phosphopantetheine-binding  69.74 
 
 		 82 aa  100  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  61.33 
 
 		 99 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  60 
 
 		 99 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  60 
 
 		 97 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  58.67 
 
 		 101 aa  95.9  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  60 
 
 		 97 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  60 
 
 		 97 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2207  acyl carrier protein  63.51 
 
 		 81 aa  94.4  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000161202 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  55.7 
 
 		 87 aa  94  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  57.33 
 
 		 101 aa  93.6  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16760  acyl carrier protein  65.33 
 
 		 82 aa  93.6  8e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00765703  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1975  acyl carrier protein  59.72 
 
 		 79 aa  92  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.166506  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2468  acyl carrier protein  62.16 
 
 		 81 aa  90.9  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000407512  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3345  acyl carrier protein  63.38 
 
 		 81 aa  90.5  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0503244  normal  0.362492 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09300  acyl carrier protein  60 
 
 		 81 aa  90.1  8e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421361  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  52.63 
 
 		 84 aa  88.6  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  54.67 
 
 		 80 aa  88.6  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2152  phosphopantetheine-binding protein  60.81 
 
 		 82 aa  87.8  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14090  acyl carrier protein  59.46 
 
 		 82 aa  86.3  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.025354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1805  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 82 aa  85.1  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200029  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2137  phosphopantetheine-binding protein  58.67 
 
 		 82 aa  84.3  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7056  acyl carrier protein  47.37 
 
 		 79 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12010  acyl carrier protein  52.7 
 
 		 82 aa  77.4  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114572  normal  0.0939277 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  56.67 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1517  phosphopantetheine-binding  50 
 
 		 82 aa  71.2  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259778  normal  0.0737426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1634  phosphopantetheine-binding  42.11 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4861  phosphopantetheine-binding  46.25 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.830038  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5650  acyl carrier protein  45.59 
 
 		 80 aa  65.1  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.611546  normal  0.225397 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  50.75 
 
 		 78 aa  64.7  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  44 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  44 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  44 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_002620  TC0507  acyl carrier protein  45 
 
 		 77 aa  63.9  0.0000000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0583644  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  51.47 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  51.47 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  51.47 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  45.33 
 
 		 79 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0284  acyl carrier protein  39.24 
 
 		 82 aa  63.5  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2468  acyl carrier protein  45.33 
 
 		 79 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2301  acyl carrier protein  45.33 
 
 		 79 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0385608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0746  acyl carrier protein  56.9 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.746533  normal  0.50277 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1530  acyl carrier protein  56.9 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129893  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  49.33 
 
 		 73 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  53.85 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  50 
 
 		 77 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  42.31 
 
 		 80 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  51.52 
 
 		 78 aa  63.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  51.72 
 
 		 74 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04410  acyl carrier protein (acp), putative  40 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  39.74 
 
 		 82 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  50 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  36.71 
 
 		 85 aa  62  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1687  acyl carrier protein  44 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1836  acyl carrier protein  49.18 
 
 		 76 aa  61.2  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000576824  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3483  acyl carrier protein  44 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.057924  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2978  acyl carrier protein  44 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.702686  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  41.33 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  46.88 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3132  acyl carrier protein  42.67 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  39.74 
 
 		 82 aa  60.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2352  acyl carrier protein  44 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3819  acyl carrier protein  44 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542696  normal  0.0672791 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  41.43 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  45.07 
 
 		 80 aa  60.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1201  acyl carrier protein  55.17 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.576937  hitchhiker  0.00368899 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1058  acyl carrier protein  55.17 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  47.06 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3358  acyl carrier protein  44 
 
 		 79 aa  60.5  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.304425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2736  acyl carrier protein  44 
 
 		 80 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.875192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  45.71 
 
 		 79 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  45.71 
 
 		 79 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1011  acyl carrier protein  42.67 
 
 		 85 aa  60.1  0.000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303772  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  45.71 
 
 		 79 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  43.42 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0752  acyl carrier protein  40.54 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103187  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  45.07 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  45.07 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2565  acyl carrier protein  47.62 
 
 		 78 aa  60.1  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  47.14 
 
 		 78 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  45.07 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1610  Acyl carrier protein (ACP)  46.03 
 
 		 90 aa  59.7  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5387  acyl carrier protein  45.21 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  42.67 
 
 		 78 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  49.23 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  42.67 
 
 		 78 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  47.06 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  41.56 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  41.56 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  42.11 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>