More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2951 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  100 
 
 
80 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  80 
 
 
87 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1975  acyl carrier protein  85.53 
 
 
79 aa  128  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.166506  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  81.58 
 
 
84 aa  124  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7056  acyl carrier protein  80.26 
 
 
79 aa  121  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  68.42 
 
 
99 aa  106  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1325  acyl carrier protein  68.92 
 
 
79 aa  106  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  68.42 
 
 
97 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  68.42 
 
 
97 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  68.42 
 
 
97 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  68.42 
 
 
99 aa  104  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2039  acyl carrier protein  62.67 
 
 
80 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0051261  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10270  acyl carrier protein  67.61 
 
 
81 aa  99.4  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.167244 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  61.84 
 
 
101 aa  98.2  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  61.84 
 
 
101 aa  98.2  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0876  acyl carrier protein  59.21 
 
 
84 aa  97.8  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3483  acyl carrier protein  56.58 
 
 
82 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.520778  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  55.26 
 
 
82 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3512  acyl carrier protein  58.11 
 
 
79 aa  94  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410127  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4810  acyl carrier protein  55.84 
 
 
82 aa  93.2  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0303207  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09300  acyl carrier protein  59.46 
 
 
81 aa  92.4  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6811  phosphopantetheine-binding  57.89 
 
 
82 aa  92.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1988  phosphopantetheine-binding  57.89 
 
 
81 aa  91.7  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44915  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3380  acyl carrier protein  54.67 
 
 
79 aa  88.6  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0442067  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14090  acyl carrier protein  58.67 
 
 
82 aa  87.8  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.025354  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3622  acyl carrier protein  54.67 
 
 
79 aa  87.8  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000545579 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  67.21 
 
 
115 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2152  phosphopantetheine-binding protein  56 
 
 
82 aa  85.1  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1517  phosphopantetheine-binding  54.67 
 
 
82 aa  82  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259778  normal  0.0737426 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3345  acyl carrier protein  53.95 
 
 
81 aa  82.8  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0503244  normal  0.362492 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1805  acyl carrier protein  56 
 
 
82 aa  81.6  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200029  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12010  acyl carrier protein  50.65 
 
 
82 aa  81.6  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114572  normal  0.0939277 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2468  acyl carrier protein  52.63 
 
 
81 aa  81.3  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000407512  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2207  acyl carrier protein  54.05 
 
 
81 aa  80.5  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000161202 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16760  acyl carrier protein  51.32 
 
 
82 aa  79.7  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00765703  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2137  phosphopantetheine-binding protein  55.41 
 
 
82 aa  77.4  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4861  phosphopantetheine-binding  40.26 
 
 
85 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.830038  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1634  phosphopantetheine-binding  40.91 
 
 
90 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  44.59 
 
 
79 aa  65.1  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  42.25 
 
 
78 aa  64.7  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  41.89 
 
 
79 aa  64.7  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  48.44 
 
 
78 aa  64.3  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  43.66 
 
 
77 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  48.44 
 
 
78 aa  63.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  46.15 
 
 
77 aa  62  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  45.07 
 
 
77 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  38.89 
 
 
81 aa  62  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3358  acyl carrier protein  43.84 
 
 
79 aa  61.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.304425  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  39.19 
 
 
81 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  49.21 
 
 
78 aa  61.6  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  45.07 
 
 
73 aa  60.8  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  46.15 
 
 
79 aa  60.5  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0417  acyl carrier protein  46.88 
 
 
77 aa  60.5  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  43.06 
 
 
80 aa  60.5  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  36 
 
 
82 aa  60.5  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  38.36 
 
 
82 aa  60.1  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  48.39 
 
 
79 aa  60.1  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1011  acyl carrier protein  39.47 
 
 
85 aa  60.1  0.000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303772  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1610  Acyl carrier protein (ACP)  40.85 
 
 
90 aa  60.1  0.000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  48.39 
 
 
79 aa  60.5  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  48.39 
 
 
79 aa  60.5  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  42.65 
 
 
77 aa  60.1  0.000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  48.39 
 
 
79 aa  60.5  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  48.39 
 
 
79 aa  60.5  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  46.15 
 
 
78 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  44.44 
 
 
79 aa  59.3  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  46.03 
 
 
79 aa  59.3  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  44.44 
 
 
79 aa  59.3  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  46.88 
 
 
74 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  45.31 
 
 
81 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  44.44 
 
 
79 aa  59.3  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  46.15 
 
 
78 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  46.97 
 
 
78 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5650  acyl carrier protein  39.24 
 
 
80 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.611546  normal  0.225397 
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  46.97 
 
 
78 aa  59.3  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3249  acyl carrier protein  48.39 
 
 
79 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124771  normal  0.0273605 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  46.77 
 
 
79 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  45.45 
 
 
78 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  46.97 
 
 
78 aa  59.3  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  43.94 
 
 
78 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  39.71 
 
 
82 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0498  acyl carrier protein  43.42 
 
 
78 aa  58.5  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  42.86 
 
 
77 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  47.69 
 
 
74 aa  58.2  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  40.85 
 
 
78 aa  57.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  40.85 
 
 
78 aa  57.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  40.54 
 
 
79 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0608  acyl carrier protein  46.77 
 
 
79 aa  57.4  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000394559 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1530  acyl carrier protein  41.89 
 
 
78 aa  57.8  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129893  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2397  acyl carrier protein  37.5 
 
 
84 aa  57.4  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.774036  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  35.9 
 
 
85 aa  57.4  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18181  acyl carrier protein  40.54 
 
 
79 aa  57  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  39.73 
 
 
77 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  43.08 
 
 
77 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  43.08 
 
 
77 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  40.54 
 
 
78 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  36.99 
 
 
78 aa  57.4  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  40.54 
 
 
78 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  40.54 
 
 
78 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3132  acyl carrier protein  40.54 
 
 
78 aa  57.4  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>