94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1996 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1996  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  171  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1856  phosphopantetheine-binding protein  51.9 
 
 		 85 aa  81.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03900  acyl carrier protein  48.1 
 
 		 80 aa  78.2  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.486098  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0550  hypothetical protein  49.37 
 
 		 82 aa  77.4  0.00000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.324262  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1105  hypothetical protein  54.43 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00792  acyl carrier protein  36.25 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4075  acyl carrier protein  35 
 
 		 82 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3600  acyl carrier protein  35 
 
 		 82 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3062  acyl carrier protein  36.25 
 
 		 83 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73924  normal  0.979198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0929  acyl carrier protein  36.25 
 
 		 83 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  33.75 
 
 		 80 aa  52.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  33.75 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  33.75 
 
 		 103 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4597  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178054 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0692  acyl carrier protein  35.53 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0950683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0908  phosphopantetheine-binding protein  36.84 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  30.77 
 
 		 80 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  30.77 
 
 		 80 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  32.5 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3922  acyl carrier protein  36.25 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3512  acyl carrier protein  40.3 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.126809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2152  phosphopantetheine-binding protein  30.38 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  35.44 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  35.44 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0112  acyl carrier protein  35.06 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3677  acyl carrier protein  35.14 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0913406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3876  phosphopantetheine-binding  40.26 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0349  acyl carrier protein  35.14 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3889  acyl carrier protein  39.19 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2174  putative diguanylate cyclase  35.44 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.377661  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0847  acyl carrier protein  41.38 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0445  acyl carrier protein  34.72 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.377393  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0855  acyl carrier protein  41.38 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4570  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4369  acyl carrier protein  33.78 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0969  acyl carrier protein  34.18 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000264763  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  28.57 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1320  acyl carrier protein  38.71 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0339  acyl carrier protein  32.43 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0324  acyl carrier protein  39.13 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657258 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17331  acyl carrier protein (ACP)  32.05 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  29.49 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4067  acyl carrier protein  30.26 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0349  acyl carrier protein  32.43 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  35.29 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0346  acyl carrier protein  32.43 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1769  acyl carrier protein  31.43 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0117852 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0341  acyl carrier protein  32.43 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.667101  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2371  acyl carrier protein  37.1 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.131392  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3460  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712705 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2029  acyl carrier protein  39.66 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0310  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00336649  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1741  acyl carrier protein  39.66 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463216  normal  0.237762 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4801  acyl carrier protein  34.72 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  32.43 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2117  acyl carrier protein  39.66 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.307838  hitchhiker  0.00250783 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2359  acyl carrier protein  39.66 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.701799  normal  0.0109662 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0343  acyl carrier protein  33.78 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.317237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0891  acyl carrier protein  38.57 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.515732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3380  acyl carrier protein  34.72 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  30.14 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3887  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  36.99 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  32 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0621  acyl carrier protein  39.66 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0305053  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  30.88 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4379  acyl-carrier-protein  32.88 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00582273  normal  0.0972461 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0752  acyl carrier protein  29.17 
 
 		 79 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103187  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2102  acyl carrier protein  38.67 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.493775  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  27.85 
 
 		 82 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3647  acyl carrier protein  30.86 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0284  acyl carrier protein  31.51 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  28.95 
 
 		 99 aa  41.2  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  27.85 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  28.75 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  27.85 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  27.85 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4810  acyl carrier protein  32.89 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0303207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3345  acyl carrier protein  28.57 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0503244  normal  0.362492 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18011  acyl carrier protein  28 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18181  acyl carrier protein  28 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  30.77 
 
 		 74 aa  40.8  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  26.58 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3686  acyl carrier protein  31.25 
 
 		 81 aa  40  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.630716 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  28 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4763  acyl carrier protein  31.25 
 
 		 81 aa  40  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2090  acyl carrier protein  37.5 
 
 		 93 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2111  acyl carrier protein  37.5 
 
 		 93 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144779  normal  0.165327 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3353  acyl carrier protein  37.5 
 
 		 93 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.53669  normal  0.0790473 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  32.89 
 
 		 79 aa  40  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1506  acyl carrier protein  37.5 
 
 		 93 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41568  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5019  acyl carrier protein  30.14 
 
 		 102 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256894  normal  0.657506 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1246  acyl carrier protein  37.5 
 
 		 93 aa  40  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.15129  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>