85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3876 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3876  phosphopantetheine-binding  100 
 
 
82 aa  160  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4801  acyl carrier protein  58.44 
 
 
83 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3887  acyl carrier protein  59.46 
 
 
93 aa  97.4  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0891  acyl carrier protein  61.04 
 
 
83 aa  97.4  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.515732  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4570  acyl carrier protein  61.33 
 
 
82 aa  97.4  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4597  acyl carrier protein  56.58 
 
 
80 aa  94.7  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000178054 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2102  acyl carrier protein  60.98 
 
 
83 aa  93.2  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.493775  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004065  acyl carrier protein  58.54 
 
 
85 aa  92.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3512  acyl carrier protein  53.95 
 
 
82 aa  92  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.126809  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0692  acyl carrier protein  47.56 
 
 
85 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0950683  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0324  acyl carrier protein  55.26 
 
 
82 aa  91.3  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657258 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3380  acyl carrier protein  58.67 
 
 
82 aa  90.5  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0349  acyl carrier protein  56 
 
 
82 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3677  acyl carrier protein  56 
 
 
82 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0913406  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0929  acyl carrier protein  50 
 
 
83 aa  88.2  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3062  acyl carrier protein  50 
 
 
83 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73924  normal  0.979198 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0351  acyl carrier protein  56.58 
 
 
82 aa  88.6  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0339  acyl carrier protein  54.67 
 
 
82 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4075  acyl carrier protein  47.44 
 
 
82 aa  87.8  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3600  acyl carrier protein  47.44 
 
 
82 aa  87.8  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3889  acyl carrier protein  53.95 
 
 
82 aa  87.4  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4369  acyl carrier protein  54.67 
 
 
82 aa  87.4  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0346  acyl carrier protein  53.33 
 
 
82 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0341  acyl carrier protein  53.33 
 
 
82 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.667101  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0349  acyl carrier protein  53.33 
 
 
82 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0343  acyl carrier protein  54.67 
 
 
82 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.317237  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00792  acyl carrier protein  48.68 
 
 
81 aa  85.5  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0445  acyl carrier protein  50.67 
 
 
82 aa  85.5  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.377393  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0112  acyl carrier protein  53.33 
 
 
82 aa  85.5  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0436  acyl carrier protein  56.58 
 
 
84 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4763  acyl carrier protein  47.44 
 
 
81 aa  84  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065062  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3686  acyl carrier protein  47.44 
 
 
81 aa  84  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.630716 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5094  acyl carrier protein, putative  55.26 
 
 
86 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3922  acyl carrier protein  50.67 
 
 
85 aa  82.8  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0438  acyl carrier protein  58.11 
 
 
84 aa  80.5  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2174  putative diguanylate cyclase  48 
 
 
81 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.377661  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0969  acyl carrier protein  46.75 
 
 
84 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000264763  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4379  acyl-carrier-protein  48.68 
 
 
85 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00582273  normal  0.0972461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1856  phosphopantetheine-binding protein  43.28 
 
 
85 aa  57.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0908  phosphopantetheine-binding protein  40.58 
 
 
88 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  38.16 
 
 
78 aa  54.7  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1489  phosphopantetheine-binding  47.37 
 
 
83 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  31.25 
 
 
99 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  31.25 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  31.25 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  31.25 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  31.25 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  33.33 
 
 
74 aa  48.5  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1160  acyl carrier protein  41.18 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000195346  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03900  acyl carrier protein  38.36 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.486098  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1105  hypothetical protein  40.32 
 
 
84 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1996  hypothetical protein  40.26 
 
 
88 aa  47  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889305  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1537  phosphopantetheine-binding  36.49 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.157391  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0550  hypothetical protein  35.62 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.324262  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  29.27 
 
 
101 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  36.23 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7056  acyl carrier protein  31.88 
 
 
79 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18011  acyl carrier protein  32.89 
 
 
79 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18181  acyl carrier protein  32.89 
 
 
79 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  32 
 
 
81 aa  43.9  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  32 
 
 
81 aa  43.9  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  32.89 
 
 
79 aa  43.5  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0883  acyl carrier protein  35.71 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242851  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  41.82 
 
 
115 aa  42.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  33.8 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  33.33 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  28 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  33.33 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  32.05 
 
 
103 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  27.5 
 
 
101 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2565  acyl carrier protein  32.39 
 
 
78 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4067  acyl carrier protein  34.33 
 
 
82 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0944  acyl carrier protein  33.33 
 
 
79 aa  42  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000174331  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2039  acyl carrier protein  29.73 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0051261  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  32.84 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1320  acyl carrier protein  37.84 
 
 
94 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  32.39 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  28.38 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0230  acyl carrier protein  33.78 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  28.99 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  27.63 
 
 
82 aa  40.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0225  acyl carrier protein  33.33 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.623939  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0621  acyl carrier protein  35.62 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0305053  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2178  phosphopantetheine-binding protein  30.38 
 
 
81 aa  40.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.510535  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1769  acyl carrier protein  30.65 
 
 
82 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0117852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>