More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0267 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  100 
 
 
81 aa  150  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  100 
 
 
81 aa  150  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  58.11 
 
 
77 aa  88.2  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5148  acyl carrier protein  58.67 
 
 
79 aa  87.8  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.166001 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  56.25 
 
 
80 aa  87.8  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1398  acyl carrier protein  56 
 
 
78 aa  87.8  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  58.9 
 
 
73 aa  87.4  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  54.32 
 
 
82 aa  86.3  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0310  acyl carrier protein  57.33 
 
 
76 aa  85.9  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00336649  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4192  acyl carrier protein  56.76 
 
 
78 aa  85.5  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  0.675617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  53.33 
 
 
82 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  55.41 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  59.21 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  54.79 
 
 
77 aa  84.7  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1345  acyl carrier protein  55.26 
 
 
79 aa  84.7  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.095592  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  60.81 
 
 
79 aa  84.3  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  58.9 
 
 
78 aa  82.4  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  52.05 
 
 
74 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  59.72 
 
 
78 aa  82.4  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  61.11 
 
 
78 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0883  acyl carrier protein  59.74 
 
 
82 aa  82.4  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242851  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  63.77 
 
 
78 aa  82.4  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  55.71 
 
 
75 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  47.44 
 
 
82 aa  82  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0363  acyl carrier protein  54.05 
 
 
78 aa  82.8  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.878931  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  48.05 
 
 
83 aa  82  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  50.67 
 
 
82 aa  82  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  56 
 
 
77 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  59.46 
 
 
79 aa  81.6  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1319  acyl carrier protein  55.56 
 
 
78 aa  81.3  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.346066  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  60.53 
 
 
77 aa  81.3  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  52.56 
 
 
81 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3914  acyl carrier protein  54.05 
 
 
78 aa  80.9  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  50 
 
 
77 aa  81.3  0.000000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1137  acyl carrier protein  54.79 
 
 
78 aa  80.9  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  54.79 
 
 
74 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  59.15 
 
 
77 aa  80.5  0.000000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1011  acyl carrier protein  54.43 
 
 
85 aa  80.5  0.000000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303772  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1361  acyl carrier protein  55.56 
 
 
76 aa  80.5  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000207547  normal  0.0506091 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03150  acyl carrier protein  53.42 
 
 
77 aa  79.7  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1602  acyl carrier protein  58.21 
 
 
77 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000714682  normal  0.960802 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  54.29 
 
 
75 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  60.53 
 
 
81 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  56.16 
 
 
79 aa  80.1  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  56.52 
 
 
79 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  57.75 
 
 
77 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  56.52 
 
 
79 aa  79  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0944  acyl carrier protein  55.41 
 
 
79 aa  79  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000174331  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  56.52 
 
 
79 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  52.05 
 
 
81 aa  79  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  57.75 
 
 
77 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  56.52 
 
 
79 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  53.95 
 
 
78 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  53.95 
 
 
78 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0166  acyl carrier protein  54.55 
 
 
78 aa  77.8  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.317698  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  56.94 
 
 
77 aa  78.2  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1878  acyl carrier protein  56.72 
 
 
77 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0843624  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0975  acyl carrier protein  55.56 
 
 
80 aa  77.8  0.00000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.553759  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3105  acyl carrier protein  53.95 
 
 
77 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000128081  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1537  phosphopantetheine-binding  50.65 
 
 
84 aa  77.8  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.157391  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  55.71 
 
 
77 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1157  acyl carrier protein  53.95 
 
 
77 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.917954 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  60.87 
 
 
78 aa  77.4  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  55.71 
 
 
77 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  60.87 
 
 
78 aa  77.4  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  55.07 
 
 
79 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  60.87 
 
 
78 aa  77.4  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0713  acyl carrier protein  53.75 
 
 
78 aa  77.4  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000031745  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1082  acyl carrier protein  52 
 
 
78 aa  77  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.325179  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3249  acyl carrier protein  55.07 
 
 
79 aa  76.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124771  normal  0.0273605 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  53.42 
 
 
78 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  53.42 
 
 
78 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  57.14 
 
 
77 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  53.42 
 
 
78 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  57.14 
 
 
77 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0417  acyl carrier protein  57.14 
 
 
77 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  55.07 
 
 
79 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  57.14 
 
 
77 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  55.07 
 
 
79 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1580  acyl carrier protein  53.95 
 
 
84 aa  75.5  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000805484  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2397  acyl carrier protein  44.3 
 
 
84 aa  75.5  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.774036  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  54.79 
 
 
79 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  58.21 
 
 
77 aa  75.5  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  53.09 
 
 
79 aa  75.9  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0284  acyl carrier protein  51.95 
 
 
82 aa  75.9  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6611  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  56.52 
 
 
74 aa  75.9  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3892  acyl carrier protein  51.35 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3701  acyl carrier protein  51.35 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3591  acyl carrier protein  51.35 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3609  acyl carrier protein  51.35 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3788  acyl carrier protein  48.24 
 
 
87 aa  75.1  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155338  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3898  acyl carrier protein  51.35 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000161668  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3949  acyl carrier protein  51.35 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.457007  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3988  acyl carrier protein  51.35 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.168963  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2502  acyl carrier protein  51.35 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000438987  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  53.95 
 
 
84 aa  75.5  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1294  acyl carrier protein  51.35 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0897377  hitchhiker  0.00000000000000136256 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3864  acyl carrier protein  51.35 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3997e-48 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1873  acyl carrier protein  49.33 
 
 
78 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107725  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  54.29 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>