More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0773 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  100 
 
 
85 aa  168  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1160  acyl carrier protein  63.51 
 
 
84 aa  100  8e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000195346  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0538  acyl carrier protein  60 
 
 
82 aa  96.7  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.633941  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  48.75 
 
 
81 aa  87.4  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  54.67 
 
 
78 aa  87  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  56.16 
 
 
77 aa  87  8e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  54.79 
 
 
77 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  54.79 
 
 
77 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  48.75 
 
 
80 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  48.75 
 
 
80 aa  83.6  9e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  48.75 
 
 
80 aa  83.6  9e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  49.37 
 
 
80 aa  82.8  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  49.37 
 
 
80 aa  83.2  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0451  Acyl carrier protein  51.25 
 
 
84 aa  82  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1345  acyl carrier protein  50 
 
 
79 aa  82  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.095592  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3647  acyl carrier protein  51.9 
 
 
84 aa  80.9  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742845  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0196  acyl carrier protein  48.1 
 
 
79 aa  79.7  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18011  acyl carrier protein  48.05 
 
 
79 aa  79.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  52.7 
 
 
75 aa  80.1  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18181  acyl carrier protein  48.05 
 
 
79 aa  79.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  46.84 
 
 
103 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17331  acyl carrier protein (ACP)  47.5 
 
 
80 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  48.68 
 
 
82 aa  79  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  48.05 
 
 
79 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0949  acyl carrier protein  53.42 
 
 
79 aa  79.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000253013  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0166  acyl carrier protein  48 
 
 
78 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.317698  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0284  acyl carrier protein  41.25 
 
 
82 aa  78.2  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6611  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  47.44 
 
 
80 aa  77.8  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  51.35 
 
 
74 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1181  acyl carrier protein  51.35 
 
 
76 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185913  decreased coverage  0.00116588 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1661  acyl carrier protein  48.1 
 
 
79 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  49.33 
 
 
81 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1082  acyl carrier protein  47.95 
 
 
78 aa  77  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.325179  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1633  acyl carrier protein  46.15 
 
 
83 aa  76.6  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  47.95 
 
 
80 aa  75.9  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0452  acyl carrier protein  46.15 
 
 
88 aa  75.9  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0130  acyl carrier protein  48 
 
 
78 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0263096  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  42.31 
 
 
82 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  44.74 
 
 
83 aa  74.7  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  43.42 
 
 
78 aa  74.3  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  46.05 
 
 
81 aa  74.3  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  44.59 
 
 
78 aa  74.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  44.59 
 
 
78 aa  74.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2493  acyl carrier protein  46.67 
 
 
78 aa  74.3  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1361  acyl carrier protein  45.21 
 
 
76 aa  73.6  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000207547  normal  0.0506091 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0179  acyl carrier protein  46.67 
 
 
78 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00024894  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  46.58 
 
 
77 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3249  acyl carrier protein  47.89 
 
 
79 aa  72.8  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124771  normal  0.0273605 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  47.89 
 
 
79 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2565  acyl carrier protein  48.61 
 
 
78 aa  73.6  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  42.31 
 
 
82 aa  72.8  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  47.89 
 
 
79 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  47.3 
 
 
77 aa  72  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  44.59 
 
 
74 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4067  acyl carrier protein  47.22 
 
 
82 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1548  Acyl carrier protein (ACP)  44.44 
 
 
77 aa  72.4  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.079585  normal  0.066745 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  43.84 
 
 
77 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  44.16 
 
 
81 aa  72.4  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  47.89 
 
 
79 aa  72.8  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  44.16 
 
 
81 aa  72.4  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  47.89 
 
 
79 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  47.89 
 
 
79 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  47.22 
 
 
78 aa  72  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0436  acyl carrier protein  46.58 
 
 
76 aa  71.6  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.20002  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1398  acyl carrier protein  41.89 
 
 
78 aa  72  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  46.48 
 
 
79 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3949  acyl carrier protein  45.21 
 
 
77 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.457007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3898  acyl carrier protein  45.21 
 
 
77 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000161668  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3892  acyl carrier protein  45.21 
 
 
77 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3864  acyl carrier protein  45.21 
 
 
77 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3997e-48 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3701  acyl carrier protein  45.21 
 
 
77 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3591  acyl carrier protein  45.21 
 
 
77 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3609  acyl carrier protein  45.21 
 
 
77 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3988  acyl carrier protein  45.21 
 
 
77 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.168963  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2502  acyl carrier protein  45.21 
 
 
77 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000438987  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5148  acyl carrier protein  43.84 
 
 
79 aa  71.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.166001 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  45.83 
 
 
78 aa  71.2  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  49.28 
 
 
78 aa  71.6  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1294  acyl carrier protein  45.21 
 
 
77 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0897377  hitchhiker  0.00000000000000136256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3914  acyl carrier protein  45.07 
 
 
78 aa  71.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0752  acyl carrier protein  47.14 
 
 
79 aa  70.9  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103187  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0174  acyl carrier protein  44.3 
 
 
80 aa  70.9  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  45.21 
 
 
77 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  43.84 
 
 
77 aa  71.2  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  45.21 
 
 
79 aa  70.9  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  45.83 
 
 
79 aa  70.9  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3673  acyl carrier protein  43.84 
 
 
77 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173328  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  42.67 
 
 
78 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  43.84 
 
 
78 aa  70.5  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  44 
 
 
79 aa  70.5  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  45.21 
 
 
75 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2553  acyl carrier protein  45.07 
 
 
78 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526358  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  43.24 
 
 
78 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1310  acyl carrier protein  45.07 
 
 
78 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000174722  decreased coverage  4.37915e-18 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2230  acyl carrier protein  45.07 
 
 
78 aa  70.5  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.78439e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1295  acyl carrier protein  45.07 
 
 
78 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000656136  decreased coverage  3.5580799999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1266  acyl carrier protein  45.07 
 
 
78 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000383773  normal  0.0632427 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1990  acyl carrier protein  45.07 
 
 
78 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274294  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2173  acyl carrier protein  45.07 
 
 
78 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000401427  hitchhiker  0.000000000000202194 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2507  acyl carrier protein  45.07 
 
 
78 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996587  hitchhiker  0.000000169384 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>