More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2039 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2039  acyl carrier protein  100 
 
 
80 aa  154  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0051261  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1325  acyl carrier protein  85.33 
 
 
79 aa  126  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10270  acyl carrier protein  81.01 
 
 
81 aa  121  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.167244 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3512  acyl carrier protein  70.51 
 
 
79 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410127  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  72 
 
 
97 aa  113  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  72 
 
 
97 aa  113  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  72 
 
 
97 aa  113  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  70.67 
 
 
99 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  69.33 
 
 
101 aa  111  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  70.67 
 
 
99 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3483  acyl carrier protein  71.05 
 
 
82 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.520778  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3380  acyl carrier protein  67.95 
 
 
79 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0442067  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  69.74 
 
 
82 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  65.79 
 
 
87 aa  108  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3622  acyl carrier protein  67.95 
 
 
79 aa  108  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000545579 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0876  acyl carrier protein  66.67 
 
 
84 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  62.82 
 
 
84 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  66.67 
 
 
101 aa  106  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6811  phosphopantetheine-binding  65 
 
 
82 aa  104  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  62.67 
 
 
80 aa  102  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4810  acyl carrier protein  66.67 
 
 
82 aa  101  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0303207  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1975  acyl carrier protein  65.33 
 
 
79 aa  101  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.166506  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1988  phosphopantetheine-binding  68 
 
 
81 aa  99.8  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44915  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2468  acyl carrier protein  63.51 
 
 
81 aa  97.4  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000407512  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2207  acyl carrier protein  63.51 
 
 
81 aa  97.1  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000161202 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3345  acyl carrier protein  64.86 
 
 
81 aa  97.1  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0503244  normal  0.362492 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14090  acyl carrier protein  64.86 
 
 
82 aa  96.3  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.025354  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09300  acyl carrier protein  60.76 
 
 
81 aa  95.9  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421361  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1805  acyl carrier protein  66.22 
 
 
82 aa  95.5  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200029  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7056  acyl carrier protein  52.63 
 
 
79 aa  94  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  71.67 
 
 
115 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16760  acyl carrier protein  63.01 
 
 
82 aa  91.7  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00765703  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2152  phosphopantetheine-binding protein  60.81 
 
 
82 aa  89.4  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2137  phosphopantetheine-binding protein  57.33 
 
 
82 aa  83.6  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1517  phosphopantetheine-binding  56.76 
 
 
82 aa  82.4  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259778  normal  0.0737426 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12010  acyl carrier protein  50.63 
 
 
82 aa  82  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114572  normal  0.0939277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4861  phosphopantetheine-binding  48.72 
 
 
85 aa  71.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.830038  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1634  phosphopantetheine-binding  46.05 
 
 
90 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  37.5 
 
 
85 aa  63.9  0.0000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  50.75 
 
 
78 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  52.94 
 
 
78 aa  63.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2565  acyl carrier protein  47.62 
 
 
78 aa  63.5  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  51.56 
 
 
77 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1398  acyl carrier protein  40.54 
 
 
78 aa  62  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0752  acyl carrier protein  44.59 
 
 
79 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103187  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0284  acyl carrier protein  38.75 
 
 
82 aa  62  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6611  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  37.5 
 
 
81 aa  61.6  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  41.77 
 
 
80 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  43.42 
 
 
82 aa  61.6  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0466  acyl carrier protein  41.18 
 
 
93 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0816145  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  52.54 
 
 
77 aa  60.8  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  50 
 
 
78 aa  60.8  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  43.66 
 
 
80 aa  61.2  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  50 
 
 
78 aa  61.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4192  acyl carrier protein  44.59 
 
 
78 aa  61.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  0.675617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5148  acyl carrier protein  43.24 
 
 
79 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.166001 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  50 
 
 
74 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3914  acyl carrier protein  44.78 
 
 
78 aa  60.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1319  acyl carrier protein  43.42 
 
 
78 aa  60.5  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.346066  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  37.66 
 
 
78 aa  60.5  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  42.5 
 
 
80 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  39.47 
 
 
82 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  42.5 
 
 
80 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  44.59 
 
 
78 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3358  acyl carrier protein  47.3 
 
 
79 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.304425  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0363  acyl carrier protein  41.89 
 
 
78 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.878931  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  53.85 
 
 
78 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  44.59 
 
 
78 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  40.79 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1765  acyl carrier protein  46.67 
 
 
78 aa  58.9  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1082  acyl carrier protein  41.89 
 
 
78 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.325179  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  50.85 
 
 
77 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  43.42 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03150  acyl carrier protein  42.67 
 
 
77 aa  58.9  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  50.85 
 
 
77 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  44.78 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1137  acyl carrier protein  41.33 
 
 
78 aa  58.2  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1610  Acyl carrier protein (ACP)  46.97 
 
 
90 aa  58.2  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0608  acyl carrier protein  43.24 
 
 
79 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000394559 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  42.11 
 
 
78 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  42.11 
 
 
78 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  40.79 
 
 
79 aa  57.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  42.11 
 
 
78 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1416  acyl carrier protein  47.83 
 
 
76 aa  57.4  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.28944  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0417  acyl carrier protein  44.59 
 
 
77 aa  57.4  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  47.83 
 
 
79 aa  57.4  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1011  acyl carrier protein  40 
 
 
85 aa  57  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303772  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0713  acyl carrier protein  46.97 
 
 
78 aa  57  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000031745  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  40.26 
 
 
79 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1053  acyl carrier protein  44.78 
 
 
79 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  40.26 
 
 
81 aa  57  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  40.26 
 
 
81 aa  57  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  45.07 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  42.11 
 
 
79 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2018  Acyl carrier protein (ACP)  42.11 
 
 
78 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000498687  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  45.07 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3132  acyl carrier protein  43.24 
 
 
78 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2397  acyl carrier protein  41.25 
 
 
84 aa  56.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.774036  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  45.07 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  42.86 
 
 
79 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>