More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0798 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  100 
 
 
77 aa  147  5e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  98.7 
 
 
77 aa  145  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  98.7 
 
 
77 aa  145  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  76.06 
 
 
77 aa  101  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1082  acyl carrier protein  76.06 
 
 
78 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.325179  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1345  acyl carrier protein  76.81 
 
 
79 aa  101  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.095592  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  72.86 
 
 
80 aa  100  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  75.71 
 
 
74 aa  100  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  72.46 
 
 
78 aa  99.4  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  70.42 
 
 
78 aa  98.6  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  73.53 
 
 
78 aa  97.1  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  67.12 
 
 
78 aa  97.1  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  63.01 
 
 
75 aa  95.5  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  71.01 
 
 
78 aa  94.7  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  71.01 
 
 
78 aa  94.7  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  71.01 
 
 
78 aa  94.7  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1361  acyl carrier protein  66.67 
 
 
76 aa  94.7  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000207547  normal  0.0506091 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  70 
 
 
78 aa  94.7  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  66.2 
 
 
75 aa  94.4  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1058  acyl carrier protein  69.12 
 
 
78 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  68.12 
 
 
77 aa  92.8  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1201  acyl carrier protein  69.12 
 
 
78 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.576937  hitchhiker  0.00368899 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0436  acyl carrier protein  64.86 
 
 
76 aa  92.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.20002  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  67.14 
 
 
77 aa  92.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3949  acyl carrier protein  67.61 
 
 
77 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.457007  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3892  acyl carrier protein  67.61 
 
 
77 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1294  acyl carrier protein  67.61 
 
 
77 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0897377  hitchhiker  0.00000000000000136256 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3701  acyl carrier protein  67.61 
 
 
77 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3591  acyl carrier protein  67.61 
 
 
77 aa  91.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3609  acyl carrier protein  67.61 
 
 
77 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3898  acyl carrier protein  67.61 
 
 
77 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000161668  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  66.67 
 
 
77 aa  92  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3988  acyl carrier protein  67.61 
 
 
77 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.168963  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  66.67 
 
 
77 aa  92  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  66.67 
 
 
77 aa  92  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3864  acyl carrier protein  67.61 
 
 
77 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3997e-48 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2502  acyl carrier protein  67.61 
 
 
77 aa  91.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000438987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3673  acyl carrier protein  66.2 
 
 
77 aa  91.3  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173328  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0746  acyl carrier protein  67.65 
 
 
78 aa  91.3  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.746533  normal  0.50277 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  58.9 
 
 
77 aa  90.9  5e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0498  acyl carrier protein  68.12 
 
 
78 aa  90.9  5e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  63.51 
 
 
77 aa  90.5  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1530  acyl carrier protein  67.65 
 
 
78 aa  90.5  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129893  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  61.97 
 
 
74 aa  90.1  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  67.14 
 
 
78 aa  90.1  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  64.71 
 
 
78 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  64.71 
 
 
78 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3647  acyl carrier protein  64.86 
 
 
84 aa  90.1  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742845  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  65.28 
 
 
77 aa  90.1  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  64.29 
 
 
79 aa  90.1  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  65.28 
 
 
77 aa  90.1  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1633  acyl carrier protein  66.2 
 
 
83 aa  90.1  9e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0713  acyl carrier protein  62.86 
 
 
78 aa  89.7  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000031745  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3358  acyl carrier protein  64.29 
 
 
79 aa  89.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.304425  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  61.97 
 
 
81 aa  89.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  64.29 
 
 
78 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  64.29 
 
 
78 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1873  acyl carrier protein  63.77 
 
 
78 aa  89  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107725  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  61.43 
 
 
78 aa  88.6  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1181  acyl carrier protein  61.64 
 
 
76 aa  88.2  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185913  decreased coverage  0.00116588 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  62.86 
 
 
82 aa  88.2  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  62.86 
 
 
82 aa  88.2  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0166  acyl carrier protein  61.76 
 
 
78 aa  88.2  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.317698  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  62.32 
 
 
77 aa  88.2  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0417  acyl carrier protein  65.71 
 
 
77 aa  87.8  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  62.86 
 
 
79 aa  87.8  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  66.67 
 
 
79 aa  87.4  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  61.97 
 
 
77 aa  87.4  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3831  acyl carrier protein  61.43 
 
 
78 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2181  acyl carrier protein  63.77 
 
 
77 aa  87.4  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  65.22 
 
 
79 aa  87.8  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1923  acyl carrier protein  64.29 
 
 
79 aa  87.8  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000792988  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  66.18 
 
 
82 aa  87.4  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  63.89 
 
 
79 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  63.89 
 
 
79 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  63.89 
 
 
79 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1319  acyl carrier protein  64.18 
 
 
78 aa  87.4  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.346066  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1398  acyl carrier protein  60.29 
 
 
78 aa  87  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1258  acyl carrier protein  63.77 
 
 
79 aa  87  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1907  acyl carrier protein  60.27 
 
 
78 aa  87  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000356515  hitchhiker  0.00000541151 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  60 
 
 
78 aa  87  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  56.16 
 
 
85 aa  87  8e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01090  acyl carrier protein  65.22 
 
 
78 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000166866  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2553  acyl carrier protein  65.22 
 
 
78 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526358  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2230  acyl carrier protein  65.22 
 
 
78 aa  86.7  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.78439e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2507  acyl carrier protein  65.22 
 
 
78 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996587  hitchhiker  0.000000169384 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2033  acyl carrier protein  65.22 
 
 
78 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000123338  hitchhiker  0.00000256014 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0196  acyl carrier protein  61.76 
 
 
79 aa  86.7  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1266  acyl carrier protein  65.22 
 
 
78 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000383773  normal  0.0632427 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1310  acyl carrier protein  65.22 
 
 
78 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000174722  decreased coverage  4.37915e-18 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1216  acyl carrier protein  65.22 
 
 
78 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.59624e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1295  acyl carrier protein  65.22 
 
 
78 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000656136  decreased coverage  3.5580799999999995e-20 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01098  hypothetical protein  65.22 
 
 
78 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000144532  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1473  acyl carrier protein  65.22 
 
 
78 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000839248  hitchhiker  0.00000000000000262365 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2173  acyl carrier protein  65.22 
 
 
78 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000401427  hitchhiker  0.000000000000202194 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1215  acyl carrier protein  65.22 
 
 
78 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000103813  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1990  acyl carrier protein  65.22 
 
 
78 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274294  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1579  acyl carrier protein  64.29 
 
 
78 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.86341e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0975  acyl carrier protein  59.72 
 
 
80 aa  86.7  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.553759  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  61.43 
 
 
79 aa  86.3  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>