More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0459 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  100 
 
 
78 aa  148  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  100 
 
 
78 aa  148  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  100 
 
 
78 aa  148  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  94.87 
 
 
78 aa  143  9e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0498  acyl carrier protein  88.46 
 
 
78 aa  137  7e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0746  acyl carrier protein  88.46 
 
 
78 aa  135  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.746533  normal  0.50277 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1530  acyl carrier protein  88.46 
 
 
78 aa  135  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129893  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1201  acyl carrier protein  88.46 
 
 
78 aa  134  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.576937  hitchhiker  0.00368899 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1058  acyl carrier protein  88.46 
 
 
78 aa  134  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  83.33 
 
 
78 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  83.33 
 
 
78 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0894  acyl carrier protein  83.33 
 
 
79 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0694526 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  87.01 
 
 
77 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  83.33 
 
 
78 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  83.33 
 
 
78 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2298  acyl carrier protein  82.05 
 
 
106 aa  128  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  84.62 
 
 
79 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  83.33 
 
 
78 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3358  acyl carrier protein  85.9 
 
 
79 aa  127  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.304425  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3132  acyl carrier protein  82.05 
 
 
78 aa  127  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  84.42 
 
 
77 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  84.42 
 
 
77 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  84.42 
 
 
77 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2468  acyl carrier protein  84 
 
 
79 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  86.67 
 
 
78 aa  125  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2301  acyl carrier protein  84 
 
 
79 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0385608  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  86.84 
 
 
77 aa  125  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2181  acyl carrier protein  83.12 
 
 
77 aa  124  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3819  acyl carrier protein  82.67 
 
 
79 aa  123  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542696  normal  0.0672791 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2352  acyl carrier protein  82.67 
 
 
79 aa  123  7e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3483  acyl carrier protein  82.67 
 
 
79 aa  123  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.057924  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1687  acyl carrier protein  82.67 
 
 
79 aa  123  9e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2978  acyl carrier protein  82.67 
 
 
79 aa  123  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.702686  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1627  acyl carrier protein  81.82 
 
 
77 aa  121  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0810267  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  83.78 
 
 
78 aa  120  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  83.78 
 
 
78 aa  120  9e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0417  acyl carrier protein  83.78 
 
 
77 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2519  acyl carrier protein  80.82 
 
 
79 aa  114  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1216  acyl carrier protein  80.82 
 
 
78 aa  113  6.9999999999999995e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.686684 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  76.92 
 
 
79 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  73.08 
 
 
79 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1873  acyl carrier protein  72.6 
 
 
78 aa  107  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107725  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4192  acyl carrier protein  66.67 
 
 
78 aa  99.8  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  0.675617 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  66.67 
 
 
84 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1319  acyl carrier protein  64.47 
 
 
78 aa  99.4  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.346066  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1580  acyl carrier protein  66.67 
 
 
84 aa  99.4  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000805484  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  66.22 
 
 
79 aa  98.2  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  69.33 
 
 
78 aa  97.8  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0713  acyl carrier protein  67.57 
 
 
78 aa  97.4  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000031745  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  68 
 
 
79 aa  97.1  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03150  acyl carrier protein  61.84 
 
 
77 aa  96.7  9e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  63.64 
 
 
77 aa  96.3  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  65.75 
 
 
82 aa  96.7  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1258  acyl carrier protein  65.33 
 
 
79 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  64.86 
 
 
78 aa  95.9  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  65.75 
 
 
82 aa  96.7  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0363  acyl carrier protein  62.67 
 
 
78 aa  96.3  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.878931  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  63.64 
 
 
77 aa  96.3  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1137  acyl carrier protein  61.84 
 
 
78 aa  95.9  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  72.46 
 
 
77 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  72.46 
 
 
77 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  64.1 
 
 
80 aa  95.5  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  65.75 
 
 
79 aa  95.1  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  71.01 
 
 
77 aa  94.7  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2807  acyl carrier protein  67.12 
 
 
78 aa  95.1  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000875833  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  65.75 
 
 
78 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1687  acyl carrier protein  66.22 
 
 
78 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000299329  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1588  acyl carrier protein  67.12 
 
 
78 aa  95.1  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000112562  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3498  acyl carrier protein  66.22 
 
 
78 aa  95.1  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503689  hitchhiker  0.00947262 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1579  acyl carrier protein  66.22 
 
 
78 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.86341e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  68 
 
 
79 aa  94.7  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2502  acyl carrier protein  67.12 
 
 
78 aa  95.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000398484  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  65.75 
 
 
78 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1624  acyl carrier protein  67.12 
 
 
78 aa  95.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000729948  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2043  acyl carrier protein  64 
 
 
77 aa  94.4  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000099502  decreased coverage  0.00468408 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  63.51 
 
 
79 aa  94.7  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1923  acyl carrier protein  67.57 
 
 
79 aa  94.4  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000792988  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  64.38 
 
 
78 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  67.12 
 
 
79 aa  94.4  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2000  acyl carrier protein  68.49 
 
 
76 aa  94  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2572  acyl carrier protein  64 
 
 
77 aa  94.4  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000656295  hitchhiker  0.00274043 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  64 
 
 
77 aa  94.4  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1720  acyl carrier protein  64 
 
 
77 aa  94.4  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138911  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  64 
 
 
77 aa  94.4  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1717  acyl carrier protein  64 
 
 
77 aa  94.4  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515668  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  67.12 
 
 
81 aa  94.4  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  64 
 
 
77 aa  94.4  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000614435  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2395  acyl carrier protein  64 
 
 
77 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000802043  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2465  acyl carrier protein  64 
 
 
77 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1907  acyl carrier protein  62.34 
 
 
78 aa  94.4  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000356515  hitchhiker  0.00000541151 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  64 
 
 
77 aa  94.4  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2292  acyl carrier protein  62.67 
 
 
77 aa  94  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000308066  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1500  acyl carrier protein  62.67 
 
 
77 aa  94  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000077006  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2623  acyl carrier protein  62.67 
 
 
77 aa  94  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188634  unclonable  0.0000000000890491 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2493  acyl carrier protein  62.67 
 
 
77 aa  94  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155434  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5148  acyl carrier protein  61.33 
 
 
79 aa  94  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.166001 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  65.75 
 
 
77 aa  94  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1604  acyl carrier protein  62.67 
 
 
77 aa  94  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000038664  decreased coverage  0.000139314 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  62.82 
 
 
78 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  60.26 
 
 
81 aa  94  7e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>