More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0685 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  100 
 
 
75 aa  144  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  81.08 
 
 
74 aa  118  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  70.27 
 
 
74 aa  107  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  71.23 
 
 
75 aa  104  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1053  acyl carrier protein  68.57 
 
 
79 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0417  acyl carrier protein  69.86 
 
 
77 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  65.75 
 
 
80 aa  102  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1504  acyl carrier protein  68.57 
 
 
78 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0070299  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  71.83 
 
 
78 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  65.71 
 
 
79 aa  101  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  66.2 
 
 
78 aa  101  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  70.42 
 
 
78 aa  102  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  68.57 
 
 
79 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  70.42 
 
 
79 aa  100  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  70.42 
 
 
78 aa  100  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1923  acyl carrier protein  69.01 
 
 
79 aa  100  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000792988  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  65.75 
 
 
82 aa  100  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  64.29 
 
 
79 aa  100  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  69.01 
 
 
79 aa  100  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  65.75 
 
 
82 aa  100  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  67.61 
 
 
78 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1548  Acyl carrier protein (ACP)  67.61 
 
 
77 aa  100  9e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.079585  normal  0.066745 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  67.61 
 
 
78 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  67.14 
 
 
77 aa  99.8  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2262  acyl carrier protein  67.14 
 
 
79 aa  99.8  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033873  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2427  acyl carrier protein  67.14 
 
 
79 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  67.14 
 
 
77 aa  99.8  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0983  acyl carrier protein  67.14 
 
 
79 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415355  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0918  acyl carrier protein  67.14 
 
 
79 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.150298  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1258  acyl carrier protein  66.2 
 
 
79 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  65.71 
 
 
79 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  65.71 
 
 
79 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  65.71 
 
 
79 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2018  Acyl carrier protein (ACP)  70 
 
 
78 aa  99  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000498687  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  65.71 
 
 
79 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  65.71 
 
 
79 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  65.71 
 
 
79 aa  99  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  65.71 
 
 
79 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  65.28 
 
 
110 aa  99  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  65.71 
 
 
79 aa  99  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  65.71 
 
 
79 aa  99  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  65.71 
 
 
79 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  65.71 
 
 
79 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  65.71 
 
 
79 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  65.71 
 
 
79 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  66.2 
 
 
76 aa  99.4  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  65.71 
 
 
79 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  65.71 
 
 
79 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  65.71 
 
 
79 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  65.71 
 
 
79 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  65.71 
 
 
79 aa  99  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  64.79 
 
 
79 aa  98.2  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0401  acyl carrier protein  67.61 
 
 
79 aa  98.2  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338401  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2298  acyl carrier protein  64.79 
 
 
77 aa  98.2  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00108603  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2133  acyl carrier protein  67.61 
 
 
77 aa  98.2  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000639035  normal  0.0269953 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  65.28 
 
 
79 aa  98.6  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  62.86 
 
 
79 aa  98.6  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  63.38 
 
 
79 aa  98.2  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  67.12 
 
 
78 aa  98.2  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  64.79 
 
 
78 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  62.86 
 
 
79 aa  97.8  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  62.86 
 
 
79 aa  97.8  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  64.79 
 
 
78 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  62.86 
 
 
79 aa  97.8  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  62.86 
 
 
79 aa  97.8  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  65.75 
 
 
79 aa  97.4  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1181  acyl carrier protein  67.12 
 
 
76 aa  97.8  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185913  decreased coverage  0.00116588 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0408  acyl carrier protein  66.2 
 
 
79 aa  97.8  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.442287  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0713  acyl carrier protein  66.2 
 
 
78 aa  97.4  6e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000031745  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  63.89 
 
 
81 aa  97.4  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  63.38 
 
 
78 aa  97.1  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1633  acyl carrier protein  65.75 
 
 
83 aa  97.1  7e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  64.29 
 
 
79 aa  97.1  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2043  acyl carrier protein  64.79 
 
 
77 aa  97.1  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000099502  decreased coverage  0.00468408 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  64.79 
 
 
77 aa  97.1  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  64.79 
 
 
77 aa  96.7  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  64.79 
 
 
77 aa  96.7  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  63.38 
 
 
79 aa  96.7  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2572  acyl carrier protein  64.79 
 
 
77 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000656295  hitchhiker  0.00274043 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  64.79 
 
 
77 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000614435  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1717  acyl carrier protein  64.79 
 
 
77 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515668  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2395  acyl carrier protein  64.79 
 
 
77 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000802043  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2465  acyl carrier protein  64.79 
 
 
77 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1720  acyl carrier protein  64.79 
 
 
77 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138911  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2623  acyl carrier protein  63.38 
 
 
77 aa  96.3  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188634  unclonable  0.0000000000890491 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1604  acyl carrier protein  63.38 
 
 
77 aa  96.3  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000038664  decreased coverage  0.000139314 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2493  acyl carrier protein  63.38 
 
 
77 aa  96.3  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155434  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  65.75 
 
 
79 aa  95.9  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1361  acyl carrier protein  68.06 
 
 
76 aa  96.3  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000207547  normal  0.0506091 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2292  acyl carrier protein  63.38 
 
 
77 aa  96.3  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000308066  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1500  acyl carrier protein  63.38 
 
 
77 aa  96.3  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000077006  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3249  acyl carrier protein  61.43 
 
 
79 aa  95.9  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124771  normal  0.0273605 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1687  acyl carrier protein  63.38 
 
 
78 aa  95.5  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000299329  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1351  acyl carrier protein  63.01 
 
 
82 aa  95.9  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1347  acyl carrier protein  63.01 
 
 
82 aa  95.9  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  66.2 
 
 
78 aa  95.9  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1579  acyl carrier protein  63.38 
 
 
78 aa  95.5  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.86341e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  67.14 
 
 
77 aa  95.9  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3498  acyl carrier protein  63.38 
 
 
78 aa  95.5  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503689  hitchhiker  0.00947262 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0949  acyl carrier protein  70.27 
 
 
79 aa  95.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000253013  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>