More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0959 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  100 
 
 
80 aa  154  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  78.08 
 
 
74 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  73.24 
 
 
75 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  75 
 
 
77 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  68.49 
 
 
74 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  77.78 
 
 
81 aa  107  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  72.37 
 
 
79 aa  104  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  69.74 
 
 
77 aa  104  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  72.37 
 
 
79 aa  104  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1181  acyl carrier protein  66.22 
 
 
76 aa  103  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185913  decreased coverage  0.00116588 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  70.67 
 
 
84 aa  103  6e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  69.74 
 
 
79 aa  103  9e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0713  acyl carrier protein  65.79 
 
 
78 aa  102  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000031745  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  68.42 
 
 
79 aa  103  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1258  acyl carrier protein  68.42 
 
 
79 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  75 
 
 
77 aa  102  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  69.74 
 
 
78 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  65.75 
 
 
75 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1580  acyl carrier protein  69.33 
 
 
84 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000805484  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1082  acyl carrier protein  67.11 
 
 
78 aa  101  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.325179  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  71.43 
 
 
78 aa  101  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1361  acyl carrier protein  67.57 
 
 
76 aa  102  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000207547  normal  0.0506091 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2736  acyl carrier protein  67.57 
 
 
80 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.875192  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1345  acyl carrier protein  67.12 
 
 
79 aa  101  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.095592  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1923  acyl carrier protein  72.6 
 
 
79 aa  101  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000792988  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  72.6 
 
 
79 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  72.86 
 
 
77 aa  100  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1351  acyl carrier protein  65.79 
 
 
82 aa  100  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1347  acyl carrier protein  65.79 
 
 
82 aa  100  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0944  acyl carrier protein  68.42 
 
 
79 aa  100  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000174331  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  69.86 
 
 
78 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  69.86 
 
 
78 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  69.86 
 
 
79 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  69.86 
 
 
79 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  69.86 
 
 
79 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2502  acyl carrier protein  71.23 
 
 
78 aa  99.4  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000398484  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  63.16 
 
 
78 aa  99.8  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2807  acyl carrier protein  71.23 
 
 
78 aa  99.4  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000875833  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  69.86 
 
 
78 aa  99.8  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  70.83 
 
 
78 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  64.86 
 
 
82 aa  99.4  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1648  acyl carrier protein  68.92 
 
 
80 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00355954  normal  0.46932 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  71.43 
 
 
77 aa  99.4  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  71.23 
 
 
77 aa  99  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  64.86 
 
 
82 aa  99.4  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  71.43 
 
 
77 aa  99.4  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3816  acyl carrier protein  63.51 
 
 
75 aa  99.4  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.50375e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  69.44 
 
 
78 aa  99  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  71.83 
 
 
79 aa  98.6  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  71.23 
 
 
77 aa  99  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  70.83 
 
 
78 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1624  acyl carrier protein  71.23 
 
 
78 aa  98.6  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000729948  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1588  acyl carrier protein  71.23 
 
 
78 aa  98.6  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000112562  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  65.33 
 
 
77 aa  97.8  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  66.67 
 
 
78 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  66.67 
 
 
78 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  68.49 
 
 
78 aa  97.8  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  65.38 
 
 
78 aa  97.4  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  61.54 
 
 
82 aa  97.4  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  67.61 
 
 
77 aa  97.8  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.461775 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01090  acyl carrier protein  69.86 
 
 
78 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000166866  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2553  acyl carrier protein  69.86 
 
 
78 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526358  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1215  acyl carrier protein  69.86 
 
 
78 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000103813  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1473  acyl carrier protein  69.86 
 
 
78 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000839248  hitchhiker  0.00000000000000262365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1990  acyl carrier protein  69.86 
 
 
78 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274294  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2173  acyl carrier protein  69.86 
 
 
78 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000401427  hitchhiker  0.000000000000202194 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1216  acyl carrier protein  69.86 
 
 
78 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.59624e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01098  hypothetical protein  69.86 
 
 
78 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000144532  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1310  acyl carrier protein  69.86 
 
 
78 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000174722  decreased coverage  4.37915e-18 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  64.86 
 
 
79 aa  97.1  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2507  acyl carrier protein  69.86 
 
 
78 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996587  hitchhiker  0.000000169384 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1295  acyl carrier protein  69.86 
 
 
78 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000656136  decreased coverage  3.5580799999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1266  acyl carrier protein  69.86 
 
 
78 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000383773  normal  0.0632427 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2230  acyl carrier protein  69.86 
 
 
78 aa  97.4  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.78439e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2033  acyl carrier protein  69.86 
 
 
78 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000123338  hitchhiker  0.00000256014 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1602  acyl carrier protein  65.33 
 
 
77 aa  97.1  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000714682  normal  0.960802 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  68 
 
 
77 aa  97.1  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2298  acyl carrier protein  69.44 
 
 
77 aa  96.7  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00108603  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2133  acyl carrier protein  67.11 
 
 
77 aa  96.7  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000639035  normal  0.0269953 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  62.03 
 
 
78 aa  96.7  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  62.5 
 
 
77 aa  96.3  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4156  acyl carrier protein  69.44 
 
 
78 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.035668  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  65.28 
 
 
77 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  65.75 
 
 
77 aa  96.3  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2043  acyl carrier protein  68 
 
 
77 aa  96.3  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000099502  decreased coverage  0.00468408 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  69.44 
 
 
110 aa  96.3  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  65.28 
 
 
77 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  63.01 
 
 
73 aa  96.7  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  66.22 
 
 
76 aa  96.3  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  63.29 
 
 
78 aa  96.7  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  65.28 
 
 
77 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  64.1 
 
 
78 aa  95.5  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2623  acyl carrier protein  66.67 
 
 
77 aa  95.9  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188634  unclonable  0.0000000000890491 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1604  acyl carrier protein  66.67 
 
 
77 aa  95.5  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000038664  decreased coverage  0.000139314 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  68 
 
 
77 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000614435  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2292  acyl carrier protein  66.67 
 
 
77 aa  95.9  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000308066  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  64.1 
 
 
78 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1633  acyl carrier protein  62.82 
 
 
83 aa  95.5  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  68 
 
 
77 aa  95.9  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2493  acyl carrier protein  66.67 
 
 
77 aa  95.9  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>