More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1602 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1602  acyl carrier protein  100 
 
 
77 aa  148  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000714682  normal  0.960802 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1878  acyl carrier protein  94.81 
 
 
77 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0843624  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  94.81 
 
 
77 aa  142  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3105  acyl carrier protein  90.91 
 
 
77 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000128081  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1157  acyl carrier protein  90.91 
 
 
77 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.917954 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  88.31 
 
 
77 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  85.71 
 
 
77 aa  125  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  79.22 
 
 
77 aa  124  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  75 
 
 
78 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1923  acyl carrier protein  76.32 
 
 
79 aa  114  6.9999999999999995e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000792988  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  72.73 
 
 
84 aa  113  8.999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  73.68 
 
 
110 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  75 
 
 
78 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  75 
 
 
78 aa  112  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  75 
 
 
78 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  75 
 
 
78 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  77.03 
 
 
77 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  77.03 
 
 
77 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  69.74 
 
 
81 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  75 
 
 
78 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1580  acyl carrier protein  71.43 
 
 
84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000805484  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1258  acyl carrier protein  75 
 
 
79 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4156  acyl carrier protein  73.68 
 
 
78 aa  111  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.035668  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  73.68 
 
 
79 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  72.37 
 
 
79 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  73.68 
 
 
79 aa  110  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  73.68 
 
 
79 aa  110  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  73.68 
 
 
79 aa  110  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  73.68 
 
 
79 aa  110  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  73.68 
 
 
79 aa  110  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1866  acyl carrier protein  70.13 
 
 
77 aa  110  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00815396  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01090  acyl carrier protein  72.37 
 
 
78 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000166866  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2553  acyl carrier protein  72.37 
 
 
78 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526358  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1990  acyl carrier protein  72.37 
 
 
78 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274294  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2173  acyl carrier protein  72.37 
 
 
78 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000401427  hitchhiker  0.000000000000202194 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01098  hypothetical protein  72.37 
 
 
78 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000144532  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1215  acyl carrier protein  72.37 
 
 
78 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000103813  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1310  acyl carrier protein  72.37 
 
 
78 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000174722  decreased coverage  4.37915e-18 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2033  acyl carrier protein  72.37 
 
 
78 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000123338  hitchhiker  0.00000256014 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  73.68 
 
 
78 aa  110  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2230  acyl carrier protein  72.37 
 
 
78 aa  110  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.78439e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1473  acyl carrier protein  72.37 
 
 
78 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000839248  hitchhiker  0.00000000000000262365 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  73.68 
 
 
79 aa  110  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1216  acyl carrier protein  72.37 
 
 
78 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.59624e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1266  acyl carrier protein  72.37 
 
 
78 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000383773  normal  0.0632427 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  72.37 
 
 
79 aa  110  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1295  acyl carrier protein  72.37 
 
 
78 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000656136  decreased coverage  3.5580799999999995e-20 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2507  acyl carrier protein  72.37 
 
 
78 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996587  hitchhiker  0.000000169384 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  70.13 
 
 
78 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  73.68 
 
 
79 aa  110  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  72.37 
 
 
82 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  72.37 
 
 
82 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  73.68 
 
 
79 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  73.68 
 
 
78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2000  acyl carrier protein  75.32 
 
 
76 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  69.74 
 
 
79 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  73.68 
 
 
78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  72.37 
 
 
79 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1504  acyl carrier protein  72.37 
 
 
78 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0070299  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  72.37 
 
 
79 aa  108  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3249  acyl carrier protein  71.05 
 
 
79 aa  107  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124771  normal  0.0273605 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3831  acyl carrier protein  71.05 
 
 
78 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1648  acyl carrier protein  70.67 
 
 
80 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00355954  normal  0.46932 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1609  acyl carrier protein  71.05 
 
 
78 aa  107  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000323844  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0918  acyl carrier protein  72.37 
 
 
79 aa  107  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.150298  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  72.37 
 
 
79 aa  107  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0983  acyl carrier protein  72.37 
 
 
79 aa  107  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415355  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2262  acyl carrier protein  71.05 
 
 
79 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033873  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  71.05 
 
 
78 aa  106  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2427  acyl carrier protein  71.05 
 
 
79 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  73.61 
 
 
79 aa  104  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2502  acyl carrier protein  72.6 
 
 
78 aa  104  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000398484  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2807  acyl carrier protein  72.6 
 
 
78 aa  104  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000875833  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  73.61 
 
 
79 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  73.61 
 
 
79 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  73.61 
 
 
79 aa  104  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  73.61 
 
 
79 aa  104  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  73.61 
 
 
79 aa  104  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  73.61 
 
 
79 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  73.61 
 
 
79 aa  104  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  73.61 
 
 
79 aa  104  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  73.61 
 
 
79 aa  104  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  73.61 
 
 
79 aa  104  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  73.61 
 
 
79 aa  104  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  73.61 
 
 
79 aa  104  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  73.61 
 
 
79 aa  104  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  73.61 
 
 
79 aa  104  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  73.61 
 
 
79 aa  104  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  73.61 
 
 
79 aa  104  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1090  acyl carrier protein  69.74 
 
 
77 aa  105  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.343466  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  73.61 
 
 
79 aa  104  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2298  acyl carrier protein  71.05 
 
 
77 aa  104  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00108603  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1624  acyl carrier protein  72.6 
 
 
78 aa  104  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000729948  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0639  acyl carrier protein  71.05 
 
 
79 aa  104  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.299203 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1588  acyl carrier protein  72.6 
 
 
78 aa  104  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000112562  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1351  acyl carrier protein  69.86 
 
 
82 aa  104  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1347  acyl carrier protein  69.86 
 
 
82 aa  104  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  69.74 
 
 
77 aa  103  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1579  acyl carrier protein  71.62 
 
 
78 aa  103  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.86341e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1687  acyl carrier protein  71.62 
 
 
78 aa  103  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000299329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>