More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1181 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1181  acyl carrier protein  100 
 
 
76 aa  148  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185913  decreased coverage  0.00116588 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  72.97 
 
 
74 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3816  acyl carrier protein  71.05 
 
 
75 aa  107  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.50375e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  68.92 
 
 
74 aa  104  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  66.22 
 
 
80 aa  103  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  70.83 
 
 
75 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  68.92 
 
 
78 aa  101  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0949  acyl carrier protein  69.86 
 
 
79 aa  100  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000253013  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  67.11 
 
 
76 aa  99.8  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  67.57 
 
 
79 aa  99  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  70 
 
 
77 aa  98.6  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1923  acyl carrier protein  64.94 
 
 
79 aa  98.6  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000792988  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  63.51 
 
 
82 aa  98.6  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  63.51 
 
 
82 aa  98.6  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1836  acyl carrier protein  63.16 
 
 
76 aa  97.8  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000576824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  67.12 
 
 
75 aa  97.8  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  62.67 
 
 
78 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0713  acyl carrier protein  65.28 
 
 
78 aa  96.7  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000031745  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  62.34 
 
 
78 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  67.57 
 
 
81 aa  95.9  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  64.86 
 
 
79 aa  95.9  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  60.81 
 
 
84 aa  95.1  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  61.84 
 
 
79 aa  94.7  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1361  acyl carrier protein  59.21 
 
 
76 aa  94  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000207547  normal  0.0506091 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1610  Acyl carrier protein (ACP)  63.01 
 
 
90 aa  93.6  7e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1580  acyl carrier protein  59.46 
 
 
84 aa  94  7e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000805484  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1878  acyl carrier protein  66.22 
 
 
77 aa  93.6  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0843624  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  60.53 
 
 
79 aa  93.6  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  62.16 
 
 
79 aa  93.6  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2000  acyl carrier protein  65.75 
 
 
76 aa  92.8  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1157  acyl carrier protein  66.22 
 
 
77 aa  93.2  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.917954 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3105  acyl carrier protein  66.22 
 
 
77 aa  93.2  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000128081  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01090  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000166866  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2553  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526358  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  62.16 
 
 
79 aa  92  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1473  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000839248  hitchhiker  0.00000000000000262365 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01098  hypothetical protein  61.33 
 
 
78 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000144532  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2173  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000401427  hitchhiker  0.000000000000202194 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0285  acyl carrier protein  60.53 
 
 
77 aa  92.4  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2230  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  92.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.78439e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1990  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274294  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0436  acyl carrier protein  59.21 
 
 
76 aa  92  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.20002  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2507  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996587  hitchhiker  0.000000169384 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2033  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000123338  hitchhiker  0.00000256014 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1216  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.59624e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1215  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000103813  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1266  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000383773  normal  0.0632427 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1295  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000656136  decreased coverage  3.5580799999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1310  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000174722  decreased coverage  4.37915e-18 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1345  acyl carrier protein  59.46 
 
 
79 aa  91.7  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.095592  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1258  acyl carrier protein  60.81 
 
 
79 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  62.67 
 
 
77 aa  91.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  59.46 
 
 
78 aa  91.7  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  60.81 
 
 
79 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  62.67 
 
 
77 aa  91.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  64.38 
 
 
77 aa  92  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  68.12 
 
 
77 aa  91.3  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  64.29 
 
 
78 aa  91.3  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2807  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  91.7  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000875833  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2502  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  91.7  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000398484  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1398  acyl carrier protein  58.9 
 
 
78 aa  91.3  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  62.67 
 
 
103 aa  90.9  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1602  acyl carrier protein  63.16 
 
 
77 aa  90.9  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000714682  normal  0.960802 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2298  acyl carrier protein  61.33 
 
 
77 aa  90.5  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00108603  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3498  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  90.5  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503689  hitchhiker  0.00947262 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1687  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  90.5  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000299329  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1579  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  90.5  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.86341e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2736  acyl carrier protein  64.79 
 
 
80 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.875192  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  65.22 
 
 
78 aa  90.5  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1648  acyl carrier protein  57.33 
 
 
80 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00355954  normal  0.46932 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2043  acyl carrier protein  60 
 
 
77 aa  90.5  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000099502  decreased coverage  0.00468408 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  59.72 
 
 
81 aa  90.1  9e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4156  acyl carrier protein  58.44 
 
 
78 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.035668  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  62.5 
 
 
78 aa  90.1  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  62.16 
 
 
110 aa  90.1  9e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  64.29 
 
 
79 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  64.29 
 
 
79 aa  89.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  60 
 
 
77 aa  89.4  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1588  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  90.1  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000112562  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1717  acyl carrier protein  60 
 
 
77 aa  89.4  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515668  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2572  acyl carrier protein  60 
 
 
77 aa  89.4  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000656295  hitchhiker  0.00274043 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  61.04 
 
 
78 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  60 
 
 
77 aa  89.4  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  60.53 
 
 
78 aa  89.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2623  acyl carrier protein  58.67 
 
 
77 aa  89.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188634  unclonable  0.0000000000890491 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2493  acyl carrier protein  58.67 
 
 
77 aa  89.7  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155434  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1624  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  90.1  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000729948  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  64.29 
 
 
79 aa  89.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2292  acyl carrier protein  58.67 
 
 
77 aa  89.7  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000308066  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  64.29 
 
 
79 aa  89.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  60 
 
 
77 aa  89.4  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000614435  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2395  acyl carrier protein  60 
 
 
77 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000802043  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2465  acyl carrier protein  60 
 
 
77 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1500  acyl carrier protein  58.67 
 
 
77 aa  89.7  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000077006  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1720  acyl carrier protein  60 
 
 
77 aa  89.4  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138911  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1609  acyl carrier protein  60 
 
 
78 aa  89.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000323844  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  61.04 
 
 
78 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  60 
 
 
77 aa  89.7  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>