More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2689 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  100 
 
 
82 aa  157  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0363  acyl carrier protein  73.68 
 
 
78 aa  118  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.878931  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5148  acyl carrier protein  75.64 
 
 
79 aa  117  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.166001 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4192  acyl carrier protein  73.68 
 
 
78 aa  115  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  0.675617 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1398  acyl carrier protein  72.37 
 
 
78 aa  114  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1319  acyl carrier protein  75.68 
 
 
78 aa  114  6.9999999999999995e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.346066  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1137  acyl carrier protein  74.32 
 
 
78 aa  111  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03150  acyl carrier protein  72.97 
 
 
77 aa  109  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3914  acyl carrier protein  68.92 
 
 
78 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  67.14 
 
 
77 aa  100  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  63.16 
 
 
81 aa  98.2  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  61.54 
 
 
80 aa  97.4  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  68.57 
 
 
81 aa  97.1  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  70.42 
 
 
76 aa  97.1  7e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  62.67 
 
 
77 aa  97.1  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  60 
 
 
83 aa  96.7  9e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  65.33 
 
 
77 aa  95.5  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0284  acyl carrier protein  60.53 
 
 
82 aa  95.9  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6611  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  54.88 
 
 
82 aa  95.9  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  62.67 
 
 
77 aa  95.9  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  67.12 
 
 
77 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  67.12 
 
 
77 aa  95.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  57.69 
 
 
80 aa  95.1  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  54.88 
 
 
82 aa  95.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  59.74 
 
 
78 aa  94.7  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  57.69 
 
 
80 aa  94.7  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  65.71 
 
 
74 aa  94.4  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  57.69 
 
 
103 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  66.67 
 
 
77 aa  94  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  66.67 
 
 
110 aa  94  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  62.82 
 
 
84 aa  94  7e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1504  acyl carrier protein  63.01 
 
 
78 aa  93.6  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0070299  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1717  acyl carrier protein  66.67 
 
 
77 aa  93.6  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515668  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1765  acyl carrier protein  56.58 
 
 
78 aa  93.6  9e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  66.67 
 
 
77 aa  93.6  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  66.67 
 
 
77 aa  93.6  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000614435  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  66.67 
 
 
77 aa  93.6  9e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2572  acyl carrier protein  66.67 
 
 
77 aa  93.6  9e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000656295  hitchhiker  0.00274043 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1720  acyl carrier protein  66.67 
 
 
77 aa  93.6  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138911  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2395  acyl carrier protein  66.67 
 
 
77 aa  93.6  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000802043  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2465  acyl carrier protein  66.67 
 
 
77 aa  93.6  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1053  acyl carrier protein  61.84 
 
 
79 aa  93.2  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  62.67 
 
 
79 aa  92.8  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  66.2 
 
 
77 aa  92.8  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1604  acyl carrier protein  65.28 
 
 
77 aa  92.8  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000038664  decreased coverage  0.000139314 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1602  acyl carrier protein  64.38 
 
 
77 aa  93.2  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000714682  normal  0.960802 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  58.44 
 
 
79 aa  93.2  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  60.53 
 
 
79 aa  92.8  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  64.38 
 
 
77 aa  92.8  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  61.84 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  61.84 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  61.84 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  61.84 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  61.84 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1082  acyl carrier protein  60 
 
 
78 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.325179  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  61.84 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  62.67 
 
 
77 aa  92.8  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  56.41 
 
 
80 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2262  acyl carrier protein  66.2 
 
 
79 aa  92  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033873  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  61.84 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  61.84 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1580  acyl carrier protein  61.54 
 
 
84 aa  92.4  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000805484  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0983  acyl carrier protein  66.2 
 
 
79 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415355  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  56.41 
 
 
80 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  61.84 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  61.84 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0918  acyl carrier protein  66.2 
 
 
79 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.150298  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  61.84 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  61.84 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  61.84 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  61.84 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0608  acyl carrier protein  64.47 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000394559 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2427  acyl carrier protein  66.2 
 
 
79 aa  92  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  61.84 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  61.84 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  65.28 
 
 
79 aa  92.8  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  61.84 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  61.84 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  66.2 
 
 
79 aa  91.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  66.2 
 
 
79 aa  91.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  58.97 
 
 
80 aa  91.3  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  60.81 
 
 
79 aa  91.3  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  60 
 
 
79 aa  91.3  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  63.16 
 
 
78 aa  90.9  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  63.38 
 
 
82 aa  90.9  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  61.33 
 
 
77 aa  90.9  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  63.38 
 
 
82 aa  90.9  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0975  acyl carrier protein  55 
 
 
80 aa  90.5  6e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.553759  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3647  acyl carrier protein  55.56 
 
 
84 aa  90.5  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742845  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  58.33 
 
 
78 aa  90.5  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1258  acyl carrier protein  59.21 
 
 
79 aa  90.5  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  60.53 
 
 
79 aa  90.1  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17331  acyl carrier protein (ACP)  59.72 
 
 
80 aa  90.1  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  64.79 
 
 
79 aa  90.1  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  61.97 
 
 
79 aa  90.5  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  64.79 
 
 
79 aa  90.5  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  59.46 
 
 
78 aa  90.5  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  64.79 
 
 
79 aa  90.1  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  64.79 
 
 
79 aa  90.1  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  64.79 
 
 
79 aa  90.1  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.026536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>