More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2071 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  100 
 
 		 74 aa  140  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  78.08 
 
 		 80 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1181  acyl carrier protein  72.97 
 
 		 76 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185913  decreased coverage  0.00116588 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  70.27 
 
 		 75 aa  107  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  70.27 
 
 		 74 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  68.92 
 
 		 78 aa  103  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3816  acyl carrier protein  70.27 
 
 		 75 aa  103  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.50375e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  77.14 
 
 		 77 aa  100  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  77.14 
 
 		 77 aa  100  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  75.71 
 
 		 77 aa  100  7e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  71.83 
 
 		 77 aa  100  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  73.61 
 
 		 77 aa  100  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  73.61 
 
 		 77 aa  100  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1361  acyl carrier protein  68.49 
 
 		 76 aa  99.8  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000207547  normal  0.0506091 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  63.51 
 
 		 75 aa  99.4  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  69.44 
 
 		 76 aa  98.2  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  66.22 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  68.49 
 
 		 77 aa  98.2  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2736  acyl carrier protein  69.01 
 
 		 80 aa  97.1  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.875192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  68.06 
 
 		 78 aa  97.1  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  72.46 
 
 		 79 aa  96.7  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  72.73 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  70 
 
 		 77 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  72.73 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2298  acyl carrier protein  69.44 
 
 		 77 aa  96.7  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00108603  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  72.73 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  70 
 
 		 77 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  72.73 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  72.73 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  72.73 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  70 
 
 		 77 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  72.73 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  72.73 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  73.24 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  72.73 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1082  acyl carrier protein  67.12 
 
 		 78 aa  96.3  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.325179  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  72.73 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  72.73 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  70.42 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  72.73 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  72.73 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  72.73 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  71.01 
 
 		 77 aa  96.3  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  72.73 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  72.73 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  70.42 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  70.42 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  72.73 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  72.73 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  71.01 
 
 		 77 aa  96.7  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2807  acyl carrier protein  72.22 
 
 		 78 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000875833  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2502  acyl carrier protein  72.22 
 
 		 78 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000398484  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1687  acyl carrier protein  72.22 
 
 		 78 aa  95.5  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000299329  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  73.53 
 
 		 110 aa  95.9  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  69.01 
 
 		 78 aa  95.9  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3498  acyl carrier protein  72.22 
 
 		 78 aa  95.5  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503689  hitchhiker  0.00947262 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  63.51 
 
 		 80 aa  95.5  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  67.14 
 
 		 78 aa  95.5  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0417  acyl carrier protein  69.01 
 
 		 77 aa  95.5  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1579  acyl carrier protein  72.22 
 
 		 78 aa  95.5  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.86341e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  69.12 
 
 		 79 aa  95.5  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17331  acyl carrier protein (ACP)  64.38 
 
 		 80 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  75 
 
 		 81 aa  95.1  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  71.83 
 
 		 79 aa  95.1  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2181  acyl carrier protein  68.57 
 
 		 77 aa  95.1  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  71.01 
 
 		 82 aa  94.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2043  acyl carrier protein  69.44 
 
 		 77 aa  94.4  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000099502  decreased coverage  0.00468408 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1624  acyl carrier protein  72.22 
 
 		 78 aa  94.7  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000729948  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2565  acyl carrier protein  62.5 
 
 		 78 aa  94.7  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0284  acyl carrier protein  60.81 
 
 		 82 aa  94.7  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  71.01 
 
 		 82 aa  94.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1588  acyl carrier protein  72.22 
 
 		 78 aa  94.7  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000112562  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  69.44 
 
 		 77 aa  94.7  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  63.51 
 
 		 80 aa  94.4  5e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  69.01 
 
 		 78 aa  94.4  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  65.71 
 
 		 82 aa  94.4  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  69.44 
 
 		 77 aa  94  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  69.44 
 
 		 77 aa  94  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1717  acyl carrier protein  69.44 
 
 		 77 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515668  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2572  acyl carrier protein  69.44 
 
 		 77 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000656295  hitchhiker  0.00274043 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2395  acyl carrier protein  69.44 
 
 		 77 aa  94  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000802043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2465  acyl carrier protein  69.44 
 
 		 77 aa  94  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  69.44 
 
 		 77 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000614435  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1720  acyl carrier protein  69.44 
 
 		 77 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138911  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2493  acyl carrier protein  68.06 
 
 		 77 aa  94  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155434  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2623  acyl carrier protein  68.06 
 
 		 77 aa  94  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188634  unclonable  0.0000000000890491 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0918  acyl carrier protein  69.7 
 
 		 79 aa  94  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.150298  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1053  acyl carrier protein  69.7 
 
 		 79 aa  93.6  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  65.28 
 
 		 78 aa  94  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2262  acyl carrier protein  69.7 
 
 		 79 aa  94  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033873  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0983  acyl carrier protein  69.7 
 
 		 79 aa  94  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415355  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2292  acyl carrier protein  68.06 
 
 		 77 aa  94  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000308066  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2427  acyl carrier protein  69.7 
 
 		 79 aa  94  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1500  acyl carrier protein  68.06 
 
 		 77 aa  94  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000077006  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1923  acyl carrier protein  72.46 
 
 		 79 aa  93.6  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000792988  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  68.57 
 
 		 77 aa  93.6  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1090  acyl carrier protein  72.06 
 
 		 77 aa  93.6  8e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.343466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  68.12 
 
 		 81 aa  93.6  9e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1604  acyl carrier protein  68.06 
 
 		 77 aa  93.6  9e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000038664  decreased coverage  0.000139314 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1504  acyl carrier protein  69.12 
 
 		 78 aa  93.2  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0070299  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>