More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1398 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1398  acyl carrier protein  100 
 
 		 78 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0363  acyl carrier protein  84.62 
 
 		 78 aa  137  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.878931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4192  acyl carrier protein  82.05 
 
 		 78 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  0.675617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3914  acyl carrier protein  83.33 
 
 		 78 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5148  acyl carrier protein  81.82 
 
 		 79 aa  127  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.166001 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1137  acyl carrier protein  78.21 
 
 		 78 aa  126  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1319  acyl carrier protein  81.08 
 
 		 78 aa  124  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.346066  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03150  acyl carrier protein  77.33 
 
 		 77 aa  122  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  72.37 
 
 		 82 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1765  acyl carrier protein  67.95 
 
 		 78 aa  111  4.0000000000000004e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  65.38 
 
 		 79 aa  103  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  64.47 
 
 		 77 aa  102  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  64.1 
 
 		 79 aa  101  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  63.64 
 
 		 79 aa  101  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1258  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 79 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 79 aa  100  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  65.79 
 
 		 79 aa  100  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 82 aa  100  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 82 aa  100  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 84 aa  100  8e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 79 aa  100  8e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 79 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 79 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 79 aa  99.8  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 79 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 78 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 79 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 79 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 79 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 79 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 79 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 79 aa  99.8  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 79 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 79 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 79 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 79 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 78 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 79 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 79 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1208  hypothetical protein  63.64 
 
 		 80 aa  100  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000845225 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 79 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 79 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 78 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 78 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2262  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 79 aa  99.4  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033873  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1580  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 84 aa  99  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000805484  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0713  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 78 aa  98.6  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000031745  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2427  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 79 aa  99.4  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 79 aa  99  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 78 aa  99  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 78 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 77 aa  98.6  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 79 aa  98.2  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 79 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 77 aa  98.2  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1923  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 79 aa  97.4  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000792988  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  62.67 
 
 		 79 aa  97.4  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 81 aa  97.4  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3132  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 78 aa  97.1  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1053  acyl carrier protein  60.26 
 
 		 79 aa  97.1  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  60 
 
 		 78 aa  97.1  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  64.1 
 
 		 79 aa  96.7  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  64.1 
 
 		 79 aa  96.7  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  64.1 
 
 		 79 aa  96.7  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0918  acyl carrier protein  60.26 
 
 		 79 aa  96.7  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.150298  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0983  acyl carrier protein  60.26 
 
 		 79 aa  96.7  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415355  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  62.67 
 
 		 78 aa  96.7  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  64.1 
 
 		 79 aa  96.7  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  64.1 
 
 		 79 aa  96.7  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2000  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 76 aa  96.7  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3483  acyl carrier protein  60.26 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.057924  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1687  acyl carrier protein  60.26 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3819  acyl carrier protein  60.26 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542696  normal  0.0672791 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 78 aa  96.3  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 79 aa  96.7  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1504  acyl carrier protein  58.97 
 
 		 78 aa  96.3  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0070299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2978  acyl carrier protein  60.26 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.702686  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2352  acyl carrier protein  60.26 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0639  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 79 aa  96.3  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.299203 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  65.75 
 
 		 77 aa  96.3  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1082  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 78 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.325179  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  65.75 
 
 		 77 aa  96.3  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 77 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 78 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2468  acyl carrier protein  60.26 
 
 		 79 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2301  acyl carrier protein  60.26 
 
 		 79 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0385608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 79 aa  95.9  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0608  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 79 aa  95.5  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000394559 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 78 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  61.33 
 
 		 77 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2181  acyl carrier protein  60 
 
 		 77 aa  95.1  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 78 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  61.33 
 
 		 77 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  57.89 
 
 		 78 aa  95.1  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0417  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 77 aa  94.7  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  60 
 
 		 77 aa  95.1  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  61.33 
 
 		 77 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 78 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  59.21 
 
 		 78 aa  94.4  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 77 aa  94.7  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>