More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1382 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  100 
 
 
81 aa  154  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  64 
 
 
78 aa  97.8  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  62.67 
 
 
82 aa  97.4  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  61.33 
 
 
82 aa  95.5  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  64.79 
 
 
77 aa  95.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1082  acyl carrier protein  60.81 
 
 
78 aa  94  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.325179  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  65.28 
 
 
78 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  65.28 
 
 
78 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2262  acyl carrier protein  57.69 
 
 
79 aa  92  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033873  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  62.67 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0363  acyl carrier protein  62.16 
 
 
78 aa  92  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.878931  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0284  acyl carrier protein  57.5 
 
 
82 aa  92.8  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6611  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2427  acyl carrier protein  57.69 
 
 
79 aa  92  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  63.38 
 
 
81 aa  92.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  63.38 
 
 
79 aa  91.7  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  63.38 
 
 
79 aa  91.7  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  63.38 
 
 
79 aa  91.7  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  63.38 
 
 
79 aa  91.7  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  63.38 
 
 
79 aa  91.7  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  63.38 
 
 
79 aa  91.7  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  63.38 
 
 
79 aa  91.7  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  60.56 
 
 
79 aa  91.3  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  63.38 
 
 
79 aa  91.7  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  63.38 
 
 
79 aa  91.7  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  63.38 
 
 
79 aa  91.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  63.38 
 
 
79 aa  91.7  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  63.38 
 
 
79 aa  91.7  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  63.38 
 
 
79 aa  91.7  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  63.38 
 
 
79 aa  91.7  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  63.38 
 
 
79 aa  91.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  63.38 
 
 
79 aa  91.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  63.38 
 
 
79 aa  91.7  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  63.38 
 
 
79 aa  91.7  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0452  acyl carrier protein  62.67 
 
 
88 aa  91.3  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  60.27 
 
 
79 aa  90.9  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  60.27 
 
 
79 aa  90.9  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  61.11 
 
 
79 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  60.27 
 
 
79 aa  90.9  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  60.27 
 
 
79 aa  90.9  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  61.11 
 
 
79 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  61.11 
 
 
79 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  58.67 
 
 
80 aa  90.5  7e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  60.27 
 
 
79 aa  90.5  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  57.5 
 
 
80 aa  90.5  8e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  65.22 
 
 
78 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  58.11 
 
 
77 aa  90.1  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1548  Acyl carrier protein (ACP)  56.76 
 
 
77 aa  90.1  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.079585  normal  0.066745 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1398  acyl carrier protein  60.81 
 
 
78 aa  90.1  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  65.22 
 
 
78 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0166  acyl carrier protein  52.56 
 
 
78 aa  90.1  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.317698  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  61.97 
 
 
77 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0983  acyl carrier protein  58.9 
 
 
79 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415355  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1648  acyl carrier protein  59.49 
 
 
80 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00355954  normal  0.46932 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  64.38 
 
 
78 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3673  acyl carrier protein  59.46 
 
 
77 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173328  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0918  acyl carrier protein  58.9 
 
 
79 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.150298  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  56.58 
 
 
82 aa  90.1  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  58.9 
 
 
79 aa  89.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  66.22 
 
 
77 aa  90.1  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3249  acyl carrier protein  60.27 
 
 
79 aa  89.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124771  normal  0.0273605 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  58.67 
 
 
83 aa  89  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1053  acyl carrier protein  60.56 
 
 
79 aa  89  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3892  acyl carrier protein  59.46 
 
 
77 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  57.14 
 
 
79 aa  89.4  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3701  acyl carrier protein  59.46 
 
 
77 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3591  acyl carrier protein  59.46 
 
 
77 aa  89.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3609  acyl carrier protein  59.46 
 
 
77 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2502  acyl carrier protein  59.46 
 
 
77 aa  89.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000438987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1294  acyl carrier protein  59.46 
 
 
77 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0897377  hitchhiker  0.00000000000000136256 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  58.9 
 
 
79 aa  89  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3949  acyl carrier protein  59.46 
 
 
77 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.457007  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4156  acyl carrier protein  63.89 
 
 
78 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.035668  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3864  acyl carrier protein  59.46 
 
 
77 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3997e-48 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1602  acyl carrier protein  60.56 
 
 
77 aa  89.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000714682  normal  0.960802 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3988  acyl carrier protein  59.46 
 
 
77 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.168963  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  55.84 
 
 
78 aa  88.6  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  63.51 
 
 
78 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1602  acyl carrier protein  60.81 
 
 
77 aa  89  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00127335  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  59.46 
 
 
77 aa  89  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3898  acyl carrier protein  59.46 
 
 
77 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000161668  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  63.01 
 
 
78 aa  88.6  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5148  acyl carrier protein  61.97 
 
 
79 aa  88.6  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.166001 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  59.72 
 
 
77 aa  88.6  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  62.5 
 
 
78 aa  88.2  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1361  acyl carrier protein  60.27 
 
 
76 aa  88.2  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000207547  normal  0.0506091 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1878  acyl carrier protein  60.56 
 
 
77 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0843624  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  62.5 
 
 
76 aa  88.6  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1345  acyl carrier protein  55.26 
 
 
79 aa  88.2  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.095592  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  59.15 
 
 
77 aa  87.8  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3647  acyl carrier protein  60.53 
 
 
84 aa  88.2  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742845  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  56.25 
 
 
80 aa  87.8  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  60.56 
 
 
77 aa  88.2  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  57.53 
 
 
79 aa  88.2  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1416  acyl carrier protein  63.77 
 
 
76 aa  88.2  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.28944  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  60.56 
 
 
77 aa  88.2  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  61.43 
 
 
77 aa  88.2  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  63.51 
 
 
78 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  64.29 
 
 
79 aa  87.8  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  48.75 
 
 
85 aa  87.4  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1990  acyl carrier protein  61.11 
 
 
78 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>