More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1416 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1416  acyl carrier protein  100 
 
 		 76 aa  147  6e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.28944  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1852  acyl carrier protein  70.83 
 
 		 76 aa  104  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2430  acyl carrier protein  72.22 
 
 		 76 aa  103  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000123335  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  62.67 
 
 		 76 aa  100  5e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0066  acyl carrier protein  68.42 
 
 		 76 aa  100  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3099  acyl carrier protein  69.86 
 
 		 76 aa  100  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179771 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  68.49 
 
 		 78 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  68.49 
 
 		 78 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1615  acyl carrier protein  72.46 
 
 		 77 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  66.2 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  66.2 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  66.2 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  66.2 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  66.2 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  66.2 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  66.2 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  66.2 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  66.2 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  66.2 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  66.2 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  66.2 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  66.2 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  66.2 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  66.2 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  66.2 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  66.2 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  66.2 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1687  acyl carrier protein  66.2 
 
 		 78 aa  95.5  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000299329  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3498  acyl carrier protein  66.2 
 
 		 78 aa  95.5  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503689  hitchhiker  0.00947262 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1579  acyl carrier protein  66.2 
 
 		 78 aa  95.5  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.86341e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1053  acyl carrier protein  63.38 
 
 		 79 aa  94.7  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 77 aa  94.4  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1720  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 77 aa  94  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138911  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 77 aa  94  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1717  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 77 aa  94  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515668  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 77 aa  94  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2572  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 77 aa  94  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000656295  hitchhiker  0.00274043 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2395  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 77 aa  94  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000802043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2465  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 77 aa  94  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 77 aa  94  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000614435  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  66.2 
 
 		 78 aa  93.6  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  63.01 
 
 		 78 aa  92.8  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1604  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 77 aa  93.2  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000038664  decreased coverage  0.000139314 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0436  acyl carrier protein  59.72 
 
 		 76 aa  92.8  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.20002  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  62.5 
 
 		 110 aa  93.2  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  63.38 
 
 		 78 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3831  acyl carrier protein  63.38 
 
 		 78 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  63.38 
 
 		 78 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2262  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033873  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  63.38 
 
 		 78 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2427  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  63.38 
 
 		 78 aa  92.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2298  acyl carrier protein  63.38 
 
 		 77 aa  91.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00108603  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1648  acyl carrier protein  63.38 
 
 		 80 aa  92  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00355954  normal  0.46932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0918  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 79 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.150298  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  63.38 
 
 		 78 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  57.33 
 
 		 77 aa  91.7  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0983  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 79 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415355  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4156  acyl carrier protein  63.38 
 
 		 78 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.035668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  60.56 
 
 		 79 aa  91.3  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0401  acyl carrier protein  64.18 
 
 		 79 aa  90.9  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338401  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  62.5 
 
 		 78 aa  90.9  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01090  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 78 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000166866  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2553  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 78 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526358  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2173  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 78 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000401427  hitchhiker  0.000000000000202194 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1310  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 78 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000174722  decreased coverage  4.37915e-18 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2502  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 78 aa  90.9  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000398484  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1216  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 78 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.59624e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2230  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 78 aa  90.5  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.78439e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2033  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 78 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000123338  hitchhiker  0.00000256014 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1990  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 78 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1215  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 78 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000103813  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1473  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 78 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000839248  hitchhiker  0.00000000000000262365 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01098  hypothetical protein  61.97 
 
 		 78 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000144532  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2807  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 78 aa  90.9  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000875833  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1295  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 78 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000656136  decreased coverage  3.5580799999999995e-20 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2507  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 78 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996587  hitchhiker  0.000000169384 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1266  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 78 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000383773  normal  0.0632427 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0408  acyl carrier protein  59.72 
 
 		 79 aa  90.5  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.442287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  58.33 
 
 		 79 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  58.33 
 
 		 79 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  58.33 
 
 		 79 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0608  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 79 aa  90.5  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000394559 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  58.9 
 
 		 74 aa  90.1  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  61.11 
 
 		 78 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  61.11 
 
 		 81 aa  90.1  9e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  62.5 
 
 		 79 aa  90.1  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 77 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1609  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 78 aa  90.1  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000323844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1588  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 78 aa  90.1  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000112562  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1351  acyl carrier protein  60.56 
 
 		 82 aa  90.1  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1347  acyl carrier protein  60.56 
 
 		 82 aa  90.1  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2043  acyl carrier protein  60.56 
 
 		 77 aa  89.4  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000099502  decreased coverage  0.00468408 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  62.5 
 
 		 77 aa  90.1  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2292  acyl carrier protein  60.56 
 
 		 77 aa  89.7  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000308066  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1500  acyl carrier protein  60.56 
 
 		 77 aa  89.7  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000077006  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2493  acyl carrier protein  60.56 
 
 		 77 aa  89.7  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155434  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  60.56 
 
 		 79 aa  90.1  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1090  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 77 aa  89.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.343466  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>