More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0984 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  100 
 
 		 82 aa  161  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  95.12 
 
 		 82 aa  155  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0284  acyl carrier protein  73.68 
 
 		 82 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  67.12 
 
 		 77 aa  100  6e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  64.86 
 
 		 82 aa  99  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  63.51 
 
 		 79 aa  99  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  62.67 
 
 		 81 aa  97.4  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0752  acyl carrier protein  63.64 
 
 		 79 aa  97.1  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103187  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  60.81 
 
 		 77 aa  96.3  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 79 aa  95.5  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 79 aa  95.5  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 79 aa  95.5  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  54.88 
 
 		 82 aa  95.9  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 79 aa  95.5  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  57.69 
 
 		 79 aa  95.5  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1633  acyl carrier protein  57.32 
 
 		 83 aa  95.9  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  68.66 
 
 		 77 aa  95.5  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  61.33 
 
 		 78 aa  95.1  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  56.41 
 
 		 79 aa  95.1  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 79 aa  95.1  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  64.38 
 
 		 73 aa  94.7  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  60.56 
 
 		 79 aa  94.7  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  60.56 
 
 		 79 aa  94.4  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  60.76 
 
 		 83 aa  94.4  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  63.77 
 
 		 77 aa  94  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  64.29 
 
 		 78 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  64.29 
 
 		 78 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  61.43 
 
 		 81 aa  93.2  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3249  acyl carrier protein  60.56 
 
 		 79 aa  93.2  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124771  normal  0.0273605 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  65.71 
 
 		 77 aa  93.2  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5387  acyl carrier protein  57.33 
 
 		 78 aa  93.2  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1648  acyl carrier protein  60 
 
 		 80 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00355954  normal  0.46932 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1602  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 77 aa  92  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000714682  normal  0.960802 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  64.86 
 
 		 78 aa  92.8  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1878  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 77 aa  92  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0843624  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  61.33 
 
 		 79 aa  92.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 77 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3105  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 77 aa  92  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000128081  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1157  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 77 aa  92  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.917954 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 79 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 79 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 79 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 79 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 79 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 79 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  57.33 
 
 		 78 aa  91.3  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 79 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 79 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 79 aa  91.3  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 79 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 79 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 79 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 79 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 79 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 79 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 79 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 79 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 79 aa  91.3  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  59.21 
 
 		 79 aa  90.9  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  56.79 
 
 		 81 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  61.64 
 
 		 79 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  61.64 
 
 		 79 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  60.27 
 
 		 76 aa  90.9  5e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  61.64 
 
 		 79 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 77 aa  90.9  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  58.67 
 
 		 78 aa  90.5  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  61.33 
 
 		 78 aa  90.5  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  62.32 
 
 		 77 aa  90.5  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0608  acyl carrier protein  55.13 
 
 		 79 aa  90.5  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000394559 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  60 
 
 		 77 aa  90.1  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4156  acyl carrier protein  64.29 
 
 		 78 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.035668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1873  acyl carrier protein  59.72 
 
 		 78 aa  90.1  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  60.56 
 
 		 78 aa  90.1  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1053  acyl carrier protein  59.21 
 
 		 79 aa  89.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  59.15 
 
 		 77 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2262  acyl carrier protein  59.21 
 
 		 79 aa  89.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033873  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  64.29 
 
 		 78 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  60 
 
 		 78 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  58.67 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2427  acyl carrier protein  59.21 
 
 		 79 aa  89.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  64.29 
 
 		 78 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0166  acyl carrier protein  53.85 
 
 		 78 aa  89.7  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.317698  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  61.43 
 
 		 77 aa  88.6  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0918  acyl carrier protein  57.89 
 
 		 79 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.150298  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0983  acyl carrier protein  57.89 
 
 		 79 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415355  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1548  Acyl carrier protein (ACP)  64.18 
 
 		 77 aa  89.4  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.079585  normal  0.066745 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0401  acyl carrier protein  59.21 
 
 		 79 aa  88.6  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338401  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 78 aa  88.6  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  59.21 
 
 		 79 aa  88.6  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  59.21 
 
 		 79 aa  89  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  61.43 
 
 		 77 aa  88.6  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0363  acyl carrier protein  53.95 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.878931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3673  acyl carrier protein  60.56 
 
 		 77 aa  88.2  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173328  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0408  acyl carrier protein  57.89 
 
 		 79 aa  88.6  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.442287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1866  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 77 aa  88.2  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00815396  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3831  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 78 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  58.9 
 
 		 84 aa  87.8  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0417  acyl carrier protein  58.57 
 
 		 77 aa  87.8  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  61.76 
 
 		 78 aa  88.2  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  60.87 
 
 		 78 aa  88.2  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>