More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6811 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6811  phosphopantetheine-binding  100 
 
 
82 aa  156  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1988  phosphopantetheine-binding  74.68 
 
 
81 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44915  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0876  acyl carrier protein  74.03 
 
 
84 aa  111  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3483  acyl carrier protein  74.03 
 
 
82 aa  106  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.520778  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  72.73 
 
 
82 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2039  acyl carrier protein  65 
 
 
80 aa  104  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0051261  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4810  acyl carrier protein  69.14 
 
 
82 aa  103  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0303207  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3380  acyl carrier protein  69.74 
 
 
79 aa  100  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0442067  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3622  acyl carrier protein  69.74 
 
 
79 aa  99  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000545579 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1975  acyl carrier protein  60.76 
 
 
79 aa  96.3  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.166506  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  58.23 
 
 
101 aa  96.7  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1805  acyl carrier protein  62.2 
 
 
82 aa  96.3  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200029  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2137  phosphopantetheine-binding protein  60.98 
 
 
82 aa  95.5  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16760  acyl carrier protein  60.49 
 
 
82 aa  95.9  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00765703  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14090  acyl carrier protein  60.98 
 
 
82 aa  94.7  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.025354  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  54.88 
 
 
84 aa  94.7  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10270  acyl carrier protein  65.79 
 
 
81 aa  94.7  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.167244 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  58.23 
 
 
97 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  58.23 
 
 
97 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  58.23 
 
 
97 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2468  acyl carrier protein  59.49 
 
 
81 aa  92.8  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000407512  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3512  acyl carrier protein  62.34 
 
 
79 aa  93.2  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410127  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  55.13 
 
 
87 aa  92.8  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1325  acyl carrier protein  64 
 
 
79 aa  92  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3345  acyl carrier protein  59.49 
 
 
81 aa  92  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0503244  normal  0.362492 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  57.89 
 
 
80 aa  92.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  56.96 
 
 
99 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2207  acyl carrier protein  59.49 
 
 
81 aa  92  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000161202 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  56.96 
 
 
99 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  54.88 
 
 
101 aa  91.3  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09300  acyl carrier protein  60.76 
 
 
81 aa  91.3  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421361  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2152  phosphopantetheine-binding protein  58.54 
 
 
82 aa  90.9  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7056  acyl carrier protein  49.37 
 
 
79 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12010  acyl carrier protein  50 
 
 
82 aa  82  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114572  normal  0.0939277 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1517  phosphopantetheine-binding  52.44 
 
 
82 aa  82  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259778  normal  0.0737426 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  48.15 
 
 
103 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  55.7 
 
 
115 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  46.25 
 
 
80 aa  70.5  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  46.25 
 
 
80 aa  70.5  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  46.25 
 
 
80 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  43.75 
 
 
80 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  46.25 
 
 
80 aa  68.2  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17331  acyl carrier protein (ACP)  43.75 
 
 
80 aa  67.4  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  45.45 
 
 
79 aa  67  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18011  acyl carrier protein  44.16 
 
 
79 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18181  acyl carrier protein  44.16 
 
 
79 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  45.21 
 
 
80 aa  64.7  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  40.51 
 
 
85 aa  64.7  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0746  acyl carrier protein  50 
 
 
78 aa  64.3  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.746533  normal  0.50277 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1634  phosphopantetheine-binding  41.25 
 
 
90 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1058  acyl carrier protein  50 
 
 
78 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1201  acyl carrier protein  50 
 
 
78 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.576937  hitchhiker  0.00368899 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  43.75 
 
 
80 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  52.56 
 
 
78 aa  62.8  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  50.82 
 
 
74 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  47.83 
 
 
78 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1361  acyl carrier protein  49.18 
 
 
76 aa  62.8  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000207547  normal  0.0506091 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  50.72 
 
 
78 aa  62.4  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  46.15 
 
 
78 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  46.15 
 
 
78 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  47.83 
 
 
78 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  46.15 
 
 
78 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  47.44 
 
 
79 aa  62  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2298  acyl carrier protein  50 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  47.37 
 
 
79 aa  62  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  47.37 
 
 
79 aa  61.6  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0894  acyl carrier protein  50 
 
 
79 aa  61.2  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0694526 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3132  acyl carrier protein  46.15 
 
 
78 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42161  predicted protein  41.03 
 
 
114 aa  61.2  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0806882  normal  0.994618 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  48.53 
 
 
78 aa  61.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1530  acyl carrier protein  48.72 
 
 
78 aa  60.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129893  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  49.28 
 
 
78 aa  60.5  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  39.24 
 
 
81 aa  60.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  48.48 
 
 
77 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  53.62 
 
 
78 aa  60.1  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  53.62 
 
 
78 aa  60.1  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  53.62 
 
 
78 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0284  acyl carrier protein  42.25 
 
 
82 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6611  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4192  acyl carrier protein  45.45 
 
 
78 aa  60.1  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  0.675617 
 
 
-
 
NC_002950  PG1765  acyl carrier protein  45 
 
 
78 aa  59.3  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  38.16 
 
 
83 aa  58.9  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5148  acyl carrier protein  40.79 
 
 
79 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.166001 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1181  acyl carrier protein  43.24 
 
 
76 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185913  decreased coverage  0.00116588 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  42.42 
 
 
74 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1398  acyl carrier protein  36.49 
 
 
78 aa  59.3  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  42.67 
 
 
81 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  45.83 
 
 
78 aa  58.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  44.93 
 
 
78 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3358  acyl carrier protein  49.28 
 
 
79 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.304425  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2018  Acyl carrier protein (ACP)  45.71 
 
 
78 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000498687  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  38.89 
 
 
75 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04410  acyl carrier protein (acp), putative  37.33 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  41.33 
 
 
78 aa  57.8  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0498  acyl carrier protein  45.57 
 
 
78 aa  57.8  0.00000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  43.21 
 
 
82 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  41.98 
 
 
82 aa  57.8  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03150  acyl carrier protein  45.76 
 
 
77 aa  57.4  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  41.89 
 
 
79 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3819  acyl carrier protein  45.95 
 
 
79 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542696  normal  0.0672791 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2352  acyl carrier protein  45.95 
 
 
79 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>