More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1634 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1634  phosphopantetheine-binding  100 
 
 
90 aa  168  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  48.78 
 
 
82 aa  78.2  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3483  acyl carrier protein  47.56 
 
 
82 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.520778  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3512  acyl carrier protein  46.67 
 
 
79 aa  71.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410127  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1988  phosphopantetheine-binding  46.67 
 
 
81 aa  69.3  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44915  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2039  acyl carrier protein  46.05 
 
 
80 aa  69.3  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0051261  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0876  acyl carrier protein  43.84 
 
 
84 aa  68.9  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1325  acyl carrier protein  42.67 
 
 
79 aa  68.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  41.33 
 
 
99 aa  67  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7056  acyl carrier protein  40.91 
 
 
79 aa  67  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10270  acyl carrier protein  42.47 
 
 
81 aa  66.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.167244 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  41.33 
 
 
97 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3380  acyl carrier protein  42.11 
 
 
79 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0442067  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  41.33 
 
 
97 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  41.33 
 
 
97 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  40.91 
 
 
80 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  40 
 
 
99 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1975  acyl carrier protein  41.18 
 
 
79 aa  65.1  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.166506  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3622  acyl carrier protein  42.11 
 
 
79 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000545579 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  37.18 
 
 
87 aa  64.3  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4810  acyl carrier protein  44.93 
 
 
82 aa  64.3  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0303207  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  38.46 
 
 
101 aa  64.3  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  37.33 
 
 
101 aa  63.9  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  36.36 
 
 
84 aa  63.9  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6811  phosphopantetheine-binding  41.25 
 
 
82 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0466  acyl carrier protein  39.13 
 
 
93 aa  60.8  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0816145  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09300  acyl carrier protein  38.36 
 
 
81 aa  60.5  0.000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421361  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  40.98 
 
 
115 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2468  acyl carrier protein  38.36 
 
 
81 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000407512  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2212  acyl carrier protein  34.88 
 
 
94 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.266286  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2207  acyl carrier protein  38.36 
 
 
81 aa  57  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000161202 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  35.37 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  43.1 
 
 
74 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  36.59 
 
 
82 aa  53.9  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  36.59 
 
 
82 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  48.28 
 
 
77 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0310  acyl carrier protein  42.86 
 
 
76 aa  53.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00336649  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  37.68 
 
 
79 aa  52.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3460  acyl carrier protein  32.1 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712705 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  39.66 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  36.62 
 
 
74 aa  52  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14090  acyl carrier protein  33.33 
 
 
82 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.025354  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  39.06 
 
 
73 aa  52.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  39.66 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  36.92 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  36.23 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  36.23 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  36.92 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  36.23 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  36.23 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  33.33 
 
 
79 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1160  acyl carrier protein  38.71 
 
 
84 aa  51.6  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000195346  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0975  acyl carrier protein  33.77 
 
 
80 aa  52  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.553759  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  36.23 
 
 
79 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  36.23 
 
 
79 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  35.21 
 
 
81 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  37.93 
 
 
77 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1053  acyl carrier protein  39.44 
 
 
79 aa  50.8  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  39.44 
 
 
79 aa  50.8  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  39.44 
 
 
79 aa  50.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  39.44 
 
 
79 aa  50.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  39.44 
 
 
79 aa  50.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  39.44 
 
 
79 aa  50.8  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  39.44 
 
 
79 aa  50.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  39.44 
 
 
79 aa  50.8  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  39.44 
 
 
79 aa  50.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  39.44 
 
 
79 aa  50.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  39.44 
 
 
79 aa  50.8  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  39.44 
 
 
79 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  39.44 
 
 
79 aa  50.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  39.44 
 
 
79 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  39.44 
 
 
79 aa  50.8  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  39.44 
 
 
79 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  35.62 
 
 
80 aa  51.2  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  39.44 
 
 
79 aa  50.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  39.44 
 
 
79 aa  50.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  39.44 
 
 
79 aa  50.8  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1805  acyl carrier protein  33.33 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200029  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  33.82 
 
 
74 aa  50.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  41.18 
 
 
77 aa  50.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  34.72 
 
 
77 aa  50.4  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12010  acyl carrier protein  30.99 
 
 
82 aa  50.4  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114572  normal  0.0939277 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  34.21 
 
 
77 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0608  acyl carrier protein  37.5 
 
 
79 aa  50.4  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000394559 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0397  phosphopantetheine-binding  34.94 
 
 
91 aa  50.4  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.823663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  35.29 
 
 
75 aa  50.4  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0918  acyl carrier protein  39.13 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.150298  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  36.23 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  36.99 
 
 
78 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3345  acyl carrier protein  33.33 
 
 
81 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0503244  normal  0.362492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4861  phosphopantetheine-binding  32.14 
 
 
85 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.830038  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2262  acyl carrier protein  39.13 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033873  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  35.21 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  33.77 
 
 
78 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0944  acyl carrier protein  33.77 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000174331  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0983  acyl carrier protein  39.13 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415355  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2427  acyl carrier protein  39.13 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  38.6 
 
 
81 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  36.99 
 
 
78 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3249  acyl carrier protein  36.23 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124771  normal  0.0273605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>