More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1263 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  100 
 
 		 82 aa  156  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3483  acyl carrier protein  96.34 
 
 		 82 aa  150  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.520778  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4810  acyl carrier protein  76.62 
 
 		 82 aa  116  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0303207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3380  acyl carrier protein  75 
 
 		 79 aa  111  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0442067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3622  acyl carrier protein  75 
 
 		 79 aa  110  8.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000545579 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0876  acyl carrier protein  68.29 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2039  acyl carrier protein  69.74 
 
 		 80 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0051261  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  61.84 
 
 		 101 aa  106  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6811  phosphopantetheine-binding  72.73 
 
 		 82 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 97 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 97 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 97 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  64.47 
 
 		 101 aa  105  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1988  phosphopantetheine-binding  72.97 
 
 		 81 aa  104  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44915  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 99 aa  104  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 99 aa  104  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1325  acyl carrier protein  68 
 
 		 79 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  56.1 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3512  acyl carrier protein  66.23 
 
 		 79 aa  100  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410127  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10270  acyl carrier protein  67.12 
 
 		 81 aa  99.8  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.167244 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  55.84 
 
 		 87 aa  97.4  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3345  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 81 aa  97.1  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0503244  normal  0.362492 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1975  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 79 aa  97.1  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.166506  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2207  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 81 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000161202 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  55.26 
 
 		 80 aa  94.4  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2468  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 81 aa  93.6  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000407512  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09300  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 81 aa  92.4  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7056  acyl carrier protein  50.65 
 
 		 79 aa  91.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16760  acyl carrier protein  58.44 
 
 		 82 aa  90.1  9e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00765703  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  60.66 
 
 		 115 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14090  acyl carrier protein  60.26 
 
 		 82 aa  87.4  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.025354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2152  phosphopantetheine-binding protein  57.14 
 
 		 82 aa  84.3  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1805  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 82 aa  84  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200029  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1517  phosphopantetheine-binding  54.55 
 
 		 82 aa  80.5  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259778  normal  0.0737426 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12010  acyl carrier protein  52.56 
 
 		 82 aa  80.1  0.000000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114572  normal  0.0939277 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1634  phosphopantetheine-binding  48.78 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2137  phosphopantetheine-binding protein  53.85 
 
 		 82 aa  75.9  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  47.95 
 
 		 77 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  48.72 
 
 		 80 aa  72.4  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  52.11 
 
 		 78 aa  72  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  45.83 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  50.77 
 
 		 74 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  56.06 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  45.95 
 
 		 78 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  45.95 
 
 		 78 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  45.95 
 
 		 78 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  49.3 
 
 		 73 aa  67  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  44.87 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  49.33 
 
 		 77 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 80 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2565  acyl carrier protein  51.56 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  40.24 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  46.67 
 
 		 77 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  46.67 
 
 		 77 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  53.97 
 
 		 77 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  46.67 
 
 		 77 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1181  acyl carrier protein  47.89 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185913  decreased coverage  0.00116588 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  40.26 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  43.42 
 
 		 81 aa  64.7  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4861  phosphopantetheine-binding  42.68 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.830038  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  46.48 
 
 		 79 aa  65.1  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3132  acyl carrier protein  44.59 
 
 		 78 aa  64.7  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  43.42 
 
 		 81 aa  64.7  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  41.46 
 
 		 82 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  45.07 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  54.55 
 
 		 78 aa  64.3  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  54.55 
 
 		 78 aa  64.3  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0284  acyl carrier protein  40.79 
 
 		 82 aa  64.3  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  45.33 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  54.55 
 
 		 78 aa  64.3  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1633  acyl carrier protein  45.12 
 
 		 83 aa  64.3  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5387  acyl carrier protein  48.05 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  44.59 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  44.59 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  44.44 
 
 		 77 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  52.38 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  46.48 
 
 		 79 aa  63.5  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  45.45 
 
 		 80 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  45.45 
 
 		 80 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  45.07 
 
 		 79 aa  63.5  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  45.07 
 
 		 79 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0975  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 80 aa  62.8  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.553759  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  42.31 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  46.05 
 
 		 80 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  46.05 
 
 		 80 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0752  acyl carrier protein  42.47 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103187  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  45.07 
 
 		 79 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  45.33 
 
 		 77 aa  62.8  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  45.07 
 
 		 79 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  45.07 
 
 		 79 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_002620  TC0507  acyl carrier protein  44.62 
 
 		 77 aa  62.8  0.000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0583644  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  50.79 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3249  acyl carrier protein  45.07 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124771  normal  0.0273605 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  45.45 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  51.56 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  40 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0746  acyl carrier protein  46.67 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.746533  normal  0.50277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>