More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3512 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3512  acyl carrier protein  100 
 
 		 79 aa  155  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410127  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2039  acyl carrier protein  70.51 
 
 		 80 aa  113  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0051261  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1325  acyl carrier protein  72.6 
 
 		 79 aa  110  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  64 
 
 		 99 aa  104  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10270  acyl carrier protein  69.33 
 
 		 81 aa  104  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.167244 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3380  acyl carrier protein  69.86 
 
 		 79 aa  104  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0442067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  64 
 
 		 97 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  64 
 
 		 97 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  64 
 
 		 97 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0876  acyl carrier protein  69.44 
 
 		 84 aa  103  9e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3622  acyl carrier protein  69.86 
 
 		 79 aa  102  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000545579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  62.67 
 
 		 99 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3483  acyl carrier protein  67.53 
 
 		 82 aa  102  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.520778  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  63.51 
 
 		 101 aa  100  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 84 aa  100  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  66.23 
 
 		 82 aa  100  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1975  acyl carrier protein  64.86 
 
 		 79 aa  99.8  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.166506  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4810  acyl carrier protein  66.67 
 
 		 82 aa  99.4  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0303207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  62.16 
 
 		 87 aa  99.4  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  57.69 
 
 		 101 aa  98.2  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  58.11 
 
 		 80 aa  94  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6811  phosphopantetheine-binding  62.34 
 
 		 82 aa  93.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1988  phosphopantetheine-binding  56.41 
 
 		 81 aa  92.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44915  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  63.93 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14090  acyl carrier protein  60.26 
 
 		 82 aa  87  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.025354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12010  acyl carrier protein  53.25 
 
 		 82 aa  86.3  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114572  normal  0.0939277 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2207  acyl carrier protein  55.13 
 
 		 81 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000161202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7056  acyl carrier protein  48.65 
 
 		 79 aa  84.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2468  acyl carrier protein  53.85 
 
 		 81 aa  83.6  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000407512  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09300  acyl carrier protein  54.55 
 
 		 81 aa  83.2  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421361  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2152  phosphopantetheine-binding protein  54.55 
 
 		 82 aa  82.4  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16760  acyl carrier protein  55.56 
 
 		 82 aa  79.7  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00765703  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1805  acyl carrier protein  53.25 
 
 		 82 aa  80.1  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200029  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3345  acyl carrier protein  48.65 
 
 		 81 aa  76.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0503244  normal  0.362492 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1517  phosphopantetheine-binding  52.78 
 
 		 82 aa  73.9  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259778  normal  0.0737426 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2137  phosphopantetheine-binding protein  53.16 
 
 		 82 aa  72.8  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1634  phosphopantetheine-binding  46.67 
 
 		 90 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4861  phosphopantetheine-binding  44.74 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.830038  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  47.83 
 
 		 78 aa  66.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  45.45 
 
 		 77 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4192  acyl carrier protein  47.3 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  0.675617 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0284  acyl carrier protein  38.46 
 
 		 82 aa  63.9  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  41.56 
 
 		 82 aa  63.9  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0608  acyl carrier protein  45.95 
 
 		 79 aa  63.5  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000394559 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  44.87 
 
 		 79 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2565  acyl carrier protein  41.03 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  44.87 
 
 		 79 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  44.87 
 
 		 79 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  42.11 
 
 		 82 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5148  acyl carrier protein  45.95 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.166001 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  48.1 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5650  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 80 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.611546  normal  0.225397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  43.42 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  43.42 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  43.42 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  42.67 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  47.54 
 
 		 74 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 76 aa  61.2  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5387  acyl carrier protein  45.83 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1053  acyl carrier protein  44 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  42.67 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  40.26 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  46.84 
 
 		 79 aa  60.5  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  48.53 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3914  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1765  acyl carrier protein  41.56 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3132  acyl carrier protein  43.42 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  43.66 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  46.48 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  42.11 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  40.79 
 
 		 82 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  43.66 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2262  acyl carrier protein  45.07 
 
 		 79 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033873  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  44.78 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0363  acyl carrier protein  40.54 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.878931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2427  acyl carrier protein  45.07 
 
 		 79 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  46.48 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1398  acyl carrier protein  41.56 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1416  acyl carrier protein  44.93 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.28944  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  44.29 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  40.79 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>