More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2371 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  100 
 
 		 84 aa  165  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7056  acyl carrier protein  87.34 
 
 		 79 aa  142  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  79.27 
 
 		 87 aa  135  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1975  acyl carrier protein  79.75 
 
 		 79 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.166506  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  81.58 
 
 		 80 aa  124  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0876  acyl carrier protein  64.29 
 
 		 84 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2039  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 80 aa  106  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0051261  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  64.56 
 
 		 97 aa  104  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  64.56 
 
 		 97 aa  104  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10270  acyl carrier protein  66.67 
 
 		 81 aa  105  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.167244 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  64.56 
 
 		 97 aa  104  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  63.29 
 
 		 99 aa  104  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1325  acyl carrier protein  62.03 
 
 		 79 aa  103  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  64.56 
 
 		 99 aa  103  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14090  acyl carrier protein  63.1 
 
 		 82 aa  102  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.025354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3483  acyl carrier protein  57.32 
 
 		 82 aa  102  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.520778  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  56.1 
 
 		 82 aa  101  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3512  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 79 aa  100  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410127  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  60.76 
 
 		 101 aa  99.8  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09300  acyl carrier protein  58.02 
 
 		 81 aa  96.7  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421361  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  56.96 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6811  phosphopantetheine-binding  54.88 
 
 		 82 aa  94.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1988  phosphopantetheine-binding  59.76 
 
 		 81 aa  94.7  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44915  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2152  phosphopantetheine-binding protein  58.44 
 
 		 82 aa  94  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1805  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 82 aa  92.4  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200029  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16760  acyl carrier protein  56.41 
 
 		 82 aa  90.1  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00765703  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1517  phosphopantetheine-binding  58.44 
 
 		 82 aa  89.4  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259778  normal  0.0737426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3380  acyl carrier protein  52.63 
 
 		 79 aa  88.6  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0442067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3345  acyl carrier protein  56.76 
 
 		 81 aa  88.2  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0503244  normal  0.362492 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3622  acyl carrier protein  52.63 
 
 		 79 aa  88.2  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000545579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4810  acyl carrier protein  50.63 
 
 		 82 aa  87.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0303207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  67.21 
 
 		 115 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2468  acyl carrier protein  54.05 
 
 		 81 aa  85.1  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000407512  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12010  acyl carrier protein  51.22 
 
 		 82 aa  84.3  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114572  normal  0.0939277 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2207  acyl carrier protein  52.7 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000161202 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2137  phosphopantetheine-binding protein  51.95 
 
 		 82 aa  79.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4861  phosphopantetheine-binding  42.68 
 
 		 85 aa  74.7  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.830038  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0608  acyl carrier protein  48.65 
 
 		 79 aa  72  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000394559 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  40.51 
 
 		 82 aa  72  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  49.25 
 
 		 78 aa  70.9  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  47.22 
 
 		 78 aa  70.5  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  50.75 
 
 		 78 aa  70.5  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  44 
 
 		 81 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  48.05 
 
 		 79 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  50.75 
 
 		 78 aa  68.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  46.38 
 
 		 76 aa  68.6  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  46.75 
 
 		 79 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  46.75 
 
 		 79 aa  68.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  46.75 
 
 		 79 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  45.45 
 
 		 79 aa  68.2  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  45.83 
 
 		 79 aa  68.2  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  46.75 
 
 		 79 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  46.75 
 
 		 79 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  44 
 
 		 82 aa  67.4  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3249  acyl carrier protein  46.75 
 
 		 79 aa  67.4  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124771  normal  0.0273605 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  46.38 
 
 		 79 aa  67  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  45.45 
 
 		 79 aa  67  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0639  acyl carrier protein  44.16 
 
 		 79 aa  66.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.299203 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  47.76 
 
 		 77 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0417  acyl carrier protein  42.11 
 
 		 77 aa  66.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  46.27 
 
 		 75 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  44.59 
 
 		 74 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3358  acyl carrier protein  43.59 
 
 		 79 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.304425  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  43.66 
 
 		 78 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  45.45 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  45.45 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  43.66 
 
 		 78 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  45.45 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1634  phosphopantetheine-binding  36.36 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  47.83 
 
 		 78 aa  64.3  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  43.66 
 
 		 78 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1053  acyl carrier protein  43.48 
 
 		 79 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  40.79 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1416  acyl carrier protein  44.29 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.28944  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3099  acyl carrier protein  44.93 
 
 		 76 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179771 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2018  Acyl carrier protein (ACP)  45.07 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000498687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2397  acyl carrier protein  40.74 
 
 		 84 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.774036  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  42.67 
 
 		 82 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0983  acyl carrier protein  44.29 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415355  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  50.77 
 
 		 74 aa  62.8  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0918  acyl carrier protein  44.29 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.150298  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  40.54 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 79 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  44.93 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 79 aa  62  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 79 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2262  acyl carrier protein  44.62 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033873  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 79 aa  62  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 79 aa  62  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 79 aa  62  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  44.78 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 79 aa  62  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1504  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0070299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 79 aa  62  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 79 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  44.93 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2427  acyl carrier protein  44.62 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  43.48 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  42.03 
 
 		 79 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 77 aa  62.8  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>