More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7056 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7056  acyl carrier protein  100 
 
 
79 aa  155  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  87.34 
 
 
84 aa  142  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  79.49 
 
 
87 aa  130  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1975  acyl carrier protein  75.95 
 
 
79 aa  124  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.166506  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  80.26 
 
 
80 aa  121  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0876  acyl carrier protein  60.76 
 
 
84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  63.29 
 
 
97 aa  103  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  63.29 
 
 
97 aa  103  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  63.29 
 
 
97 aa  103  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  62.03 
 
 
99 aa  103  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  63.29 
 
 
99 aa  103  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  60.76 
 
 
101 aa  100  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  59.49 
 
 
101 aa  97.4  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09300  acyl carrier protein  59.46 
 
 
81 aa  95.9  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421361  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1325  acyl carrier protein  55.84 
 
 
79 aa  95.5  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10270  acyl carrier protein  58.9 
 
 
81 aa  95.1  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.167244 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2039  acyl carrier protein  52.63 
 
 
80 aa  94  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0051261  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14090  acyl carrier protein  56.41 
 
 
82 aa  93.6  8e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.025354  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  50.65 
 
 
82 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2152  phosphopantetheine-binding protein  55.84 
 
 
82 aa  90.5  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1988  phosphopantetheine-binding  56.96 
 
 
81 aa  90.5  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44915  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3483  acyl carrier protein  49.35 
 
 
82 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.520778  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1805  acyl carrier protein  54.55 
 
 
82 aa  88.6  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200029  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3345  acyl carrier protein  54.05 
 
 
81 aa  86.3  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0503244  normal  0.362492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6811  phosphopantetheine-binding  49.37 
 
 
82 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  65.57 
 
 
115 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2468  acyl carrier protein  52.63 
 
 
81 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000407512  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16760  acyl carrier protein  52.56 
 
 
82 aa  85.1  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00765703  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3512  acyl carrier protein  48.65 
 
 
79 aa  84.7  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410127  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1517  phosphopantetheine-binding  53.25 
 
 
82 aa  84  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259778  normal  0.0737426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3380  acyl carrier protein  47.37 
 
 
79 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0442067  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3622  acyl carrier protein  47.37 
 
 
79 aa  82.8  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000545579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4810  acyl carrier protein  45.57 
 
 
82 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0303207  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2207  acyl carrier protein  52.7 
 
 
81 aa  82  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000161202 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2137  phosphopantetheine-binding protein  53.25 
 
 
82 aa  81.6  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12010  acyl carrier protein  49.37 
 
 
82 aa  80.9  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114572  normal  0.0939277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4861  phosphopantetheine-binding  46.05 
 
 
85 aa  76.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.830038  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  41.33 
 
 
81 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1634  phosphopantetheine-binding  40.91 
 
 
90 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  45.59 
 
 
77 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  37.84 
 
 
82 aa  65.5  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0608  acyl carrier protein  46.58 
 
 
79 aa  65.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000394559 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  45.59 
 
 
78 aa  65.5  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  42.86 
 
 
78 aa  64.3  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  46.27 
 
 
78 aa  64.3  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  45.59 
 
 
74 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  47.14 
 
 
79 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  47.14 
 
 
79 aa  63.5  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  47.14 
 
 
79 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  47.14 
 
 
79 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  45.71 
 
 
79 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  45.71 
 
 
79 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  40.28 
 
 
77 aa  62.8  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  45.71 
 
 
79 aa  62.8  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  40.54 
 
 
79 aa  62.8  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  43.06 
 
 
77 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  45.07 
 
 
73 aa  62  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  45.71 
 
 
79 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2397  acyl carrier protein  40.26 
 
 
84 aa  62.4  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.774036  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0310  acyl carrier protein  48.48 
 
 
76 aa  62  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00336649  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  41.89 
 
 
79 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3249  acyl carrier protein  47.14 
 
 
79 aa  62.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124771  normal  0.0273605 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  42.65 
 
 
76 aa  62  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  39.73 
 
 
82 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1852  acyl carrier protein  44.12 
 
 
76 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  45.45 
 
 
78 aa  61.2  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  38.89 
 
 
81 aa  61.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  40.28 
 
 
78 aa  61.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  43.06 
 
 
75 aa  61.6  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1416  acyl carrier protein  43.28 
 
 
76 aa  61.6  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.28944  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  41.67 
 
 
80 aa  60.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  44.12 
 
 
74 aa  60.8  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  42.42 
 
 
79 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  42.42 
 
 
79 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  42.42 
 
 
79 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3099  acyl carrier protein  44.12 
 
 
76 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179771 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  41.79 
 
 
79 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  41.79 
 
 
79 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  41.79 
 
 
79 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  46.27 
 
 
74 aa  60.5  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  41.79 
 
 
79 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  41.79 
 
 
79 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  41.79 
 
 
79 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  41.79 
 
 
79 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  41.79 
 
 
79 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  41.79 
 
 
79 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  41.79 
 
 
79 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  41.79 
 
 
79 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  41.79 
 
 
79 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  41.79 
 
 
79 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  41.79 
 
 
79 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  41.79 
 
 
79 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  41.79 
 
 
79 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  41.79 
 
 
79 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  41.79 
 
 
79 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  43.28 
 
 
78 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  37.18 
 
 
103 aa  60.1  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  42.65 
 
 
78 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  42.65 
 
 
78 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  43.28 
 
 
78 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>