More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1988 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1988  phosphopantetheine-binding  100 
 
 		 81 aa  153  9e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44915  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6811  phosphopantetheine-binding  74.68 
 
 		 82 aa  112  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0876  acyl carrier protein  76.62 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2468  acyl carrier protein  67.9 
 
 		 81 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000407512  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2207  acyl carrier protein  67.9 
 
 		 81 aa  108  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000161202 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3483  acyl carrier protein  74.32 
 
 		 82 aa  105  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.520778  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3622  acyl carrier protein  73.33 
 
 		 79 aa  105  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000545579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  72.97 
 
 		 82 aa  104  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1805  acyl carrier protein  67.07 
 
 		 82 aa  103  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200029  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3380  acyl carrier protein  72 
 
 		 79 aa  103  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0442067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09300  acyl carrier protein  66.67 
 
 		 81 aa  103  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421361  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4810  acyl carrier protein  70.51 
 
 		 82 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0303207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3345  acyl carrier protein  62.96 
 
 		 81 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0503244  normal  0.362492 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10270  acyl carrier protein  69.74 
 
 		 81 aa  101  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.167244 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2039  acyl carrier protein  68 
 
 		 80 aa  99.8  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0051261  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16760  acyl carrier protein  65.43 
 
 		 82 aa  98.6  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00765703  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14090  acyl carrier protein  64.63 
 
 		 82 aa  97.8  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.025354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1325  acyl carrier protein  64.86 
 
 		 79 aa  95.9  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2152  phosphopantetheine-binding protein  64.63 
 
 		 82 aa  95.1  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  59.76 
 
 		 84 aa  94.7  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  58.44 
 
 		 97 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  54.55 
 
 		 101 aa  92.8  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  58.44 
 
 		 97 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  58.44 
 
 		 97 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3512  acyl carrier protein  56.41 
 
 		 79 aa  92.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410127  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  56.58 
 
 		 87 aa  92  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 99 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  57.89 
 
 		 80 aa  91.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 99 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  54.88 
 
 		 101 aa  91.3  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2137  phosphopantetheine-binding protein  62.03 
 
 		 82 aa  90.5  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7056  acyl carrier protein  56.96 
 
 		 79 aa  90.5  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1975  acyl carrier protein  58.23 
 
 		 79 aa  90.1  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.166506  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12010  acyl carrier protein  53.25 
 
 		 82 aa  80.1  0.000000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114572  normal  0.0939277 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  55.74 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1517  phosphopantetheine-binding  52.44 
 
 		 82 aa  77.4  0.00000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259778  normal  0.0737426 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  57.35 
 
 		 78 aa  71.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1058  acyl carrier protein  58.82 
 
 		 78 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1201  acyl carrier protein  58.82 
 
 		 78 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.576937  hitchhiker  0.00368899 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  57.35 
 
 		 78 aa  70.5  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  57.35 
 
 		 78 aa  70.5  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  57.35 
 
 		 78 aa  70.5  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0746  acyl carrier protein  57.35 
 
 		 78 aa  70.5  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.746533  normal  0.50277 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  45.45 
 
 		 80 aa  70.1  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1530  acyl carrier protein  57.35 
 
 		 78 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129893  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1634  phosphopantetheine-binding  46.67 
 
 		 90 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  52.46 
 
 		 74 aa  67.4  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2565  acyl carrier protein  49.25 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  44.87 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  51.47 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0498  acyl carrier protein  48.15 
 
 		 78 aa  66.6  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2736  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 80 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.875192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  50 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  48.53 
 
 		 78 aa  64.3  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0894  acyl carrier protein  52.94 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0694526 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  45.31 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17331  acyl carrier protein (ACP)  45 
 
 		 80 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2298  acyl carrier protein  51.47 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  49.33 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  47.3 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  48.68 
 
 		 77 aa  63.9  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  47.3 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  48 
 
 		 77 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  48 
 
 		 77 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  48 
 
 		 77 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0752  acyl carrier protein  48.48 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103187  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  48.53 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1627  acyl carrier protein  48 
 
 		 77 aa  63.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0810267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3358  acyl carrier protein  52.24 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.304425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1610  Acyl carrier protein (ACP)  46.75 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  53.12 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1361  acyl carrier protein  41.25 
 
 		 76 aa  62  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000207547  normal  0.0506091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  47.06 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  50 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3819  acyl carrier protein  46.58 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542696  normal  0.0672791 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18011  acyl carrier protein  42.31 
 
 		 79 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2352  acyl carrier protein  46.58 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  47.06 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1398  acyl carrier protein  38.36 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  47.06 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1181  acyl carrier protein  40 
 
 		 76 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185913  decreased coverage  0.00116588 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  44.62 
 
 		 74 aa  62  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  50 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  44 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18181  acyl carrier protein  42.31 
 
 		 79 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  48.53 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  42.31 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  44.29 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  44.29 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  44.29 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3483  acyl carrier protein  46.58 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.057924  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  39.19 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1687  acyl carrier protein  46.58 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2978  acyl carrier protein  46.58 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.702686  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  48.48 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2468  acyl carrier protein  46.58 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2301  acyl carrier protein  46.58 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0385608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  43.21 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  44.74 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  43.04 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>