More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3122 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  100 
 
 		 101 aa  196  7e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  75 
 
 		 101 aa  153  9e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  86.87 
 
 		 99 aa  151  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  86.87 
 
 		 99 aa  150  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  91.25 
 
 		 97 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  91.25 
 
 		 97 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  91.25 
 
 		 97 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  82.83 
 
 		 115 aa  140  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2039  acyl carrier protein  69.33 
 
 		 80 aa  110  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0051261  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10270  acyl carrier protein  69.33 
 
 		 81 aa  110  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.167244 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 82 aa  106  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4810  acyl carrier protein  60.76 
 
 		 82 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0303207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3483  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 82 aa  104  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.520778  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1325  acyl carrier protein  68.92 
 
 		 79 aa  104  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  60.76 
 
 		 87 aa  103  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7056  acyl carrier protein  60.76 
 
 		 79 aa  100  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3512  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 79 aa  100  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410127  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1975  acyl carrier protein  60.76 
 
 		 79 aa  100  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.166506  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  60.76 
 
 		 84 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  61.84 
 
 		 80 aa  98.6  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0876  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 84 aa  97.8  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6811  phosphopantetheine-binding  57.32 
 
 		 82 aa  97.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3622  acyl carrier protein  58.67 
 
 		 79 aa  95.5  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000545579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3380  acyl carrier protein  58.67 
 
 		 79 aa  95.9  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0442067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1988  phosphopantetheine-binding  53.75 
 
 		 81 aa  94.4  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44915  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2207  acyl carrier protein  53.75 
 
 		 81 aa  94  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000161202 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09300  acyl carrier protein  56.25 
 
 		 81 aa  93.2  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421361  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3345  acyl carrier protein  54.55 
 
 		 81 aa  91.7  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0503244  normal  0.362492 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14090  acyl carrier protein  54.88 
 
 		 82 aa  92  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.025354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2468  acyl carrier protein  52.5 
 
 		 81 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000407512  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1805  acyl carrier protein  52.44 
 
 		 82 aa  90.5  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200029  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16760  acyl carrier protein  53.85 
 
 		 82 aa  90.5  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00765703  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12010  acyl carrier protein  53.66 
 
 		 82 aa  89.7  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114572  normal  0.0939277 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2137  phosphopantetheine-binding protein  53.66 
 
 		 82 aa  86.3  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1517  phosphopantetheine-binding  57.14 
 
 		 82 aa  86.3  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259778  normal  0.0737426 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2152  phosphopantetheine-binding protein  51.22 
 
 		 82 aa  85.1  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  48.57 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  53.12 
 
 		 74 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4861  phosphopantetheine-binding  50.67 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.830038  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 81 aa  67  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1181  acyl carrier protein  52.24 
 
 		 76 aa  67  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185913  decreased coverage  0.00116588 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 81 aa  67  0.00000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  47.06 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  50 
 
 		 77 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2565  acyl carrier protein  43.42 
 
 		 78 aa  66.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  47.06 
 
 		 80 aa  65.1  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  40.79 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1634  phosphopantetheine-binding  37.33 
 
 		 90 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  48.57 
 
 		 79 aa  63.9  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  43.06 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  47.76 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  47.76 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  47.76 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  47.76 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  44.29 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  47.76 
 
 		 79 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  43.06 
 
 		 74 aa  61.6  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  46.27 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  41.89 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3249  acyl carrier protein  47.76 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124771  normal  0.0273605 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  46.27 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1082  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.325179  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  45.45 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  41.89 
 
 		 82 aa  60.5  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  37.5 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1011  acyl carrier protein  38.16 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303772  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  42.31 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  43.66 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  40.74 
 
 		 103 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0466  acyl carrier protein  34.29 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0816145  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  41.1 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1398  acyl carrier protein  42.65 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  39.73 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  39.71 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  39.71 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  41.89 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  39.71 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0310  acyl carrier protein  43.48 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00336649  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3132  acyl carrier protein  39.71 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  42.25 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  39.71 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  44.78 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  43.28 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1088  acyl carrier protein  43.33 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3263  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  43.94 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  41.67 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0752  acyl carrier protein  38.81 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103187  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  45.07 
 
 		 74 aa  57  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  40.85 
 
 		 73 aa  56.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  40.24 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1687  acyl carrier protein  39.71 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  37.97 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2978  acyl carrier protein  39.71 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.702686  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2352  acyl carrier protein  39.71 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  43.94 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  40.3 
 
 		 75 aa  57  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>