More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1325 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1325  acyl carrier protein  100 
 
 		 79 aa  155  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2039  acyl carrier protein  85.33 
 
 		 80 aa  126  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0051261  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10270  acyl carrier protein  77.5 
 
 		 81 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.167244 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3512  acyl carrier protein  72.6 
 
 		 79 aa  110  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410127  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  71.62 
 
 		 99 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  71.62 
 
 		 97 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  71.62 
 
 		 97 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  71.62 
 
 		 97 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1975  acyl carrier protein  72.97 
 
 		 79 aa  108  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.166506  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  70.27 
 
 		 99 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  63.64 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  68.92 
 
 		 80 aa  106  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  68.92 
 
 		 101 aa  105  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0876  acyl carrier protein  63.64 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  68.92 
 
 		 101 aa  104  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  62.03 
 
 		 84 aa  103  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3380  acyl carrier protein  63.29 
 
 		 79 aa  103  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0442067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3483  acyl carrier protein  69.33 
 
 		 82 aa  103  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.520778  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  68 
 
 		 82 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3622  acyl carrier protein  63.29 
 
 		 79 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000545579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4810  acyl carrier protein  68.92 
 
 		 82 aa  99.8  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0303207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09300  acyl carrier protein  64.86 
 
 		 81 aa  95.5  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7056  acyl carrier protein  55.84 
 
 		 79 aa  95.5  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1988  phosphopantetheine-binding  64.86 
 
 		 81 aa  95.9  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44915  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  72.88 
 
 		 115 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6811  phosphopantetheine-binding  64 
 
 		 82 aa  92  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2468  acyl carrier protein  59.21 
 
 		 81 aa  91.3  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000407512  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2207  acyl carrier protein  60.81 
 
 		 81 aa  90.5  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000161202 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14090  acyl carrier protein  60.81 
 
 		 82 aa  89.4  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.025354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1805  acyl carrier protein  62.16 
 
 		 82 aa  87.8  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200029  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3345  acyl carrier protein  58.67 
 
 		 81 aa  87.4  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0503244  normal  0.362492 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2152  phosphopantetheine-binding protein  58.11 
 
 		 82 aa  85.5  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16760  acyl carrier protein  59.15 
 
 		 82 aa  84  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00765703  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12010  acyl carrier protein  54.55 
 
 		 82 aa  83.6  9e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114572  normal  0.0939277 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1517  phosphopantetheine-binding  55.26 
 
 		 82 aa  81.6  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259778  normal  0.0737426 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2137  phosphopantetheine-binding protein  56 
 
 		 82 aa  81.3  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4861  phosphopantetheine-binding  49.37 
 
 		 85 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.830038  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1634  phosphopantetheine-binding  42.67 
 
 		 90 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  48.05 
 
 		 77 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  41.03 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  45.33 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  40.51 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  44.59 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2565  acyl carrier protein  46.97 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  41.33 
 
 		 81 aa  63.5  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  46.67 
 
 		 78 aa  63.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  47.06 
 
 		 77 aa  62  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  45.57 
 
 		 80 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3358  acyl carrier protein  46.67 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.304425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  44.87 
 
 		 80 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  44.87 
 
 		 80 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  39.74 
 
 		 82 aa  62  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  44.59 
 
 		 79 aa  62  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  47.76 
 
 		 80 aa  62  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  44.87 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  44 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2212  acyl carrier protein  36 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.266286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  42.47 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  42.47 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0284  acyl carrier protein  37.18 
 
 		 82 aa  61.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  42.47 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  49.3 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  44 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  44 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  50 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1765  acyl carrier protein  43.66 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  38.46 
 
 		 82 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  40.79 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5148  acyl carrier protein  43.66 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.166001 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2397  acyl carrier protein  41.03 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.774036  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  48.33 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  50.85 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  50.85 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3914  acyl carrier protein  44.29 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  39.19 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  42.31 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  50 
 
 		 78 aa  60.1  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  41.1 
 
 		 77 aa  60.1  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0752  acyl carrier protein  39.73 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103187  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  41.03 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  45.07 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  40.54 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  40.28 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  43.66 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  39.74 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  47.89 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2736  acyl carrier protein  38.46 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.875192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  38.46 
 
 		 82 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  47.89 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0363  acyl carrier protein  43.66 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.878931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  43.66 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  43.59 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0608  acyl carrier protein  44.29 
 
 		 79 aa  58.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000394559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4192  acyl carrier protein  45.07 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  0.675617 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  47.89 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  49.23 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  38.36 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  40.54 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1216  acyl carrier protein  43.24 
 
 		 78 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.686684 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>