108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2212 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2212  acyl carrier protein  100 
 
 
94 aa  190  5e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.266286  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0466  acyl carrier protein  81.61 
 
 
93 aa  144  5e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0816145  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1325  acyl carrier protein  36 
 
 
79 aa  61.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1634  phosphopantetheine-binding  34.88 
 
 
90 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  36.36 
 
 
82 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10270  acyl carrier protein  33.77 
 
 
81 aa  57.4  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.167244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  31.58 
 
 
97 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  31.58 
 
 
97 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  31.58 
 
 
97 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  31.58 
 
 
99 aa  57  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  32 
 
 
101 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  31.58 
 
 
99 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1975  acyl carrier protein  39.19 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.166506  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3483  acyl carrier protein  34.85 
 
 
82 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.520778  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  33.33 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3512  acyl carrier protein  34.72 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410127  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0876  acyl carrier protein  30.67 
 
 
84 aa  55.1  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  38.36 
 
 
80 aa  54.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  36.84 
 
 
87 aa  54.7  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4379  acyl-carrier-protein  40.51 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00582273  normal  0.0972461 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  36.62 
 
 
82 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2207  acyl carrier protein  35.14 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000161202 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4810  acyl carrier protein  30.14 
 
 
82 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0303207  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  34.25 
 
 
84 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  39.13 
 
 
77 aa  52  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  36.62 
 
 
82 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2039  acyl carrier protein  37.7 
 
 
80 aa  51.2  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0051261  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  28.95 
 
 
101 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7056  acyl carrier protein  34.25 
 
 
79 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3380  acyl carrier protein  28.77 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0442067  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09300  acyl carrier protein  33.82 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421361  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2468  acyl carrier protein  33.33 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000407512  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3622  acyl carrier protein  28.77 
 
 
79 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000545579 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  27.4 
 
 
81 aa  48.9  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11374  acyl carrier protein  35.29 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  27.4 
 
 
81 aa  48.9  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1988  phosphopantetheine-binding  29.85 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44915  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0621  acyl carrier protein  38.6 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0305053  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2371  acyl carrier protein  41.07 
 
 
93 aa  47.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.131392  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4410  acyl carrier protein  31.17 
 
 
92 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2518  phosphopantetheine-binding  28.21 
 
 
83 aa  47.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2816  phosphopantetheine-binding protein  33.33 
 
 
86 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3460  acyl carrier protein  31.58 
 
 
81 aa  47  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712705 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  34.85 
 
 
74 aa  47  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12010  acyl carrier protein  31.08 
 
 
82 aa  47  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114572  normal  0.0939277 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  33.33 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0855  acyl carrier protein  39.29 
 
 
93 aa  45.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1724  phosphopantetheine-binding protein  27.59 
 
 
89 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.937419  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1771  acyl carrier protein  27.59 
 
 
89 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0123563  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1703  acyl carrier protein  27.59 
 
 
89 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0745924  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0847  acyl carrier protein  39.29 
 
 
93 aa  45.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1208  hypothetical protein  35.21 
 
 
80 aa  46.2  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000845225 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2117  acyl carrier protein  39.29 
 
 
92 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.307838  hitchhiker  0.00250783 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0944  acyl carrier protein  37.5 
 
 
79 aa  45.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000174331  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03230  polyketide synthase, putative (JCVI)  30.86 
 
 
2193 aa  44.7  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2359  acyl carrier protein  39.29 
 
 
105 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.701799  normal  0.0109662 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  36.36 
 
 
77 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  36.07 
 
 
75 aa  44.7  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0725  acyl carrier protein  31.58 
 
 
80 aa  44.3  0.0005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6811  phosphopantetheine-binding  27.4 
 
 
82 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  34.72 
 
 
82 aa  44.7  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0397  phosphopantetheine-binding  28.57 
 
 
91 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.823663  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3345  acyl carrier protein  29.73 
 
 
81 aa  44.3  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0503244  normal  0.362492 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  32.84 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2029  acyl carrier protein  39.29 
 
 
92 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  37.29 
 
 
77 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00792  acyl carrier protein  35.14 
 
 
81 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31440  acyl carrier protein  23.68 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.820176  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  36.36 
 
 
77 aa  42.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1160  acyl carrier protein  31.08 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000195346  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  36.36 
 
 
77 aa  42.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  33.33 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3922  acyl carrier protein  36.23 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0284  acyl carrier protein  31.51 
 
 
82 aa  42.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6611  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  29.73 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1320  acyl carrier protein  37.5 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1082  acyl carrier protein  31.88 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.325179  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  29.33 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  32.86 
 
 
77 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  30.56 
 
 
77 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0929  acyl carrier protein  33.78 
 
 
83 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0436  acyl carrier protein  35.59 
 
 
76 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.20002  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0052  AMP-dependent synthetase and ligase  36.54 
 
 
903 aa  41.6  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1741  acyl carrier protein  37.5 
 
 
95 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463216  normal  0.237762 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4016  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  39.58 
 
 
328 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.334558  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3062  acyl carrier protein  33.78 
 
 
83 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73924  normal  0.979198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1868  acyl carrier protein  35.71 
 
 
95 aa  41.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0363  acyl carrier protein  33.8 
 
 
78 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.878931  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1612  hypothetical protein  32 
 
 
81 aa  41.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00005517  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1263  acyl carrier protein  47.5 
 
 
93 aa  41.2  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2083  acyl carrier protein  35.38 
 
 
76 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000417197  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4854  acyl carrier protein  35.71 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.62131  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2415  phosphopantetheine-binding  37.74 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1517  phosphopantetheine-binding  30.67 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259778  normal  0.0737426 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  33.78 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  33.33 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  31.82 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1011  acyl carrier protein  31.33 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303772  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2417  phosphopantetheine-binding  38.78 
 
 
80 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0908  phosphopantetheine-binding protein  30.51 
 
 
88 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>