171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1868 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1868  acyl carrier protein  100 
 
 
95 aa  191  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4854  acyl carrier protein  98.95 
 
 
95 aa  190  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.62131  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5061  acyl carrier protein  95.6 
 
 
98 aa  179  9.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5008  acyl carrier protein  95.6 
 
 
98 aa  179  9.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.312305  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4548  acyl carrier protein  95.6 
 
 
98 aa  179  9.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00748175 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5019  acyl carrier protein  92.55 
 
 
102 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256894  normal  0.657506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1263  acyl carrier protein  86.02 
 
 
93 aa  163  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3522  acyl carrier protein  83.87 
 
 
93 aa  160  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1506  acyl carrier protein  84.95 
 
 
93 aa  160  7e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41568  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0855  acyl carrier protein  81.72 
 
 
93 aa  160  8.000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0847  acyl carrier protein  81.72 
 
 
93 aa  160  8.000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1246  acyl carrier protein  84.95 
 
 
93 aa  159  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.15129  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2371  acyl carrier protein  80.65 
 
 
93 aa  158  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.131392  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2233  acyl carrier protein  82.8 
 
 
93 aa  157  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3353  acyl carrier protein  82.8 
 
 
93 aa  157  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.53669  normal  0.0790473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2111  acyl carrier protein  82.8 
 
 
93 aa  157  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144779  normal  0.165327 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2090  acyl carrier protein  82.8 
 
 
93 aa  157  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1320  acyl carrier protein  77.42 
 
 
94 aa  152  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2029  acyl carrier protein  76.09 
 
 
92 aa  148  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2117  acyl carrier protein  77.17 
 
 
92 aa  148  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.307838  hitchhiker  0.00250783 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1741  acyl carrier protein  77.78 
 
 
95 aa  147  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463216  normal  0.237762 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2359  acyl carrier protein  78.65 
 
 
105 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.701799  normal  0.0109662 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0621  acyl carrier protein  73.12 
 
 
94 aa  142  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0305053  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  45.45 
 
 
78 aa  53.9  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  42.86 
 
 
78 aa  50.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  39.29 
 
 
78 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1975  acyl carrier protein  42.86 
 
 
79 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.166506  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0034  phosphopantetheine-binding  31.33 
 
 
100 aa  48.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1537  phosphopantetheine-binding  41.07 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.157391  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7056  acyl carrier protein  40 
 
 
79 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  37.18 
 
 
81 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  37.5 
 
 
78 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  39.29 
 
 
78 aa  47.4  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  41.07 
 
 
77 aa  47  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  37.5 
 
 
79 aa  47  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5387  acyl carrier protein  37.5 
 
 
78 aa  47  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  37.5 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0044  acyl carrier protein  30.43 
 
 
83 aa  46.2  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  37.5 
 
 
78 aa  47  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  40 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3460  acyl carrier protein  38.46 
 
 
81 aa  46.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712705 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0883  acyl carrier protein  40 
 
 
82 aa  47  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242851  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0424  hypothetical protein  35.48 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  39.29 
 
 
77 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  46.15 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  35.71 
 
 
78 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  44.9 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  33.33 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  33.93 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  35.71 
 
 
78 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  44.23 
 
 
74 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  39.29 
 
 
77 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  39.29 
 
 
77 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  39.66 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  38.46 
 
 
75 aa  45.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  39.29 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0400  hypothetical protein  33.87 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4861  phosphopantetheine-binding  31.15 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.830038  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  36.23 
 
 
77 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4413  phosphopantetheine-binding protein  33.33 
 
 
77 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864281  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  39.29 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  39.29 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0166  acyl carrier protein  39.62 
 
 
78 aa  44.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.317698  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0876  acyl carrier protein  38.78 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  39.29 
 
 
77 aa  44.3  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0498  acyl carrier protein  41.07 
 
 
78 aa  44.7  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  37.25 
 
 
6403 aa  44.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  35.59 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2659  acyl carrier protein, putative  42 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.70759  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1216  acyl carrier protein  37.5 
 
 
78 aa  43.9  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.686684 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  35.59 
 
 
78 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4067  acyl carrier protein  32.73 
 
 
82 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  40.82 
 
 
97 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  41.18 
 
 
101 aa  43.9  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  40.82 
 
 
97 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  40.82 
 
 
97 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  40.82 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1617  acyl carrier protein  36.84 
 
 
89 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.250547 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  35.59 
 
 
78 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10270  acyl carrier protein  40.82 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.167244 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2556  phosphopantetheine-binding  30.91 
 
 
293 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.369575  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1325  acyl carrier protein  37.74 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1873  acyl carrier protein  36.21 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107725  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  41.18 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2673  phosphopantetheine-binding  39.66 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37551  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  35.71 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  35.71 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0230  acyl carrier protein  33.33 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  39.66 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  39.29 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0417  acyl carrier protein  37.5 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  39.66 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  35.19 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1362  acyl carrier protein  33.96 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.915786  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  39.66 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  39.66 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  39.66 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  39.66 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  40 
 
 
74 aa  42.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3358  acyl carrier protein  35.71 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.304425  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>