More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2029 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2029  acyl carrier protein  100 
 
 		 92 aa  184  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1741  acyl carrier protein  95.65 
 
 		 95 aa  177  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463216  normal  0.237762 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2117  acyl carrier protein  94.57 
 
 		 92 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.307838  hitchhiker  0.00250783 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2359  acyl carrier protein  93.48 
 
 		 105 aa  175  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.701799  normal  0.0109662 
 
 
-
 
NC_004310  BR0855  acyl carrier protein  91.21 
 
 		 93 aa  169  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0847  acyl carrier protein  91.21 
 
 		 93 aa  169  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2371  acyl carrier protein  90.11 
 
 		 93 aa  167  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.131392  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1320  acyl carrier protein  89.13 
 
 		 94 aa  167  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0621  acyl carrier protein  80.22 
 
 		 94 aa  153  8e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0305053  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1263  acyl carrier protein  77.17 
 
 		 93 aa  152  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3522  acyl carrier protein  76.09 
 
 		 93 aa  149  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2233  acyl carrier protein  77.17 
 
 		 93 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1868  acyl carrier protein  76.09 
 
 		 95 aa  148  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4854  acyl carrier protein  76.09 
 
 		 95 aa  147  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.62131  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5008  acyl carrier protein  75.82 
 
 		 98 aa  147  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.312305  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5061  acyl carrier protein  75.82 
 
 		 98 aa  147  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4548  acyl carrier protein  75.82 
 
 		 98 aa  147  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00748175 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1246  acyl carrier protein  75.82 
 
 		 93 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.15129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3353  acyl carrier protein  75 
 
 		 93 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.53669  normal  0.0790473 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2090  acyl carrier protein  75 
 
 		 93 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1506  acyl carrier protein  75 
 
 		 93 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41568  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2111  acyl carrier protein  75 
 
 		 93 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144779  normal  0.165327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5019  acyl carrier protein  74.73 
 
 		 102 aa  144  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256894  normal  0.657506 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0424  hypothetical protein  43.66 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0400  hypothetical protein  42.25 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  50.94 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  57.69 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  47.27 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3460  acyl carrier protein  48 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712705 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  46 
 
 		 77 aa  53.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0044  acyl carrier protein  44.44 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0452  acyl carrier protein  47.17 
 
 		 88 aa  52.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  41.07 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  45.28 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 79 aa  51.2  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  50 
 
 		 74 aa  50.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0166  acyl carrier protein  45.28 
 
 		 78 aa  50.8  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.317698  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 78 aa  50.8  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  47.06 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5387  acyl carrier protein  41.07 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1496  acyl carrier protein  42.59 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0883  acyl carrier protein  49.09 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242851  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  47.06 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1416  acyl carrier protein  39.62 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.28944  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  48.98 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  39.66 
 
 		 80 aa  49.7  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1537  phosphopantetheine-binding  46.43 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.157391  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  41.07 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  41.07 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0908  phosphopantetheine-binding protein  33.72 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  44.64 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0493  acyl carrier protein  42.59 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  46.15 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  41.07 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  38.6 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0561  acyl carrier protein  38.18 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  38.6 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  41.07 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0196  acyl carrier protein  45.28 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  37.68 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1026  acyl carrier protein  40.32 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000177026  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  40.38 
 
 		 81 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9709  predicted protein  42.59 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.14468  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0468  acyl carrier protein  40.74 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  42.59 
 
 		 80 aa  47.4  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3914  acyl carrier protein  37.29 
 
 		 78 aa  47.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  42.59 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0436  acyl carrier protein  37.74 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.20002  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0285  acyl carrier protein  38.18 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0179  acyl carrier protein  43.4 
 
 		 78 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00024894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  38.98 
 
 		 79 aa  47  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  41.07 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  41.07 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0130  acyl carrier protein  43.4 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0263096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  41.67 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  41.67 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  41.67 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  41.07 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1362  acyl carrier protein  38.18 
 
 		 77 aa  47  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.915786  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0310  acyl carrier protein  46.94 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00336649  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  37.74 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  41.07 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0498  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0225  acyl carrier protein  34.55 
 
 		 81 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.623939  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2673  phosphopantetheine-binding  37.29 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  37.04 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0230  acyl carrier protein  37.74 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  41.07 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1361  acyl carrier protein  38.6 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000207547  normal  0.0506091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  39.29 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  42.31 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2493  acyl carrier protein  41.51 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  39.29 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0370442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>