268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3353 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3353  acyl carrier protein  100 
 
 		 93 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.53669  normal  0.0790473 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2090  acyl carrier protein  100 
 
 		 93 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2111  acyl carrier protein  98.92 
 
 		 93 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144779  normal  0.165327 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2233  acyl carrier protein  97.85 
 
 		 93 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1506  acyl carrier protein  96.77 
 
 		 93 aa  184  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41568  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1246  acyl carrier protein  95.7 
 
 		 93 aa  181  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.15129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3522  acyl carrier protein  93.55 
 
 		 93 aa  179  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1263  acyl carrier protein  91.4 
 
 		 93 aa  174  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1868  acyl carrier protein  82.8 
 
 		 95 aa  157  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4854  acyl carrier protein  82.8 
 
 		 95 aa  156  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.62131  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5061  acyl carrier protein  82.61 
 
 		 98 aa  155  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5008  acyl carrier protein  82.61 
 
 		 98 aa  155  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.312305  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4548  acyl carrier protein  82.61 
 
 		 98 aa  155  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00748175 
 
 
-
 
NC_004310  BR0855  acyl carrier protein  81.32 
 
 		 93 aa  153  8e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0847  acyl carrier protein  81.32 
 
 		 93 aa  153  8e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1320  acyl carrier protein  78.49 
 
 		 94 aa  152  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2371  acyl carrier protein  80.22 
 
 		 93 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.131392  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5019  acyl carrier protein  79.35 
 
 		 102 aa  150  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256894  normal  0.657506 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2117  acyl carrier protein  78.26 
 
 		 92 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.307838  hitchhiker  0.00250783 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2359  acyl carrier protein  77.17 
 
 		 105 aa  147  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.701799  normal  0.0109662 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2029  acyl carrier protein  75 
 
 		 92 aa  146  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1741  acyl carrier protein  74.19 
 
 		 95 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463216  normal  0.237762 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0621  acyl carrier protein  69.89 
 
 		 94 aa  137  4.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0305053  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  45.45 
 
 		 78 aa  57  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  41.07 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1537  phosphopantetheine-binding  42.86 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.157391  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  38.6 
 
 		 78 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  40.74 
 
 		 78 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  38.6 
 
 		 78 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  37.5 
 
 		 78 aa  50.1  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  40.74 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  33.93 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  46.15 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  37.5 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5387  acyl carrier protein  39.29 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0883  acyl carrier protein  39.66 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242851  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  39.62 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  37.5 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2659  acyl carrier protein, putative  46 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.70759  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3460  acyl carrier protein  38.46 
 
 		 81 aa  48.9  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712705 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  38.89 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  39.29 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  35.71 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  33.96 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  36.23 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  38.89 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  37.5 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0424  hypothetical protein  39.29 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1181  acyl carrier protein  42.59 
 
 		 76 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185913  decreased coverage  0.00116588 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  35.59 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4067  acyl carrier protein  31.82 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  35.59 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1496  acyl carrier protein  38.89 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0400  hypothetical protein  37.5 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  35.59 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  37.5 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  37.5 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0713  acyl carrier protein  32.5 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000031745  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  37.5 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  38.6 
 
 		 76 aa  47  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0034  phosphopantetheine-binding  34.48 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  46.15 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2673  phosphopantetheine-binding  32.97 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  37.5 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0493  acyl carrier protein  38.89 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  37.5 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  39.22 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  37.5 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1975  acyl carrier protein  42.31 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.166506  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1416  acyl carrier protein  33.96 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.28944  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  37.93 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1220  phosphopantetheine-binding  37.63 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.493344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0166  acyl carrier protein  39.62 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.317698  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0468  acyl carrier protein  37.04 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  39.22 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  33.9 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0285  acyl carrier protein  32.73 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  33.9 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  37.04 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  32.14 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1216  acyl carrier protein  35.71 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.686684 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7056  acyl carrier protein  38.18 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  37.5 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0408  acyl carrier protein  37.29 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.442287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  33.9 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0498  acyl carrier protein  39.29 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  37.25 
 
 		 6403 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  33.9 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1026  acyl carrier protein  35.48 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000177026  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2565  acyl carrier protein  34.43 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  36.54 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0044  acyl carrier protein  31.52 
 
 		 83 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3914  acyl carrier protein  33.93 
 
 		 78 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  32.14 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  44.9 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 74 aa  45.1  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0401  acyl carrier protein  37.29 
 
 		 79 aa  45.1  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338401  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2556  phosphopantetheine-binding  29.09 
 
 		 293 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.369575  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  32.2 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1362  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 77 aa  44.3  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.915786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>