126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4548 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4548  acyl carrier protein  100 
 
 		 98 aa  197  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00748175 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5061  acyl carrier protein  100 
 
 		 98 aa  197  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5008  acyl carrier protein  100 
 
 		 98 aa  197  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.312305  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5019  acyl carrier protein  91.09 
 
 		 102 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256894  normal  0.657506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1868  acyl carrier protein  95.6 
 
 		 95 aa  179  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4854  acyl carrier protein  95.6 
 
 		 95 aa  179  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.62131  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1263  acyl carrier protein  82.61 
 
 		 93 aa  157  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3522  acyl carrier protein  81.52 
 
 		 93 aa  157  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3353  acyl carrier protein  82.61 
 
 		 93 aa  155  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.53669  normal  0.0790473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2111  acyl carrier protein  82.61 
 
 		 93 aa  155  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144779  normal  0.165327 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2090  acyl carrier protein  82.61 
 
 		 93 aa  155  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1506  acyl carrier protein  82.61 
 
 		 93 aa  156  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41568  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1246  acyl carrier protein  82.61 
 
 		 93 aa  155  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.15129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2233  acyl carrier protein  82.61 
 
 		 93 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0855  acyl carrier protein  78.26 
 
 		 93 aa  154  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1320  acyl carrier protein  78.26 
 
 		 94 aa  154  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0847  acyl carrier protein  78.26 
 
 		 93 aa  154  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2371  acyl carrier protein  77.17 
 
 		 93 aa  152  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.131392  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2359  acyl carrier protein  78.02 
 
 		 105 aa  148  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.701799  normal  0.0109662 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2117  acyl carrier protein  78.02 
 
 		 92 aa  148  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.307838  hitchhiker  0.00250783 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1741  acyl carrier protein  76.09 
 
 		 95 aa  147  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463216  normal  0.237762 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2029  acyl carrier protein  75.82 
 
 		 92 aa  147  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0621  acyl carrier protein  69.57 
 
 		 94 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0305053  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  45.45 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0034  phosphopantetheine-binding  34.94 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1975  acyl carrier protein  42.11 
 
 		 79 aa  50.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.166506  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  41.51 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  37.04 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  42.31 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  37.04 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1537  phosphopantetheine-binding  41.07 
 
 		 84 aa  47.4  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.157391  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7056  acyl carrier protein  39.62 
 
 		 79 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  44.9 
 
 		 87 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  41.51 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  44.23 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  46.15 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0436  acyl carrier protein  37.5 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.20002  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3460  acyl carrier protein  38.46 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712705 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  33.96 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0883  acyl carrier protein  41.18 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242851  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0424  hypothetical protein  38.6 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  45.65 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0876  acyl carrier protein  38.78 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5387  acyl carrier protein  38 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0166  acyl carrier protein  37.29 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.317698  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0400  hypothetical protein  36.84 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  40.82 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4413  phosphopantetheine-binding protein  32.58 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  40.82 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  40.82 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  41.18 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  39.22 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  39.22 
 
 		 79 aa  45.1  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  38.46 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  41.18 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  36.36 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1325  acyl carrier protein  38.98 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10270  acyl carrier protein  35.59 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.167244 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2659  acyl carrier protein, putative  39.34 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.70759  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2556  phosphopantetheine-binding  31.37 
 
 		 293 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.369575  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  41.18 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2673  phosphopantetheine-binding  42.11 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1416  acyl carrier protein  33.96 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.28944  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  41.18 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  35.29 
 
 		 6403 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0044  acyl carrier protein  31.4 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  35.19 
 
 		 81 aa  43.5  0.0009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1220  phosphopantetheine-binding  35.48 
 
 		 85 aa  42.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.493344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4861  phosphopantetheine-binding  32.76 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.830038  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  35.71 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1362  acyl carrier protein  34.55 
 
 		 77 aa  42.7  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.915786  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  30.51 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  39.22 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  37.29 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  37.7 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  39.34 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2147  phosphopantetheine-binding  30.77 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.108837  normal  0.507258 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  37.25 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  37.74 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1181  acyl carrier protein  38.89 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185913  decreased coverage  0.00116588 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  39.22 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  39.22 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  34.48 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  34.48 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0196  acyl carrier protein  39.62 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  38.78 
 
 		 101 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  37.04 
 
 		 76 aa  41.6  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  39.22 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1496  acyl carrier protein  38.89 
 
 		 77 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0230  acyl carrier protein  33.96 
 
 		 79 aa  42  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  40 
 
 		 74 aa  42  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  30.91 
 
 		 77 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0130  acyl carrier protein  37.74 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0263096  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3122  phosphopantetheine-binding protein  31.82 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.172953  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  35.19 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0179  acyl carrier protein  37.74 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00024894  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0493  acyl carrier protein  38.89 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  35.59 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4067  acyl carrier protein  30.91 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>