More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5387 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5387  acyl carrier protein  100 
 
 		 78 aa  151  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1836  acyl carrier protein  70.59 
 
 		 76 aa  99  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000576824  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  64.38 
 
 		 77 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  63.77 
 
 		 78 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  64 
 
 		 78 aa  95.1  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  63.77 
 
 		 78 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  62.16 
 
 		 79 aa  94.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  61.33 
 
 		 78 aa  94.4  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  60.27 
 
 		 78 aa  94  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3132  acyl carrier protein  60.81 
 
 		 78 aa  94  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1615  acyl carrier protein  56.76 
 
 		 77 aa  94  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  61.64 
 
 		 77 aa  93.6  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  64.47 
 
 		 78 aa  93.6  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1873  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 78 aa  93.6  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  64.79 
 
 		 78 aa  92.8  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  57.33 
 
 		 82 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0894  acyl carrier protein  64.47 
 
 		 79 aa  93.2  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0694526 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  62.16 
 
 		 79 aa  93.2  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3358  acyl carrier protein  61.33 
 
 		 79 aa  92.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.304425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  54.55 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 79 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  63.51 
 
 		 78 aa  92.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  56.16 
 
 		 81 aa  92.8  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 79 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 79 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  62.16 
 
 		 78 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  62.16 
 
 		 78 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  62.16 
 
 		 78 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  60.56 
 
 		 76 aa  91.7  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  51.95 
 
 		 83 aa  91.7  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2000  acyl carrier protein  60 
 
 		 76 aa  91.3  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  58.9 
 
 		 78 aa  91.3  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  59.46 
 
 		 77 aa  91.7  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  58.9 
 
 		 110 aa  90.9  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1504  acyl carrier protein  55.84 
 
 		 78 aa  91.3  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0070299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  59.72 
 
 		 77 aa  90.9  6e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2298  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 106 aa  90.5  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  56 
 
 		 82 aa  90.5  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  56 
 
 		 79 aa  90.5  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  62.16 
 
 		 79 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2736  acyl carrier protein  60.56 
 
 		 80 aa  90.1  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.875192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  55.26 
 
 		 77 aa  89.4  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  63.38 
 
 		 80 aa  89.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1610  Acyl carrier protein (ACP)  66.15 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  60 
 
 		 75 aa  89.7  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  57.33 
 
 		 81 aa  89.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  55.26 
 
 		 77 aa  89.4  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  57.33 
 
 		 78 aa  88.6  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 78 aa  89  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 78 aa  89  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 78 aa  89  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1201  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 78 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.576937  hitchhiker  0.00368899 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1058  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 78 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  63.38 
 
 		 80 aa  89  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1090  acyl carrier protein  56.16 
 
 		 77 aa  89  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.343466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  55.84 
 
 		 82 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2018  Acyl carrier protein (ACP)  59.21 
 
 		 78 aa  88.2  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000498687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0713  acyl carrier protein  55.84 
 
 		 78 aa  88.2  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000031745  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0417  acyl carrier protein  58.67 
 
 		 77 aa  88.2  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  60.87 
 
 		 73 aa  88.6  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  55.84 
 
 		 82 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0746  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 78 aa  87.8  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.746533  normal  0.50277 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1878  acyl carrier protein  58.9 
 
 		 77 aa  87.8  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0843624  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  56 
 
 		 79 aa  87.4  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3105  acyl carrier protein  58.9 
 
 		 77 aa  87.8  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000128081  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  56 
 
 		 78 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1157  acyl carrier protein  58.9 
 
 		 77 aa  87.8  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.917954 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  57.53 
 
 		 78 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  58.67 
 
 		 77 aa  87.4  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1687  acyl carrier protein  56 
 
 		 78 aa  87.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000299329  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1602  acyl carrier protein  60.27 
 
 		 77 aa  87.4  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000714682  normal  0.960802 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1579  acyl carrier protein  56 
 
 		 78 aa  87.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.86341e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  61.97 
 
 		 80 aa  87.4  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  57.53 
 
 		 78 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3498  acyl carrier protein  56 
 
 		 78 aa  87.4  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503689  hitchhiker  0.00947262 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0285  acyl carrier protein  67.16 
 
 		 77 aa  87  7e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  59.46 
 
 		 78 aa  87  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  59.46 
 
 		 78 aa  87  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  56 
 
 		 78 aa  87  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  58.33 
 
 		 79 aa  87  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  56.94 
 
 		 79 aa  87  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  54.79 
 
 		 77 aa  87  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  53.33 
 
 		 77 aa  87  8e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  56.16 
 
 		 78 aa  87  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1137  acyl carrier protein  56.58 
 
 		 78 aa  86.7  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1319  acyl carrier protein  56.58 
 
 		 78 aa  86.7  9e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.346066  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  54.67 
 
 		 78 aa  86.7  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  56 
 
 		 78 aa  87  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0498  acyl carrier protein  57.89 
 
 		 78 aa  86.3  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  54.79 
 
 		 77 aa  86.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1530  acyl carrier protein  61.84 
 
 		 78 aa  86.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129893  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  56 
 
 		 78 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  56.94 
 
 		 79 aa  86.3  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  56.94 
 
 		 79 aa  86.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0561  acyl carrier protein  64.18 
 
 		 77 aa  86.3  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  56.94 
 
 		 79 aa  86.7  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  54.79 
 
 		 77 aa  86.7  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2493  acyl carrier protein  55.71 
 
 		 78 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  58.44 
 
 		 77 aa  86.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1866  acyl carrier protein  56.16 
 
 		 77 aa  86.7  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00815396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>