More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1137 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1137  acyl carrier protein  100 
 
 
78 aa  153  9e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03150  acyl carrier protein  97.4 
 
 
77 aa  147  5e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1319  acyl carrier protein  93.59 
 
 
78 aa  144  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.346066  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4192  acyl carrier protein  83.33 
 
 
78 aa  130  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  0.675617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0363  acyl carrier protein  80.77 
 
 
78 aa  127  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.878931  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1398  acyl carrier protein  78.21 
 
 
78 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3914  acyl carrier protein  75.64 
 
 
78 aa  119  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5148  acyl carrier protein  76 
 
 
79 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.166001 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  74.32 
 
 
82 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1058  acyl carrier protein  63.64 
 
 
78 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1201  acyl carrier protein  63.64 
 
 
78 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.576937  hitchhiker  0.00368899 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  64.47 
 
 
78 aa  100  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2181  acyl carrier protein  64.47 
 
 
77 aa  99.8  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1530  acyl carrier protein  62.34 
 
 
78 aa  99.8  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129893  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1765  acyl carrier protein  62.82 
 
 
78 aa  99  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  66.67 
 
 
77 aa  99  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1627  acyl carrier protein  64.94 
 
 
77 aa  99  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0810267  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  63.01 
 
 
82 aa  98.6  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0894  acyl carrier protein  60.53 
 
 
79 aa  98.2  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0694526 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  63.01 
 
 
82 aa  98.6  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0746  acyl carrier protein  62.34 
 
 
78 aa  98.6  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.746533  normal  0.50277 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  64.47 
 
 
77 aa  97.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  64.47 
 
 
77 aa  97.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  63.16 
 
 
77 aa  97.8  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  64.47 
 
 
77 aa  97.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2298  acyl carrier protein  60.53 
 
 
106 aa  97.4  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  64.47 
 
 
77 aa  97.4  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  62.34 
 
 
79 aa  97.1  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  63.64 
 
 
77 aa  96.3  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  63.64 
 
 
78 aa  96.3  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0713  acyl carrier protein  60.81 
 
 
78 aa  96.3  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000031745  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  61.33 
 
 
79 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  63.64 
 
 
77 aa  96.3  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  65.33 
 
 
77 aa  96.7  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  61.84 
 
 
78 aa  95.9  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  61.84 
 
 
78 aa  95.9  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  61.04 
 
 
79 aa  95.5  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  61.84 
 
 
78 aa  95.9  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  62.34 
 
 
78 aa  95.5  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  64.38 
 
 
79 aa  95.9  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  61.33 
 
 
77 aa  95.1  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  63.01 
 
 
79 aa  94.7  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  67.11 
 
 
78 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  67.11 
 
 
78 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  67.11 
 
 
78 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  58.44 
 
 
78 aa  94.4  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  60.81 
 
 
77 aa  94  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1294  acyl carrier protein  62.16 
 
 
77 aa  94  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0897377  hitchhiker  0.00000000000000136256 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3892  acyl carrier protein  62.16 
 
 
77 aa  94  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3701  acyl carrier protein  62.16 
 
 
77 aa  94  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3591  acyl carrier protein  62.16 
 
 
77 aa  94  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3609  acyl carrier protein  62.16 
 
 
77 aa  94  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  61.33 
 
 
84 aa  94  6e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3988  acyl carrier protein  62.16 
 
 
77 aa  94  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.168963  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  61.64 
 
 
79 aa  94  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3864  acyl carrier protein  62.16 
 
 
77 aa  94  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3997e-48 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  64.38 
 
 
110 aa  94  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  63.01 
 
 
79 aa  94  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3898  acyl carrier protein  62.16 
 
 
77 aa  94  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000161668  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3949  acyl carrier protein  62.16 
 
 
77 aa  94  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.457007  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2502  acyl carrier protein  62.16 
 
 
77 aa  94  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000438987  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0498  acyl carrier protein  63.16 
 
 
78 aa  93.6  7e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1258  acyl carrier protein  60.26 
 
 
79 aa  93.6  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  63.01 
 
 
79 aa  93.6  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1580  acyl carrier protein  61.33 
 
 
84 aa  93.2  9e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000805484  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3673  acyl carrier protein  60.81 
 
 
77 aa  93.6  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173328  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  61.64 
 
 
79 aa  93.2  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  58.9 
 
 
79 aa  93.2  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  62.34 
 
 
78 aa  92.8  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1208  hypothetical protein  62.67 
 
 
80 aa  93.2  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000845225 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2018  Acyl carrier protein (ACP)  57.69 
 
 
78 aa  92.8  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000498687  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1687  acyl carrier protein  58.97 
 
 
79 aa  92  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3132  acyl carrier protein  60 
 
 
78 aa  92  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0417  acyl carrier protein  63.51 
 
 
77 aa  92.8  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2978  acyl carrier protein  58.97 
 
 
79 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.702686  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3483  acyl carrier protein  58.97 
 
 
79 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.057924  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  60.27 
 
 
83 aa  92.4  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3819  acyl carrier protein  58.97 
 
 
79 aa  92  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542696  normal  0.0672791 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2468  acyl carrier protein  58.97 
 
 
79 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2301  acyl carrier protein  58.97 
 
 
79 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0385608  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2352  acyl carrier protein  58.97 
 
 
79 aa  92  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  60.27 
 
 
81 aa  91.3  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1504  acyl carrier protein  60.27 
 
 
78 aa  91.3  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0070299  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  61.64 
 
 
78 aa  91.3  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  60.27 
 
 
78 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2000  acyl carrier protein  62.16 
 
 
76 aa  90.9  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0174  acyl carrier protein  61.33 
 
 
80 aa  90.9  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2502  acyl carrier protein  62.16 
 
 
78 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000398484  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  61.33 
 
 
78 aa  90.9  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1345  acyl carrier protein  57.89 
 
 
79 aa  90.9  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.095592  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2807  acyl carrier protein  62.16 
 
 
78 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000875833  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1923  acyl carrier protein  59.74 
 
 
79 aa  90.9  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000792988  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2519  acyl carrier protein  58.67 
 
 
79 aa  90.9  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4067  acyl carrier protein  60.27 
 
 
82 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2493  acyl carrier protein  60.27 
 
 
77 aa  89.4  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155434  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3358  acyl carrier protein  59.46 
 
 
79 aa  90.1  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.304425  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2292  acyl carrier protein  60.27 
 
 
77 aa  89.4  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000308066  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1588  acyl carrier protein  62.16 
 
 
78 aa  89.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000112562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>