More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1836 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1836  acyl carrier protein  100 
 
 		 76 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000576824  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1610  Acyl carrier protein (ACP)  82.43 
 
 		 90 aa  116  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0285  acyl carrier protein  75.34 
 
 		 77 aa  106  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0493  acyl carrier protein  69.74 
 
 		 77 aa  104  3e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0468  acyl carrier protein  68.42 
 
 		 77 aa  104  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1362  acyl carrier protein  68.42 
 
 		 77 aa  104  5e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.915786  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0561  acyl carrier protein  69.86 
 
 		 77 aa  103  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1496  acyl carrier protein  67.11 
 
 		 77 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0230  acyl carrier protein  68.49 
 
 		 79 aa  99.8  1e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5387  acyl carrier protein  70.59 
 
 		 78 aa  99  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1181  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 76 aa  97.8  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185913  decreased coverage  0.00116588 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  70.42 
 
 		 82 aa  96.7  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  70.42 
 
 		 82 aa  96.7  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  67.14 
 
 		 78 aa  95.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  65.71 
 
 		 79 aa  94  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 76 aa  93.2  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  66.67 
 
 		 79 aa  93.2  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  60.27 
 
 		 83 aa  92  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  67.14 
 
 		 78 aa  92  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1633  acyl carrier protein  61.64 
 
 		 83 aa  91.7  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  65.28 
 
 		 80 aa  90.9  5e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  65.28 
 
 		 103 aa  90.9  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  65.71 
 
 		 78 aa  90.9  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  68.12 
 
 		 81 aa  90.5  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1923  acyl carrier protein  67.14 
 
 		 79 aa  90.5  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000792988  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0066  acyl carrier protein  61.33 
 
 		 76 aa  90.1  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3498  acyl carrier protein  65.71 
 
 		 78 aa  90.5  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503689  hitchhiker  0.00947262 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1579  acyl carrier protein  65.71 
 
 		 78 aa  90.5  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.86341e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  66.67 
 
 		 110 aa  90.1  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  66.67 
 
 		 79 aa  90.5  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  62.16 
 
 		 74 aa  90.1  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1687  acyl carrier protein  65.71 
 
 		 78 aa  90.5  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000299329  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  60.27 
 
 		 75 aa  90.1  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  65.28 
 
 		 80 aa  90.1  9e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  60 
 
 		 75 aa  90.1  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0507  acyl carrier protein  56.58 
 
 		 77 aa  89.4  1e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0583644  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  65.22 
 
 		 78 aa  89.4  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  55.41 
 
 		 74 aa  89.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  56.58 
 
 		 77 aa  89.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  64.79 
 
 		 79 aa  89.4  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2736  acyl carrier protein  61.43 
 
 		 80 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.875192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1866  acyl carrier protein  66.67 
 
 		 77 aa  89.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00815396  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1041  acyl carrier protein  70.49 
 
 		 77 aa  89.4  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000252182  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  58.9 
 
 		 73 aa  89.4  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  55.26 
 
 		 77 aa  89  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  64.29 
 
 		 78 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  60 
 
 		 79 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  65.22 
 
 		 78 aa  89  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  60 
 
 		 79 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1602  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 77 aa  89.4  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00127335  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  60 
 
 		 79 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01090  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000166866  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2553  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526358  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  63.01 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2507  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996587  hitchhiker  0.000000169384 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1588  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000112562  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  63.77 
 
 		 78 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1310  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000174722  decreased coverage  4.37915e-18 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2033  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000123338  hitchhiker  0.00000256014 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1416  acyl carrier protein  57.89 
 
 		 76 aa  88.6  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.28944  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1548  Acyl carrier protein (ACP)  65.67 
 
 		 77 aa  88.6  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.079585  normal  0.066745 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1624  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000729948  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1215  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000103813  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  63.01 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01098  hypothetical protein  62.86 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000144532  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1504  acyl carrier protein  65.22 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0070299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1266  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000383773  normal  0.0632427 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1990  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274294  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1216  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.59624e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2230  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.78439e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1473  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000839248  hitchhiker  0.00000000000000262365 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2173  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000401427  hitchhiker  0.000000000000202194 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1295  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000656136  decreased coverage  3.5580799999999995e-20 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2000  acyl carrier protein  65.22 
 
 		 76 aa  87.8  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5351  acyl carrier protein  65.22 
 
 		 78 aa  87.8  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  64.29 
 
 		 78 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  63.89 
 
 		 80 aa  88.2  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  68.18 
 
 		 78 aa  87.8  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1615  acyl carrier protein  61.43 
 
 		 77 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 78 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  65.22 
 
 		 79 aa  88.2  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17331  acyl carrier protein (ACP)  65.28 
 
 		 80 aa  87.8  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  64.29 
 
 		 78 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  63.89 
 
 		 80 aa  88.2  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2018  Acyl carrier protein (ACP)  65.71 
 
 		 78 aa  87.4  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000498687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  61.11 
 
 		 82 aa  87.8  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0713  acyl carrier protein  63.77 
 
 		 78 aa  87.8  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000031745  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1609  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 78 aa  87.4  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000323844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  56.76 
 
 		 78 aa  87.4  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  62.5 
 
 		 78 aa  87.4  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1580  acyl carrier protein  63.77 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000805484  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  68.18 
 
 		 78 aa  87.4  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  65.67 
 
 		 77 aa  87.4  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  59.72 
 
 		 80 aa  87.4  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  63.77 
 
 		 81 aa  87  7e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  63.77 
 
 		 84 aa  87  8e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1090  acyl carrier protein  65.15 
 
 		 77 aa  87  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.343466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  63.77 
 
 		 79 aa  86.7  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  63.77 
 
 		 77 aa  86.7  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 78 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>