More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1615 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1615  acyl carrier protein  100 
 
 		 77 aa  144  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3099  acyl carrier protein  83.78 
 
 		 76 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179771 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1852  acyl carrier protein  83.78 
 
 		 76 aa  116  9e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2430  acyl carrier protein  83.78 
 
 		 76 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000123335  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0066  acyl carrier protein  75.34 
 
 		 76 aa  105  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  67.57 
 
 		 79 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  67.57 
 
 		 79 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  67.57 
 
 		 79 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  64.86 
 
 		 76 aa  98.6  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  67.11 
 
 		 78 aa  98.6  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1416  acyl carrier protein  72.46 
 
 		 76 aa  97.8  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.28944  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  64.94 
 
 		 79 aa  98.2  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2000  acyl carrier protein  68.92 
 
 		 76 aa  97.4  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2736  acyl carrier protein  64.47 
 
 		 80 aa  97.4  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.875192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  63.64 
 
 		 77 aa  97.4  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  64.94 
 
 		 78 aa  97.4  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  67.53 
 
 		 78 aa  97.4  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  67.12 
 
 		 79 aa  96.7  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  61.04 
 
 		 78 aa  95.9  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  63.64 
 
 		 78 aa  96.3  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 77 aa  96.3  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3498  acyl carrier protein  68.49 
 
 		 78 aa  95.1  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503689  hitchhiker  0.00947262 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 77 aa  95.9  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  67.12 
 
 		 110 aa  95.1  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1717  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 77 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515668  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  65.79 
 
 		 84 aa  95.5  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1687  acyl carrier protein  68.49 
 
 		 78 aa  95.1  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000299329  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1720  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 77 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138911  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 77 aa  95.9  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2572  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 77 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000656295  hitchhiker  0.00274043 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 77 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000614435  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2395  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 77 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000802043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2465  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 77 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1579  acyl carrier protein  68.49 
 
 		 78 aa  95.1  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.86341e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3892  acyl carrier protein  66.22 
 
 		 77 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3701  acyl carrier protein  66.22 
 
 		 77 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3591  acyl carrier protein  66.22 
 
 		 77 aa  95.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3609  acyl carrier protein  66.22 
 
 		 77 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1351  acyl carrier protein  64.86 
 
 		 82 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1347  acyl carrier protein  64.86 
 
 		 82 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3898  acyl carrier protein  66.22 
 
 		 77 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000161668  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3864  acyl carrier protein  66.22 
 
 		 77 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3997e-48 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3949  acyl carrier protein  66.22 
 
 		 77 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.457007  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3988  acyl carrier protein  66.22 
 
 		 77 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.168963  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2502  acyl carrier protein  66.22 
 
 		 77 aa  95.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000438987  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1604  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 77 aa  95.1  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000038664  decreased coverage  0.000139314 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1294  acyl carrier protein  66.22 
 
 		 77 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0897377  hitchhiker  0.00000000000000136256 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1090  acyl carrier protein  64.38 
 
 		 77 aa  95.1  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.343466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1923  acyl carrier protein  66.23 
 
 		 79 aa  94.7  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000792988  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  64.38 
 
 		 82 aa  94.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  64.38 
 
 		 82 aa  94.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  67.12 
 
 		 81 aa  94.7  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  65.75 
 
 		 79 aa  94.7  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  67.12 
 
 		 77 aa  94.4  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3673  acyl carrier protein  64.86 
 
 		 77 aa  94.4  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173328  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  67.12 
 
 		 77 aa  94.4  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  64.86 
 
 		 78 aa  94.4  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 77 aa  94.4  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5387  acyl carrier protein  56.76 
 
 		 78 aa  94  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1580  acyl carrier protein  64.47 
 
 		 84 aa  94  7e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000805484  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  65.75 
 
 		 78 aa  93.6  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1866  acyl carrier protein  65.75 
 
 		 77 aa  93.6  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00815396  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  64.38 
 
 		 79 aa  93.6  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  62.34 
 
 		 78 aa  93.2  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  65.75 
 
 		 78 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  64.38 
 
 		 78 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  64.47 
 
 		 77 aa  92.8  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  59.21 
 
 		 83 aa  92.8  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1058  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 78 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1201  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 78 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.576937  hitchhiker  0.00368899 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  64.94 
 
 		 79 aa  93.2  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  65.75 
 
 		 78 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  66.2 
 
 		 78 aa  93.2  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  64.38 
 
 		 79 aa  92.8  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0363  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 78 aa  92  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.878931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1530  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 78 aa  92  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129893  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3831  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 78 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  60.27 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3358  acyl carrier protein  62.16 
 
 		 79 aa  92  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.304425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  64.38 
 
 		 78 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2623  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 77 aa  91.7  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188634  unclonable  0.0000000000890491 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2298  acyl carrier protein  64.38 
 
 		 77 aa  91.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00108603  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  66.2 
 
 		 81 aa  92  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2292  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 77 aa  91.7  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000308066  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2493  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 77 aa  91.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155434  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  64.38 
 
 		 79 aa  91.7  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1500  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 77 aa  91.7  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000077006  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1873  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 78 aa  91.7  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107725  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2553  acyl carrier protein  65.75 
 
 		 78 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526358  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2033  acyl carrier protein  65.75 
 
 		 78 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000123338  hitchhiker  0.00000256014 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  60.53 
 
 		 78 aa  91.3  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1310  acyl carrier protein  65.75 
 
 		 78 aa  91.7  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000174722  decreased coverage  4.37915e-18 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2173  acyl carrier protein  65.75 
 
 		 78 aa  91.7  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000401427  hitchhiker  0.000000000000202194 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2230  acyl carrier protein  65.75 
 
 		 78 aa  91.7  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.78439e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0894  acyl carrier protein  60.81 
 
 		 79 aa  91.3  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0694526 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0746  acyl carrier protein  59.74 
 
 		 78 aa  91.3  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.746533  normal  0.50277 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1295  acyl carrier protein  65.75 
 
 		 78 aa  91.7  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000656136  decreased coverage  3.5580799999999995e-20 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2507  acyl carrier protein  65.75 
 
 		 78 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996587  hitchhiker  0.000000169384 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1473  acyl carrier protein  65.75 
 
 		 78 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000839248  hitchhiker  0.00000000000000262365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>