266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1741 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1741  acyl carrier protein  100 
 
 		 95 aa  191  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463216  normal  0.237762 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2359  acyl carrier protein  95.7 
 
 		 105 aa  179  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.701799  normal  0.0109662 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2029  acyl carrier protein  95.65 
 
 		 92 aa  177  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2117  acyl carrier protein  94.57 
 
 		 92 aa  175  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.307838  hitchhiker  0.00250783 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0847  acyl carrier protein  90.32 
 
 		 93 aa  170  6.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0855  acyl carrier protein  90.32 
 
 		 93 aa  170  6.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2371  acyl carrier protein  89.25 
 
 		 93 aa  168  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.131392  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1320  acyl carrier protein  88.17 
 
 		 94 aa  166  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1263  acyl carrier protein  76.34 
 
 		 93 aa  151  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0621  acyl carrier protein  81.61 
 
 		 94 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0305053  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3522  acyl carrier protein  75.27 
 
 		 93 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2233  acyl carrier protein  76.34 
 
 		 93 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1868  acyl carrier protein  77.78 
 
 		 95 aa  147  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5008  acyl carrier protein  76.09 
 
 		 98 aa  147  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.312305  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5061  acyl carrier protein  76.09 
 
 		 98 aa  147  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4548  acyl carrier protein  76.09 
 
 		 98 aa  147  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00748175 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4854  acyl carrier protein  77.78 
 
 		 95 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.62131  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3353  acyl carrier protein  74.19 
 
 		 93 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.53669  normal  0.0790473 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2090  acyl carrier protein  74.19 
 
 		 93 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1506  acyl carrier protein  74.19 
 
 		 93 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41568  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1246  acyl carrier protein  75.82 
 
 		 93 aa  144  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.15129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2111  acyl carrier protein  74.19 
 
 		 93 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144779  normal  0.165327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5019  acyl carrier protein  75 
 
 		 102 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256894  normal  0.657506 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0424  hypothetical protein  43.42 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0400  hypothetical protein  42.11 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  48.21 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3460  acyl carrier protein  44.83 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712705 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  55.77 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  45.45 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0166  acyl carrier protein  47.17 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.317698  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1416  acyl carrier protein  41.51 
 
 		 76 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.28944  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1496  acyl carrier protein  44.44 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  51.02 
 
 		 74 aa  51.2  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  43.1 
 
 		 80 aa  50.8  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  48.08 
 
 		 80 aa  50.8  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  44 
 
 		 77 aa  50.4  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0196  acyl carrier protein  47.17 
 
 		 79 aa  50.1  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  43.1 
 
 		 80 aa  50.4  0.000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1537  phosphopantetheine-binding  42.19 
 
 		 84 aa  50.1  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.157391  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0452  acyl carrier protein  45.28 
 
 		 88 aa  50.4  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0493  acyl carrier protein  44.44 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  42.86 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0468  acyl carrier protein  42.59 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0561  acyl carrier protein  40 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0908  phosphopantetheine-binding protein  34.88 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  37.7 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  44.23 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0130  acyl carrier protein  45.28 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0263096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0883  acyl carrier protein  49.09 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242851  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5387  acyl carrier protein  42 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  38.6 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0179  acyl carrier protein  45.28 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00024894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0285  acyl carrier protein  40 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1362  acyl carrier protein  40 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.915786  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  38.6 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  48.08 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0044  acyl carrier protein  43.86 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2565  acyl carrier protein  47.27 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0230  acyl carrier protein  39.62 
 
 		 79 aa  47.8  0.00006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2493  acyl carrier protein  43.4 
 
 		 78 aa  47.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  39.66 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  39.66 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0174  acyl carrier protein  41.67 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  45.1 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  45.1 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  39.29 
 
 		 78 aa  47.4  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  32.76 
 
 		 83 aa  47  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  37.93 
 
 		 80 aa  47  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  41.67 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  41.67 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  43.14 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  41.67 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  37.5 
 
 		 77 aa  47  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0401  acyl carrier protein  45.28 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338401  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17331  acyl carrier protein (ACP)  41.38 
 
 		 80 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9709  predicted protein  42.59 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.14468  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0408  acyl carrier protein  45.28 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.442287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  39.68 
 
 		 77 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3122  phosphopantetheine-binding protein  38.98 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.172953  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0918  acyl carrier protein  43.4 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.150298  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1053  acyl carrier protein  43.4 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2262  acyl carrier protein  43.4 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033873  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0983  acyl carrier protein  43.4 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415355  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  39.66 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  41.51 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  41.51 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3287  phosphopantetheine-binding  41.07 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31338 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2427  acyl carrier protein  43.4 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  38.46 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  42.59 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  45.1 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  43.4 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  41.51 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  41.51 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  43.14 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  41.51 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  41.51 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  41.51 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  41.51 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31440  acyl carrier protein  36.54 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.820176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>