64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3287 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3287  phosphopantetheine-binding  100 
 
 
87 aa  174  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.31338 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0765  phosphopantetheine-binding  40 
 
 
87 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321905  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2594  phosphopantetheine-binding  39.51 
 
 
81 aa  66.2  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.79488  hitchhiker  0.000628646 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2709  phosphopantetheine-binding  33.72 
 
 
88 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169236  hitchhiker  0.0000263676 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0384  phosphopantetheine-binding  37.5 
 
 
83 aa  60.5  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0507  phosphopantetheine-binding  34.18 
 
 
80 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4648  hypothetical protein  38.16 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3572  hypothetical protein  38.16 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.141055 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3604  phosphopantetheine-binding protein  36.84 
 
 
80 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1416  hypothetical protein  35.53 
 
 
84 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285013  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0931  hypothetical protein  36.36 
 
 
82 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3469  hypothetical protein  37.97 
 
 
92 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.414098  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7032  hypothetical protein  34.21 
 
 
83 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343078  normal  0.583052 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1612  hypothetical protein  29.11 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00005517  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2178  phosphopantetheine-binding protein  41.27 
 
 
81 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.510535  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1122  phosphopantetheine-binding protein  33.33 
 
 
86 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1094  phosphopantetheine-binding protein  33.33 
 
 
86 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1111  phosphopantetheine-binding protein  33.33 
 
 
86 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1036  phosphopantetheine-binding  32.05 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121028  normal  0.393092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1411  phosphopantetheine-binding protein  32 
 
 
84 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  27.71 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4983  acetyl-CoA synthetase  35.71 
 
 
280 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.793805  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0166  acyl carrier protein  27.5 
 
 
78 aa  46.2  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.317698  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2565  acyl carrier protein  33.33 
 
 
78 aa  46.2  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1741  acyl carrier protein  41.07 
 
 
95 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463216  normal  0.237762 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0253  phosphopantetheine-binding  29.33 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  27.87 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0881  acyl carrier protein  30 
 
 
91 aa  45.1  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.215999  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0219  Acyl carrier protein  30 
 
 
91 aa  45.1  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2371  acyl carrier protein  41.07 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.131392  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31440  acyl carrier protein  32.14 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.820176  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2117  acyl carrier protein  39.29 
 
 
92 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.307838  hitchhiker  0.00250783 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2359  acyl carrier protein  39.29 
 
 
105 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.701799  normal  0.0109662 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4413  phosphopantetheine-binding protein  30.77 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864281  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0621  acyl carrier protein  42.86 
 
 
94 aa  44.3  0.0006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0305053  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  27.87 
 
 
82 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  29.27 
 
 
85 aa  43.9  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0451  Acyl carrier protein  35.85 
 
 
84 aa  43.9  0.0008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2397  acyl carrier protein  33.9 
 
 
84 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.774036  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2029  acyl carrier protein  39.29 
 
 
92 aa  43.5  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0855  acyl carrier protein  39.29 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05704  acyl carrier protein, putative (JCVI)  25 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.922382  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0847  acyl carrier protein  39.29 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2493  acyl carrier protein  26.25 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2666  acyl carrier protein  29.85 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112486  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1320  acyl carrier protein  39.29 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  29.33 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0196  acyl carrier protein  27.5 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1105  hypothetical protein  26.32 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0130  acyl carrier protein  26.25 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0263096  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  27.63 
 
 
78 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1856  phosphopantetheine-binding protein  29.63 
 
 
85 aa  41.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1325  acyl carrier protein  24.05 
 
 
79 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0452  acyl carrier protein  24.69 
 
 
88 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  33.93 
 
 
77 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  28.57 
 
 
77 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1661  acyl carrier protein  27.5 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3647  acyl carrier protein  26.19 
 
 
84 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742845  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03900  acyl carrier protein  32.86 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.486098  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  29.58 
 
 
78 aa  40.8  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1011  acyl carrier protein  28.05 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303772  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0230  acyl carrier protein  31.51 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1263  acyl carrier protein  39.02 
 
 
93 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1160  acyl carrier protein  29.87 
 
 
84 aa  40  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000195346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>