119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0384 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0384  phosphopantetheine-binding  100 
 
 		 83 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0765  phosphopantetheine-binding  67.07 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.321905  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4648  hypothetical protein  68.49 
 
 		 89 aa  103  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3572  hypothetical protein  68.49 
 
 		 89 aa  103  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.141055 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1416  hypothetical protein  57.89 
 
 		 84 aa  92.8  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285013  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0931  hypothetical protein  60.27 
 
 		 82 aa  91.3  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7032  hypothetical protein  59.21 
 
 		 83 aa  90.5  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.343078  normal  0.583052 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2709  phosphopantetheine-binding  43.9 
 
 		 88 aa  90.5  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169236  hitchhiker  0.0000263676 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1094  phosphopantetheine-binding protein  49.38 
 
 		 86 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1111  phosphopantetheine-binding protein  49.38 
 
 		 86 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1122  phosphopantetheine-binding protein  49.38 
 
 		 86 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1411  phosphopantetheine-binding protein  54.17 
 
 		 84 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1612  hypothetical protein  37.97 
 
 		 81 aa  72  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00005517  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2594  phosphopantetheine-binding  46.67 
 
 		 81 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.79488  hitchhiker  0.000628646 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4983  acetyl-CoA synthetase  62.5 
 
 		 280 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.793805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3604  phosphopantetheine-binding protein  36.62 
 
 		 80 aa  60.8  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3287  phosphopantetheine-binding  37.5 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31338 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  27.85 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0507  phosphopantetheine-binding  38.57 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  33.77 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  36.84 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  36.84 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2178  phosphopantetheine-binding protein  34.67 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.510535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12010  acyl carrier protein  31.51 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114572  normal  0.0939277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  36.84 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  36.84 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  36.84 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  27.85 
 
 		 101 aa  51.2  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3483  acyl carrier protein  29.33 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.520778  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3512  acyl carrier protein  27.85 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410127  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  34.43 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  29.17 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0550  hypothetical protein  30.65 
 
 		 82 aa  48.1  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.324262  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0253  phosphopantetheine-binding  40.62 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  29.51 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  27.27 
 
 		 83 aa  47  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  28.77 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4810  acyl carrier protein  26.51 
 
 		 82 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0303207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0561  acyl carrier protein  35.09 
 
 		 77 aa  47  0.00009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0339  acyl carrier protein  30 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  27.87 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  30 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1975  acyl carrier protein  32.69 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.166506  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  27.03 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  27.03 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0349  acyl carrier protein  30 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3677  acyl carrier protein  30 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0913406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1362  acyl carrier protein  32.79 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.915786  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  27.03 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0341  acyl carrier protein  30 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.667101  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0346  acyl carrier protein  30 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0349  acyl carrier protein  30 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0285  acyl carrier protein  35.09 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  32.69 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  27.4 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  30.77 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3380  acyl carrier protein  25.97 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0442067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1496  acyl carrier protein  30.3 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1041  acyl carrier protein  31.58 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000252182  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  30.51 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  32.2 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0468  acyl carrier protein  32.14 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0230  acyl carrier protein  29.82 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0445  acyl carrier protein  27.5 
 
 		 82 aa  44.3  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.377393  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0493  acyl carrier protein  30.36 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  28.57 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3600  acyl carrier protein  32.89 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4413  phosphopantetheine-binding protein  28.99 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4075  acyl carrier protein  32.89 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  28.17 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10270  acyl carrier protein  25 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.167244 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1849  acyl carrier protein  33.96 
 
 		 77 aa  43.9  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000445968  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4369  acyl carrier protein  27.5 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3469  hypothetical protein  35.71 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.414098  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  26.23 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0929  acyl carrier protein  31.58 
 
 		 83 aa  42.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1036  phosphopantetheine-binding  29.49 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.121028  normal  0.393092 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0343  acyl carrier protein  28.75 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.317237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1105  hypothetical protein  27.42 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3062  acyl carrier protein  31.58 
 
 		 83 aa  42.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73924  normal  0.979198 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  29.51 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  28.33 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  32.69 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  28.21 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  26.23 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  26.32 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1836  acyl carrier protein  27.12 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000576824  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1325  acyl carrier protein  28.81 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00792  acyl carrier protein  29.73 
 
 		 81 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  23.33 
 
 		 82 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0876  acyl carrier protein  30 
 
 		 84 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5387  acyl carrier protein  30 
 
 		 78 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1160  acyl carrier protein  31.58 
 
 		 84 aa  42  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000195346  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3622  acyl carrier protein  24.68 
 
 		 79 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000545579 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4861  phosphopantetheine-binding  31.51 
 
 		 85 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.830038  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0452  acyl carrier protein  27.27 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  26.03 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3512  acyl carrier protein  29.03 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.126809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0692  acyl carrier protein  31.08 
 
 		 85 aa  41.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0950683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  27.12 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>