274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0929 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3062  acyl carrier protein  100 
 
 
83 aa  164  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73924  normal  0.979198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0929  acyl carrier protein  100 
 
 
83 aa  164  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0692  acyl carrier protein  92.77 
 
 
85 aa  153  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0950683  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00792  acyl carrier protein  90.12 
 
 
81 aa  148  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4763  acyl carrier protein  90.12 
 
 
81 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065062  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3686  acyl carrier protein  90.12 
 
 
81 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.630716 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3600  acyl carrier protein  88.75 
 
 
82 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4075  acyl carrier protein  88.75 
 
 
82 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0339  acyl carrier protein  61.33 
 
 
82 aa  99.4  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4597  acyl carrier protein  60.26 
 
 
80 aa  98.6  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000178054 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0349  acyl carrier protein  60 
 
 
82 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0346  acyl carrier protein  60 
 
 
82 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0341  acyl carrier protein  60 
 
 
82 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.667101  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3380  acyl carrier protein  57.33 
 
 
82 aa  97.4  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0445  acyl carrier protein  58.67 
 
 
82 aa  97.1  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.377393  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3889  acyl carrier protein  58.97 
 
 
82 aa  95.9  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0324  acyl carrier protein  61.04 
 
 
82 aa  95.9  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657258 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0349  acyl carrier protein  56 
 
 
82 aa  94.7  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3677  acyl carrier protein  56 
 
 
82 aa  94.7  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0913406  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4369  acyl carrier protein  56 
 
 
82 aa  94.7  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0351  acyl carrier protein  57.14 
 
 
82 aa  93.2  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3922  acyl carrier protein  50.6 
 
 
85 aa  92  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3512  acyl carrier protein  54.67 
 
 
82 aa  92  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.126809  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0343  acyl carrier protein  54.67 
 
 
82 aa  92  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.317237  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3887  acyl carrier protein  55 
 
 
93 aa  89.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4801  acyl carrier protein  52.5 
 
 
83 aa  88.2  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3876  phosphopantetheine-binding  50 
 
 
82 aa  88.2  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0891  acyl carrier protein  48.19 
 
 
83 aa  85.5  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.515732  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2102  acyl carrier protein  50.63 
 
 
83 aa  85.1  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.493775  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004065  acyl carrier protein  48.1 
 
 
85 aa  84.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4379  acyl-carrier-protein  46.84 
 
 
85 aa  82.8  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00582273  normal  0.0972461 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4570  acyl carrier protein  50.63 
 
 
82 aa  82.8  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0436  acyl carrier protein  56 
 
 
84 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5094  acyl carrier protein, putative  54.55 
 
 
86 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0908  phosphopantetheine-binding protein  46.84 
 
 
88 aa  73.6  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0438  acyl carrier protein  48 
 
 
84 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2174  putative diguanylate cyclase  42.67 
 
 
81 aa  70.5  0.000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.377661  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0112  acyl carrier protein  41.03 
 
 
82 aa  70.1  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0969  acyl carrier protein  36.59 
 
 
84 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000264763  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  36.36 
 
 
99 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  36.36 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  36.36 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  36.36 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  36.36 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  35.44 
 
 
101 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  38.36 
 
 
77 aa  55.1  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  37.04 
 
 
87 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1489  phosphopantetheine-binding  53.75 
 
 
83 aa  54.3  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  38.33 
 
 
115 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  32.89 
 
 
82 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  31.65 
 
 
81 aa  53.9  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  35.62 
 
 
78 aa  53.9  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  31.65 
 
 
81 aa  53.9  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  36.11 
 
 
77 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  37.5 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1996  hypothetical protein  36.25 
 
 
88 aa  53.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889305  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0944  acyl carrier protein  35.44 
 
 
79 aa  52.8  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000174331  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3483  acyl carrier protein  31.58 
 
 
82 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.520778  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  32.47 
 
 
101 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7056  acyl carrier protein  36.36 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12010  acyl carrier protein  35.53 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114572  normal  0.0939277 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  35.53 
 
 
80 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3647  acyl carrier protein  33.33 
 
 
84 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742845  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  35.53 
 
 
80 aa  51.6  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  35.53 
 
 
80 aa  52  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0752  acyl carrier protein  35.82 
 
 
79 aa  51.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103187  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  36.99 
 
 
75 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1856  phosphopantetheine-binding protein  32 
 
 
85 aa  51.6  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  35.53 
 
 
80 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  36.84 
 
 
103 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3132  acyl carrier protein  35.62 
 
 
78 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0975  acyl carrier protein  32.05 
 
 
80 aa  50.8  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.553759  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1975  acyl carrier protein  36 
 
 
79 aa  50.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.166506  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  35.62 
 
 
78 aa  50.4  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0550  hypothetical protein  32.93 
 
 
82 aa  50.1  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.324262  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  34.25 
 
 
78 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  34.25 
 
 
78 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  33.33 
 
 
84 aa  50.4  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  34.25 
 
 
78 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  34.67 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1687  acyl carrier protein  37.31 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2978  acyl carrier protein  37.31 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.702686  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2352  acyl carrier protein  37.31 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  37.33 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3819  acyl carrier protein  37.31 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542696  normal  0.0672791 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3483  acyl carrier protein  37.31 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.057924  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  32.1 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  33.33 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3892  acyl carrier protein  35.53 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3701  acyl carrier protein  35.53 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3591  acyl carrier protein  35.53 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3609  acyl carrier protein  35.53 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  36.49 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3988  acyl carrier protein  35.53 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.168963  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2502  acyl carrier protein  35.53 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000438987  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1633  acyl carrier protein  32.53 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3673  acyl carrier protein  35.53 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3864  acyl carrier protein  35.53 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3997e-48 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  34.72 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  32.1 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>