More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3819 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2352  acyl carrier protein  100 
 
 		 79 aa  155  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3819  acyl carrier protein  100 
 
 		 79 aa  155  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542696  normal  0.0672791 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3483  acyl carrier protein  98.73 
 
 		 79 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.057924  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1687  acyl carrier protein  98.73 
 
 		 79 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2978  acyl carrier protein  98.73 
 
 		 79 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.702686  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2468  acyl carrier protein  98.73 
 
 		 79 aa  153  7e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2301  acyl carrier protein  98.73 
 
 		 79 aa  153  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0385608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3132  acyl carrier protein  88.31 
 
 		 78 aa  135  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  84.81 
 
 		 79 aa  133  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  84.42 
 
 		 78 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  84.42 
 
 		 78 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  84.42 
 
 		 78 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  84.42 
 
 		 78 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  84.42 
 
 		 78 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1530  acyl carrier protein  82.67 
 
 		 78 aa  125  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129893  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0894  acyl carrier protein  81.33 
 
 		 79 aa  124  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0694526 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1058  acyl carrier protein  81.33 
 
 		 78 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1201  acyl carrier protein  81.33 
 
 		 78 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.576937  hitchhiker  0.00368899 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  82.67 
 
 		 78 aa  124  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  82.67 
 
 		 78 aa  123  7e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0417  acyl carrier protein  80.52 
 
 		 77 aa  123  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  82.67 
 
 		 78 aa  123  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  82.67 
 
 		 78 aa  123  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0746  acyl carrier protein  81.33 
 
 		 78 aa  123  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.746533  normal  0.50277 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  81.82 
 
 		 77 aa  123  9e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  81.82 
 
 		 77 aa  123  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  81.82 
 
 		 77 aa  123  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3358  acyl carrier protein  78.48 
 
 		 79 aa  123  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.304425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0498  acyl carrier protein  81.33 
 
 		 78 aa  122  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2298  acyl carrier protein  78.67 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1627  acyl carrier protein  83.56 
 
 		 77 aa  120  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0810267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2181  acyl carrier protein  82.19 
 
 		 77 aa  119  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  81.08 
 
 		 77 aa  119  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  80.82 
 
 		 77 aa  118  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  77.63 
 
 		 78 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  75 
 
 		 78 aa  113  7.999999999999999e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  75 
 
 		 78 aa  110  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2519  acyl carrier protein  76.71 
 
 		 79 aa  110  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1216  acyl carrier protein  78.08 
 
 		 78 aa  110  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.686684 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  73.68 
 
 		 79 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  73.68 
 
 		 79 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1624  acyl carrier protein  69.23 
 
 		 78 aa  107  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000729948  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1588  acyl carrier protein  69.23 
 
 		 78 aa  107  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000112562  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0713  acyl carrier protein  71.05 
 
 		 78 aa  106  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000031745  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1873  acyl carrier protein  67.11 
 
 		 78 aa  106  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2502  acyl carrier protein  67.95 
 
 		 78 aa  104  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000398484  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2807  acyl carrier protein  67.95 
 
 		 78 aa  104  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000875833  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02710  acyl carrier protein  65.82 
 
 		 79 aa  101  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.312215  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  67.09 
 
 		 79 aa  100  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0873  acyl carrier protein  65.82 
 
 		 79 aa  100  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  63.29 
 
 		 84 aa  99.4  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1580  acyl carrier protein  63.29 
 
 		 84 aa  98.6  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000805484  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  67.11 
 
 		 79 aa  99  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1907  acyl carrier protein  68.49 
 
 		 78 aa  98.2  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000356515  hitchhiker  0.00000541151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4192  acyl carrier protein  64.1 
 
 		 78 aa  97.8  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  0.675617 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1351  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 82 aa  97.4  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1347  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 82 aa  97.4  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  64.1 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1923  acyl carrier protein  68.49 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000792988  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1258  acyl carrier protein  64.1 
 
 		 79 aa  97.1  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 78 aa  96.7  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3914  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 78 aa  96.7  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 78 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2043  acyl carrier protein  65.79 
 
 		 77 aa  96.3  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000099502  decreased coverage  0.00468408 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1398  acyl carrier protein  60.26 
 
 		 78 aa  96.3  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  67.11 
 
 		 77 aa  96.7  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1717  acyl carrier protein  67.11 
 
 		 77 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515668  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  67.11 
 
 		 77 aa  95.5  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2572  acyl carrier protein  67.11 
 
 		 77 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000656295  hitchhiker  0.00274043 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2133  acyl carrier protein  67.11 
 
 		 77 aa  95.5  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000639035  normal  0.0269953 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  67.11 
 
 		 77 aa  95.5  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2623  acyl carrier protein  65.79 
 
 		 77 aa  95.9  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188634  unclonable  0.0000000000890491 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  67.11 
 
 		 77 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000614435  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2493  acyl carrier protein  65.79 
 
 		 77 aa  95.9  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155434  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2292  acyl carrier protein  65.79 
 
 		 77 aa  95.9  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000308066  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2395  acyl carrier protein  67.11 
 
 		 77 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000802043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2465  acyl carrier protein  67.11 
 
 		 77 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1500  acyl carrier protein  65.79 
 
 		 77 aa  95.9  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000077006  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1720  acyl carrier protein  67.11 
 
 		 77 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138911  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1604  acyl carrier protein  65.79 
 
 		 77 aa  95.1  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000038664  decreased coverage  0.000139314 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3498  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 78 aa  94.7  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503689  hitchhiker  0.00947262 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1687  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 78 aa  94.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000299329  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1579  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 78 aa  94.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.86341e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0433  acyl carrier protein  64.47 
 
 		 77 aa  94.7  4e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.145071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  65.75 
 
 		 78 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  65.75 
 
 		 78 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2000  acyl carrier protein  64.47 
 
 		 76 aa  94.4  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3831  acyl carrier protein  67.12 
 
 		 78 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  69.01 
 
 		 78 aa  94  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0752  acyl carrier protein  58.97 
 
 		 79 aa  94  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103187  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  64.47 
 
 		 78 aa  94  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  63.01 
 
 		 82 aa  94  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4156  acyl carrier protein  67.12 
 
 		 78 aa  94  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.035668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  63.01 
 
 		 82 aa  94  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0363  acyl carrier protein  58.97 
 
 		 78 aa  93.6  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.878931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5148  acyl carrier protein  63.16 
 
 		 79 aa  93.6  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.166001 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1504  acyl carrier protein  61.54 
 
 		 78 aa  93.6  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0070299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2121  acyl carrier protein  65.75 
 
 		 79 aa  93.6  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000862864  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  61.84 
 
 		 78 aa  93.2  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  63.64 
 
 		 77 aa  93.6  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>