192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3600 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4075  acyl carrier protein  100 
 
 		 82 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3600  acyl carrier protein  100 
 
 		 82 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0692  acyl carrier protein  90 
 
 		 85 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0950683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0929  acyl carrier protein  88.75 
 
 		 83 aa  144  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3062  acyl carrier protein  88.75 
 
 		 83 aa  144  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73924  normal  0.979198 
 
 
-
 
NC_003296  RS00792  acyl carrier protein  86.25 
 
 		 81 aa  141  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3686  acyl carrier protein  83.75 
 
 		 81 aa  134  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.630716 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4763  acyl carrier protein  83.75 
 
 		 81 aa  134  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0339  acyl carrier protein  61.33 
 
 		 82 aa  98.6  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4597  acyl carrier protein  61.33 
 
 		 80 aa  98.2  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178054 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0349  acyl carrier protein  60 
 
 		 82 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0346  acyl carrier protein  60 
 
 		 82 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0341  acyl carrier protein  60 
 
 		 82 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.667101  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0445  acyl carrier protein  58.67 
 
 		 82 aa  95.5  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.377393  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0324  acyl carrier protein  62.16 
 
 		 82 aa  95.5  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657258 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3889  acyl carrier protein  60 
 
 		 82 aa  95.5  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0349  acyl carrier protein  56 
 
 		 82 aa  93.6  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3677  acyl carrier protein  56 
 
 		 82 aa  93.6  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0913406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3380  acyl carrier protein  56 
 
 		 82 aa  93.6  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4369  acyl carrier protein  56 
 
 		 82 aa  93.6  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3512  acyl carrier protein  53.25 
 
 		 82 aa  92.8  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.126809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0343  acyl carrier protein  54.67 
 
 		 82 aa  90.5  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.317237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0351  acyl carrier protein  56 
 
 		 82 aa  89  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3922  acyl carrier protein  50.63 
 
 		 85 aa  88.2  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4801  acyl carrier protein  51.81 
 
 		 83 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3876  phosphopantetheine-binding  47.44 
 
 		 82 aa  87.8  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0891  acyl carrier protein  53.16 
 
 		 83 aa  84.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.515732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3887  acyl carrier protein  52.5 
 
 		 93 aa  83.6  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2102  acyl carrier protein  52.44 
 
 		 83 aa  82.8  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.493775  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004065  acyl carrier protein  47.06 
 
 		 85 aa  80.5  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0436  acyl carrier protein  53.09 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5094  acyl carrier protein, putative  51.85 
 
 		 86 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4379  acyl-carrier-protein  43.04 
 
 		 85 aa  77  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00582273  normal  0.0972461 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4570  acyl carrier protein  46.84 
 
 		 82 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0438  acyl carrier protein  47.44 
 
 		 84 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0112  acyl carrier protein  41.46 
 
 		 82 aa  70.9  0.000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2174  putative diguanylate cyclase  40 
 
 		 81 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.377661  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0908  phosphopantetheine-binding protein  41.77 
 
 		 88 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0969  acyl carrier protein  38.67 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000264763  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  37.66 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  37.66 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  37.66 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  37.66 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  37.66 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1489  phosphopantetheine-binding  51.22 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  35.06 
 
 		 101 aa  57  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  38.33 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1996  hypothetical protein  35 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  32.47 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  35.62 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  32.43 
 
 		 78 aa  51.2  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  35.62 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  30.26 
 
 		 82 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  35.9 
 
 		 87 aa  50.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3483  acyl carrier protein  28.95 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.520778  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  27.63 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7056  acyl carrier protein  35.53 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  27.63 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0752  acyl carrier protein  32.43 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103187  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12010  acyl carrier protein  32.89 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114572  normal  0.0939277 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  31.94 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1856  phosphopantetheine-binding protein  32.84 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0944  acyl carrier protein  31.65 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000174331  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  34.78 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2207  acyl carrier protein  34.72 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000161202 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5351  acyl carrier protein  34.29 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  34.72 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0975  acyl carrier protein  29.49 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.553759  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3132  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 80 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 80 aa  47.8  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  30.67 
 
 		 85 aa  47.4  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 80 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  31.58 
 
 		 84 aa  47.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  33.33 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23640  phosphopantetheine-containing protein  34.72 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.309349 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2352  acyl carrier protein  34.33 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  31.94 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3819  acyl carrier protein  34.33 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542696  normal  0.0672791 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4861  phosphopantetheine-binding  33.77 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.830038  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1975  acyl carrier protein  32 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.166506  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1687  acyl carrier protein  34.33 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2468  acyl carrier protein  34.33 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2301  acyl carrier protein  34.33 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0385608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2978  acyl carrier protein  34.33 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.702686  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2039  acyl carrier protein  28.57 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0051261  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0876  acyl carrier protein  35.29 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3483  acyl carrier protein  34.33 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.057924  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  31.51 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4159  phosphopantetheine-binding protein  40.91 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.840095  normal  0.670614 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  30.43 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0550  hypothetical protein  34.29 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.324262  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  34.67 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  31.17 
 
 		 81 aa  45.1  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2468  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000407512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>