69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004065 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004065  acyl carrier protein  100 
 
 		 85 aa  165  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2102  acyl carrier protein  80.72 
 
 		 83 aa  127  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.493775  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4801  acyl carrier protein  63.64 
 
 		 83 aa  100  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3889  acyl carrier protein  61.25 
 
 		 82 aa  99.4  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0891  acyl carrier protein  60 
 
 		 83 aa  99.4  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.515732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4597  acyl carrier protein  62.82 
 
 		 80 aa  98.2  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178054 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3512  acyl carrier protein  61.25 
 
 		 82 aa  98.2  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.126809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0324  acyl carrier protein  62.03 
 
 		 82 aa  97.4  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657258 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3887  acyl carrier protein  58.23 
 
 		 93 aa  97.1  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0351  acyl carrier protein  58.23 
 
 		 82 aa  95.9  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0343  acyl carrier protein  58.75 
 
 		 82 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.317237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0349  acyl carrier protein  58.75 
 
 		 82 aa  93.6  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3677  acyl carrier protein  58.75 
 
 		 82 aa  93.6  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0913406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3380  acyl carrier protein  60.76 
 
 		 82 aa  93.6  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4369  acyl carrier protein  58.75 
 
 		 82 aa  93.6  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4570  acyl carrier protein  52.44 
 
 		 82 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3876  phosphopantetheine-binding  58.54 
 
 		 82 aa  92.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0445  acyl carrier protein  55.7 
 
 		 82 aa  92.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.377393  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0339  acyl carrier protein  56.96 
 
 		 82 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0346  acyl carrier protein  56.96 
 
 		 82 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0349  acyl carrier protein  56.96 
 
 		 82 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0341  acyl carrier protein  56.96 
 
 		 82 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.667101  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0438  acyl carrier protein  53.09 
 
 		 84 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_003296  RS00792  acyl carrier protein  49.37 
 
 		 81 aa  87.4  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5094  acyl carrier protein, putative  53.85 
 
 		 86 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3062  acyl carrier protein  48.1 
 
 		 83 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73924  normal  0.979198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0929  acyl carrier protein  48.1 
 
 		 83 aa  84.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4763  acyl carrier protein  51.22 
 
 		 81 aa  83.6  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3686  acyl carrier protein  51.22 
 
 		 81 aa  83.6  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.630716 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0436  acyl carrier protein  51.28 
 
 		 84 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0692  acyl carrier protein  48.1 
 
 		 85 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0950683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4075  acyl carrier protein  47.06 
 
 		 82 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3600  acyl carrier protein  47.06 
 
 		 82 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3922  acyl carrier protein  46.91 
 
 		 85 aa  79  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2174  putative diguanylate cyclase  43.84 
 
 		 81 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.377661  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4379  acyl-carrier-protein  44.3 
 
 		 85 aa  72.8  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00582273  normal  0.0972461 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0969  acyl carrier protein  41.56 
 
 		 84 aa  72  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000264763  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0112  acyl carrier protein  52.24 
 
 		 82 aa  71.6  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1489  phosphopantetheine-binding  51.22 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1856  phosphopantetheine-binding protein  40.58 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1011  acyl carrier protein  34.18 
 
 		 85 aa  51.2  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303772  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0883  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242851  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1160  acyl carrier protein  33.75 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000195346  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0908  phosphopantetheine-binding protein  39.47 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1537  phosphopantetheine-binding  32.5 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.157391  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1105  hypothetical protein  37.88 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  30.77 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  30.77 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0550  hypothetical protein  34.29 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.324262  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03900  acyl carrier protein  37.33 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.486098  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  35.29 
 
 		 74 aa  44.7  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  35.14 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  35.14 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  35.14 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  31.58 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0230  acyl carrier protein  32.89 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  31.43 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0944  acyl carrier protein  32.43 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000174331  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1689  phosphopantetheine-binding protein  37.8 
 
 		 85 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.932601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0561  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  34.29 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0310  acyl carrier protein  28.57 
 
 		 76 aa  41.2  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00336649  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0779  phosphopantetheine-binding protein  25 
 
 		 76 aa  41.2  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3122  phosphopantetheine-binding protein  29.51 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.172953  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  23.38 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0225  acyl carrier protein  31.58 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.623939  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2419  phosphopantetheine-binding  33.75 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  29.63 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2083  acyl carrier protein  35.21 
 
 		 76 aa  40  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000417197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>