53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2419 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2419  phosphopantetheine-binding  100 
 
 
88 aa  175  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0310  acyl carrier protein  42.31 
 
 
76 aa  48.9  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00336649  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  33.33 
 
 
81 aa  48.9  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  33.33 
 
 
81 aa  48.9  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1537  phosphopantetheine-binding  34.18 
 
 
84 aa  44.3  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.157391  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0883  acyl carrier protein  30.86 
 
 
82 aa  43.9  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242851  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  33.33 
 
 
80 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf292  acyl carrier protein, putative  31.34 
 
 
73 aa  43.5  0.0009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.051043  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0773  phosphopantetheine-binding  31.03 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.149399  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  34.78 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2039  acyl carrier protein  33.33 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0051261  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0876  acyl carrier protein  28.57 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10270  acyl carrier protein  29.73 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.167244 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  33.33 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  33.33 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2509  phosphopantetheine-binding  31.15 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  46.67 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  30.95 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18011  acyl carrier protein  34.78 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1634  phosphopantetheine-binding  34.92 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1160  acyl carrier protein  40.38 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000195346  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  32.05 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  32.05 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18181  acyl carrier protein  34.78 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4146  hypothetical protein  35.14 
 
 
86 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.456338  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1602  acyl carrier protein  45.45 
 
 
77 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000714682  normal  0.960802 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1610  Acyl carrier protein (ACP)  32.84 
 
 
90 aa  42  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17331  acyl carrier protein (ACP)  30.77 
 
 
80 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  32.89 
 
 
82 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  31.08 
 
 
101 aa  41.6  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  32.05 
 
 
103 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0750  phosphopantetheine-binding  31.03 
 
 
93 aa  41.6  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0676066  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  30.67 
 
 
85 aa  41.2  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  41.3 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3105  acyl carrier protein  45.24 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000128081  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3012  hypothetical protein  36 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00836146  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1157  acyl carrier protein  45.24 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.917954 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004065  acyl carrier protein  33.75 
 
 
85 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0493  acyl carrier protein  31.34 
 
 
77 aa  40.8  0.007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  35.85 
 
 
74 aa  40.4  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1496  acyl carrier protein  29.85 
 
 
77 aa  40.8  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  43.18 
 
 
77 aa  40.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  43.18 
 
 
77 aa  40.8  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0944  acyl carrier protein  29.11 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000174331  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10032  acyl carrier protein acpA  38.6 
 
 
87 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.168088  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  32.86 
 
 
74 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3512  acyl carrier protein  29.41 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410127  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1362  acyl carrier protein  31.34 
 
 
77 aa  40.4  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.915786  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  32.05 
 
 
80 aa  40.4  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2565  acyl carrier protein  33.33 
 
 
78 aa  40.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  43.18 
 
 
77 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0048  acyl carrier protein  28.4 
 
 
81 aa  40  0.01  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.858481  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  45.24 
 
 
81 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>