251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0773 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0773  phosphopantetheine-binding  100 
 
 
93 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.149399  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0750  phosphopantetheine-binding  94.62 
 
 
93 aa  164  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0676066  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0883  acyl carrier protein  48.15 
 
 
82 aa  70.1  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242851  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0310  acyl carrier protein  45.21 
 
 
76 aa  64.3  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00336649  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1537  phosphopantetheine-binding  40.51 
 
 
84 aa  61.2  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.157391  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  44.78 
 
 
74 aa  61.6  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  41.56 
 
 
81 aa  55.5  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  41.56 
 
 
81 aa  55.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  46.27 
 
 
77 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  47.76 
 
 
77 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  40 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  41.79 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0452  acyl carrier protein  39.19 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3460  acyl carrier protein  39.73 
 
 
81 aa  51.6  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000712705 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3105  acyl carrier protein  43.75 
 
 
77 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000128081  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1157  acyl carrier protein  43.75 
 
 
77 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.917954 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  40 
 
 
73 aa  51.2  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1873  acyl carrier protein  44.12 
 
 
78 aa  50.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107725  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1602  acyl carrier protein  43.75 
 
 
77 aa  50.1  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000714682  normal  0.960802 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  43.28 
 
 
78 aa  50.4  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  44.44 
 
 
78 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1416  acyl carrier protein  41.79 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.28944  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  42.19 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1644  acyl carrier protein  42.65 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.28963  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0166  acyl carrier protein  38.57 
 
 
78 aa  49.7  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.317698  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0522  acyl carrier protein  36.92 
 
 
78 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000162549  hitchhiker  0.00260243 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  47.37 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1504  acyl carrier protein  43.28 
 
 
78 aa  48.9  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0070299  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0517  acyl carrier protein  36.92 
 
 
78 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000044528  decreased coverage  0.00212296 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  36 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1587  acyl carrier protein  42.65 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281743  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1878  acyl carrier protein  43.75 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0843624  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  38.03 
 
 
79 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  41.79 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1935  acyl carrier protein  42.19 
 
 
77 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000441044  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1090  acyl carrier protein  44.44 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.343466  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1852  acyl carrier protein  42.86 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  39.71 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0918  acyl carrier protein  40.91 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.150298  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0983  acyl carrier protein  40.91 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415355  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2493  acyl carrier protein  38.57 
 
 
78 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  41.89 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  41.89 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0130  acyl carrier protein  38.57 
 
 
78 aa  47.4  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0263096  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  40.91 
 
 
79 aa  47.8  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  40.91 
 
 
79 aa  47.8  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3071  acyl carrier protein  40.91 
 
 
79 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  40.91 
 
 
79 aa  47.8  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  40.91 
 
 
79 aa  47.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2430  acyl carrier protein  41.43 
 
 
76 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000123335  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1733  acyl carrier protein  40.91 
 
 
79 aa  47.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.9219  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1610  Acyl carrier protein (ACP)  36.25 
 
 
90 aa  47  0.00008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4159  phosphopantetheine-binding protein  34.38 
 
 
81 aa  47  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.840095  normal  0.670614 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2262  acyl carrier protein  42.62 
 
 
79 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033873  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3646  acyl carrier protein  40.91 
 
 
79 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2427  acyl carrier protein  42.62 
 
 
79 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0436  acyl carrier protein  38.81 
 
 
76 aa  47  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.20002  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  42.62 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  42.62 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09300  acyl carrier protein  32.88 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421361  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1053  acyl carrier protein  42.62 
 
 
79 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  34.18 
 
 
83 aa  46.2  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3831  acyl carrier protein  44.44 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  42.62 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1648  acyl carrier protein  44.44 
 
 
80 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00355954  normal  0.46932 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  42.62 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4156  acyl carrier protein  44.44 
 
 
78 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.035668  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  38.81 
 
 
77 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  42.62 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  42.62 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  43.08 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  42.62 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  42.62 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  42.62 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  42.62 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  40.3 
 
 
79 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2565  acyl carrier protein  41.43 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  42.62 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  42.62 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  42.62 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1866  acyl carrier protein  40.62 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00815396  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  42.62 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3249  acyl carrier protein  40.91 
 
 
79 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.124771  normal  0.0273605 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  42.65 
 
 
79 aa  47  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  42.62 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  42.62 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  42.62 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  42.62 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3358  acyl carrier protein  44.44 
 
 
79 aa  46.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.304425  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  42.86 
 
 
78 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1548  Acyl carrier protein (ACP)  35.82 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.079585  normal  0.066745 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  40.62 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  32.89 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  39.68 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  39.06 
 
 
75 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  43.33 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0196  acyl carrier protein  37.14 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  42.86 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25670  acyl carrier protein  40.62 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000226432  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2195  acyl carrier protein  40.62 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>