116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03900 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_03900  acyl carrier protein  100 
 
 
80 aa  154  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.486098  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1105  hypothetical protein  65.82 
 
 
84 aa  101  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1856  phosphopantetheine-binding protein  51.9 
 
 
85 aa  86.3  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1996  hypothetical protein  48.1 
 
 
88 aa  78.2  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889305  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0550  hypothetical protein  47.5 
 
 
82 aa  76.3  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.324262  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0349  acyl carrier protein  43.24 
 
 
82 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3677  acyl carrier protein  43.24 
 
 
82 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0913406  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3512  acyl carrier protein  43.24 
 
 
82 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.126809  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4597  acyl carrier protein  41.33 
 
 
80 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000178054 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0908  phosphopantetheine-binding protein  42.11 
 
 
88 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0445  acyl carrier protein  41.89 
 
 
82 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.377393  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4369  acyl carrier protein  43.24 
 
 
82 aa  58.2  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0339  acyl carrier protein  40.54 
 
 
82 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0341  acyl carrier protein  40.54 
 
 
82 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.667101  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0346  acyl carrier protein  40.54 
 
 
82 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0349  acyl carrier protein  40.54 
 
 
82 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0343  acyl carrier protein  41.89 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.317237  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4570  acyl carrier protein  38.16 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1011  acyl carrier protein  36.25 
 
 
85 aa  55.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303772  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3889  acyl carrier protein  40 
 
 
82 aa  55.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3922  acyl carrier protein  37.66 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4801  acyl carrier protein  37.18 
 
 
83 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0891  acyl carrier protein  41.33 
 
 
83 aa  53.9  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.515732  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0324  acyl carrier protein  38.67 
 
 
82 aa  53.5  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657258 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3380  acyl carrier protein  39.19 
 
 
82 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  38.16 
 
 
78 aa  52  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  28 
 
 
81 aa  51.2  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3887  acyl carrier protein  37.18 
 
 
93 aa  50.4  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0351  acyl carrier protein  40.54 
 
 
82 aa  50.1  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0112  acyl carrier protein  35.06 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0452  acyl carrier protein  31.25 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  36.49 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  32.05 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2102  acyl carrier protein  42.65 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.493775  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3876  phosphopantetheine-binding  38.36 
 
 
82 aa  48.1  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0969  acyl carrier protein  33.33 
 
 
84 aa  48.9  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000264763  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  35.44 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  35.44 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2174  putative diguanylate cyclase  32.05 
 
 
81 aa  47.8  0.00006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.377661  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0984  acyl carrier protein  27.5 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156105  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0310  acyl carrier protein  31.51 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00336649  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0436  acyl carrier protein  30.38 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  29.49 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  29.49 
 
 
80 aa  45.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0538  acyl carrier protein  40 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.633941  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0616  acyl carrier protein  33.8 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000175358  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3256  acyl carrier protein  27.5 
 
 
82 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.929714  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0944  acyl carrier protein  31.65 
 
 
79 aa  45.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000174331  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1615  acyl carrier protein  31.51 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00792  acyl carrier protein  28.95 
 
 
81 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3647  acyl carrier protein  30 
 
 
84 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742845  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0284  acyl carrier protein  27.63 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6611  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  32.88 
 
 
78 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5094  acyl carrier protein, putative  31.65 
 
 
86 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004065  acyl carrier protein  37.33 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0929  acyl carrier protein  27.63 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3062  acyl carrier protein  27.63 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73924  normal  0.979198 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1852  acyl carrier protein  30.99 
 
 
76 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  32.43 
 
 
79 aa  44.3  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  31.51 
 
 
77 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3099  acyl carrier protein  29.58 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179771 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0773  acyl carrier protein  37.7 
 
 
85 aa  43.9  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.250826  hitchhiker  0.0000000000344115 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  32.39 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  28.21 
 
 
80 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4413  phosphopantetheine-binding protein  34.92 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.864281  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  28.21 
 
 
80 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  29.17 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4067  acyl carrier protein  32 
 
 
82 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2430  acyl carrier protein  30.99 
 
 
76 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000123335  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  35.71 
 
 
79 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  35.71 
 
 
79 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  35.71 
 
 
79 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2493  acyl carrier protein  32.05 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1160  acyl carrier protein  35.62 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000195346  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1361  acyl carrier protein  33.33 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000207547  normal  0.0506091 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  29.11 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0438  acyl carrier protein  30.38 
 
 
84 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  28.75 
 
 
82 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  33.82 
 
 
81 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  34.78 
 
 
78 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  29.58 
 
 
76 aa  41.6  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3600  acyl carrier protein  28.57 
 
 
82 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  26.92 
 
 
103 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4075  acyl carrier protein  28.57 
 
 
82 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0166  acyl carrier protein  29.49 
 
 
78 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.317698  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  23.75 
 
 
83 aa  41.2  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  27.85 
 
 
80 aa  41.2  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1320  acyl carrier protein  37.29 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1515  phosphopantetheine-binding  33.33 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.159664  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0990  acyl carrier protein  30 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.567267  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1537  phosphopantetheine-binding  25 
 
 
84 aa  41.6  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.157391  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0692  acyl carrier protein  27.63 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0950683  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  28.77 
 
 
77 aa  41.2  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0855  acyl carrier protein  37.29 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  34.29 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0847  acyl carrier protein  37.29 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3287  phosphopantetheine-binding  32.86 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.31338 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3914  acyl carrier protein  28.38 
 
 
78 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1058  acyl carrier protein  34.72 
 
 
78 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1201  acyl carrier protein  34.72 
 
 
78 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.576937  hitchhiker  0.00368899 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>